睾丸表达基因 10; TEX10

HGNC 批准的基因符号:TEX10

细胞遗传学位置:9q31.1 基因组坐标 (GRCh38):9:100,302,083-100,352,941(来自 NCBI)

▼ 说明

TEX10 是 SENP3 (612844) 相关复合物的一个亚基,该复合物包括 PELP1 (609455) 和 WDR18,并参与大核糖体亚基的成熟和核仁释放 (Finkbeiner et al., 2011)。TEX10 还在胚胎干细胞 (ESC) 自我更新和多能性、早期胚胎发育以及通过超级增强子活性的表观遗传调控的体细胞重编程中发挥着关键作用 (Ding et al., 2015)。

▼ 克隆与表达

丁等人。(2015) 指出,TEX10 蛋白包含犰狳型折叠、犰狳样螺旋结构和 2 型 HEAT 结构域,该结构域可以作为蛋白质、DNA 和 RNA 结合的界面。

Finkbeiner 等人使用细胞提取物的生化分级分离。(2011) 发现 TEX10 以及 PELP1 和 WDR18 主要位于核质中,亚部分集中在核仁中。

免疫荧光研究表明,Tex10 是一种在小鼠 ESC 中高度表达的核蛋白,尽管 mRNA 表达水平在一些成年小鼠组织(如睾丸、子宫和肺)中也很丰富 (Ding et al., 2015)。

▼ 测绘

Gross (2015) 根据 TEX10 序列 (GenBank BC030652) 与基因组序列 (GRCh38) 的比对,将 TEX10 基因映射到染色体 9q31.1。

▼ 基因功能

Finkbeiner 等人在 HeLa 和 HEK293T 细胞中使用免疫共沉淀和质谱实验。(2011) 表明 TEX10 与 PELP1 和 WDR18 形成复合物,并且该复合物与 SENP3 物理相关。在 PELP、TEX10 和 WDR18 以及相关蛋白 MDN1 (618200) 的 siRNA 敲低实验中,Finkbeiner 等人。(2011) 观察到与对照细胞相比,成熟 28S rRNA 与 32S 前体的比率分别降低至 60%、75%、50% 和 30%,这表明该复合物在核糖体生物发生和 rRNA 物种成熟中发挥作用。HeLa 细胞中这些蛋白质的消耗也会导致核仁增大,因为大核糖体亚基 L27 (RPL27; 607526) 仅在该细胞器内积累,

Ding 等人在小鼠 ESC 中使用亲和纯化和相互作用组分析。(2015) 确定 Tex10 是多能因子 Sox2 的新型结合伴侣 (184429)。基于抗体的免疫沉淀测定证实了这种内源性相互作用。Tex10 敲除细胞的 RNA-seq 分析表明,ESC 中高度富集的 1,869 个基因下调,2,109 个基因上调,表明 Tex10 参与干细胞维持的多能性转录网络。早期小鼠胚胎的单细胞转录分析表明,Tex10 在早期胚胎发育中表达。小鼠 Tex10 与 Sox2 在小鼠囊胚中共定位。通过 siRNA 敲低小鼠受精卵中的 Tex10 导致从桑椹胚到囊胚阶段的胚胎发育减少,表明 Tex10 是小鼠早期发育所需的关键多能性因子。在功能丧失实验中,shRNA 下调 Tex10 导致 ESC 集落大小减小和群体分化,这表明 Tex10 是自我更新和多能性所必需的。Tex10 也是有效体细胞重编程所必需的,因为 Tex10 的缺失会显着降低小鼠胚胎成纤维细胞的传统山中重编程。相反,Tex10 的异位表达增强了重编程,表明 Tex10 在多能性的维持和建立中发挥着关键作用。在人类 ESC 中,TEX10 也被证明对于干细胞的维持至关重要,因为 TEX10 的耗尽会导致编程效率降低。使用 ChIP-seq 识别 Tex10 的基因组靶标,Ding 等人。(2015) 发现 Tex10 峰在转录起始位点富集,并且 Tex10 目标对应于 Sox2 目标。Tex10 峰也在 ESC 超级增强子区域富集,表明 Tex10 正向调节 ESC 的基因表达。在 Tex10 消耗测定中,Ding 等人。(2015) 观察到 Oct4 (164177)、Nanog (607937) 和 Esrrb (602167) 的超级增强子区域中 H3K27 乙酰化修饰的富集减少,表明 Tex10 通过调节组蛋白乙酰化来调节超级增强子活性。Tex10 还被证明可以与 p300 (602700) 和 Tet1 (607790) 配合来控制组蛋白乙酰化和 DNA 低甲基化。Tex10 峰也在 ESC 超级增强子区域富集,表明 Tex10 正向调节 ESC 的基因表达。在 Tex10 消耗测定中,Ding 等人。(2015) 观察到 Oct4 (164177)、Nanog (607937) 和 Esrrb (602167) 的超级增强子区域中 H3K27 乙酰化修饰的富集减少,表明 Tex10 通过调节组蛋白乙酰化来调节超级增强子活性。Tex10 还被证明可以与 p300 (602700) 和 Tet1 (607790) 配合来控制组蛋白乙酰化和 DNA 低甲基化。Tex10 峰也在 ESC 超级增强子区域富集,表明 Tex10 正向调节 ESC 的基因表达。在 Tex10 消耗测定中,Ding 等人。(2015) 观察到 Oct4 (164177)、Nanog (607937) 和 Esrrb (602167) 的超级增强子区域中 H3K27 乙酰化修饰的富集减少,表明 Tex10 通过调节组蛋白乙酰化来调节超级增强子活性。Tex10 还被证明可以与 p300 (602700) 和 Tet1 (607790) 配合来控制组蛋白乙酰化和 DNA 低甲基化。表明 Tex10 通过调节组蛋白乙酰化来调节超级增强子活性。Tex10 还被证明可以与 p300 (602700) 和 Tet1 (607790) 配合来控制组蛋白乙酰化和 DNA 低甲基化。表明 Tex10 通过调节组蛋白乙酰化来调节超级增强子活性。Tex10 还被证明可以与 p300 (602700) 和 Tet1 (607790) 配合来控制组蛋白乙酰化和 DNA 低甲基化。

▼ 动物模型

丁等人。(2015) 表明敲除小鼠中的 Tex10 是胚胎致死的,可能在 7.5 dpc 之前。

Tags: 9q31.1

业务交流与产品免费发布