T细胞白血病;同位序列 1

高达7%的儿童T细胞急性淋巴细胞白血病(T-ALL)伴随着以10q24为转折点的易位,t(10; 14)(q24; q11)或t(7; 10)(q35; q24)。与10q24区相邻的基因在染色体14q11处的TCRD(见186810)或染色体7q35处的TCRB(见186930)(参见CYTOGENETICS)的附近易位后被转录激活。肯尼迪等(1991)从携带易位t(7; 10)(q35; q24)的T-ALL细胞系克隆了HOX11,该基因与10q24染色体上的断点相邻。推导的342个氨基酸的蛋白质具有一个富含N末端富含甘氨酸和脯氨酸的结构域,然后是一个推定的DNA结合同源异型框结构域。 Northern印迹分析在T细胞系中检测到约2.3 kb的HOX11转录本,在神经母细胞瘤和小细胞肺癌细胞系中低表达。

细胞遗传学位置:10q24.31
基因座标(GRCh38):10:101,130,772-101,137,788

Dear等(1993)发现人HOX11及其在其他物种中的直系同源物在同源域的螺旋3中具有苏氨酸,而不是在其他HOX蛋白中更常见的异亮氨酸或缬氨酸。他们使用免疫荧光显微镜检查发现,被表位标记的人HOX11位于转染的COS细胞中的核内。

罗伯茨等(1994)分离了小鼠Hox11基因组克隆,发现同源域与人HOX11具有完全的氨基酸同一性。

▼基因结构
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肯尼迪等(1991)确定TLX1基因包含至少3个跨越7 kb的编码外显子。选择性剪接可将小内含子引​​入5-prime外显子。

格林等(2007年)确定了TD1基因(612734)161 bp TLX1转录起始位点的头对头方向。 TD1和TLX1之间的基因间区域在小鼠和人之间是高度保守的,并且包含许多GC框和位于CpG岛中的位于中心的CCAAT框。它没有可辨认的TATA框子。报告基因检测表明,该基因间区域对于TD1和TLX1的表达均具有强大的双向启动子活性。

▼对应
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TLX1基因定位于10q24染色体(Kennedy等,1991)。罗伯茨等(1994年)将小鼠Hox11基因定位到小鼠19号染色体内的同音区域。

使用FISH,BAC末端测序和基因组数据库分析,Gough等人(2003)确定染色体10q24上从着丝粒到端粒的选定基因的顺序是CYP2C9(601130),PAX2(167409),HOX11和NFKB2(164012)。

▼基因功能
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Lu等(1991)发现,TCL3的表达在具有t(10; 14)易位的白血病细胞中升高。

亲爱的等(1993)显示人HOX11通过TAATGG靶序列激活报告基因的转录。 HOX11的同源域也绑定了序列TAAC和TAAT,这表明TAAC也可能是HOX11识别序列。

De Keersmaecker等(2010)鉴定了16%的人类T-ALL中的BCL11B(606558)突变和缺失,这与他们在TLX1诱导的T-ALL小鼠模型中的发现一致(参见动物模型)。人T-ALL系的染色质免疫沉淀分析表明TLX1与BCL11B启动子结合。

▼细胞遗传学
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Kagan等(1987)将携带(10; 14)(q24; q11)易位的人类白血病T细胞与小鼠白血病T细胞融合,并检查了杂合体中人类10号和14号染色体的遗传标记。表示已对应到10q23-q25的末端脱氧核苷酸转移酶(TDT; 187410),以及TCR-α的恒定区(TRAC; 186880)。含有人14q染色体的杂种保留了TCR-α的可变成分(请参见615442)。因此,14q11断裂点在可变基因和恒定基因之间的区域中分裂了TCR-α基因座。这些结果表明,白血病过程是由Cα基因座易位到位于10q24断点附近的假定的细胞原癌基因引起的,导致所述癌基因的失控,为此他们提出了TCL3的名称。由于10q +染色体保留了TDT基因,他们得出的结论是TDT基因座靠近TCL3基因,从而确认了10q23-q24带的位置。

祖特等(1990)从CD3阴性T-ALL细胞克隆了t(10; 14)断点。他们确定了在10q24不同于TDT的基因座。该基因座在多种正常或其他肿瘤性T细胞中均无活性,但在t(10; 14)T细胞白血病中可识别到大量2.9-kb RNA。作者推测该基因座是推定的TCL3原癌基因的候选基因。

肯尼迪等(1991)在T-ALL中鉴定了与染色体10q24的断点相邻的HOX11基因。他们表明,HOX11基因的编码能力在携带易位t(7; 10)(q35; q24)的T细胞系中不受干扰。波多野等(1991)也鉴定了在T-ALL的t(10; 14)易位中与10q24的断点相邻的HOX11基因。

Dube等(1991)暗示HOX11基因在反式