4-氨基丁酸氨基转移酶

ABAT 基因编码 γ-氨基丁酸转氨酶( EC 2.6.1.19 ),它催化 γ-氨基丁酸(GABA)(一种重要的中枢神经系统中的主要抑制性神经递质)转化为琥珀酸半醛(Osei 和 Churchich,1995 年) .

▼ 克隆与表达

Osei 和 Churchich(1995)使用来自猪 GABAT cDNA 的探针筛选人脑 cDNA 文库。他们鉴定了一种人类 GABAT cDNA,该 cDNA 编码推断出的 500 个氨基酸的蛋白质,与猪蛋白质的相似度超过 95%。活性酶是与 5-磷酸吡哆醛复合的 50-kD 亚基的同源二聚体。除脑外,GABAT 还存在于多种组织中,并且在肝脏中最为活跃。

▼ 测绘

国际辐射混合绘图联盟将 ABAT 基因对应到染色体 16p13.3( RH69040 )。

▼ 分子遗传学

Jeremiah 和 Povey(1981)提出肝脏和大脑中的 GABAT 受 2 个共显性等位基因控制,在高加索人群中的频率分别为 0.56 和 0.44。杂合子中的 3 条带模式表明 GABAT 是一种二聚体蛋白。巴塔查亚等人(1985)给出了居住在新加坡的华人、印度人和马来人的基因频率,并描述了一个新的等位基因。

Roychoudhury 和 Nei(1988)将等位基因变异的基因频率数据制成表格。

GABA-转氨酶缺乏症

Jaeken 等人报道的一名 GABA 转氨酶缺乏症患者( 613163 )(1984),麦地那-考维等人(1999)鉴定了 ABAT 基因中的错义突变(R220K; 137150.0001 )。患者的第二个等位基因仍未确定。第二名无关患者的 ABAT 基因( 137150.0002 ) 缺失。两名患者都有严重的精神运动迟缓、癫痫发作、肌张力减退和反射亢进,并在 2 岁前死亡。

在一名 28 个月大的日本女性 GABA 转氨酶缺乏症中,Tsuji 等人(2010)鉴定了 ABAT 基因中的复合杂合突变( 137150.0003 - 137150.0004 )。

Nagappa 等人在一名有 GABA-氨基转移酶缺乏症证据的儿童中(2017)鉴定了 ABAT 基因中的复合杂合突变( 137150.0005 - 137150.0006 )。她的父母都是其中一个突变的杂合子,并且在 1000 Genomes Project 数据库中都不存在任何变体。

Koenig 等人对一名 8 岁男孩,由墨西哥血统的近亲所生,患有 GABA-氨基转移酶缺乏症(2017)鉴定了 ABAT 基因中的纯合突变(R377W; 137150.0008 )。每个父母都是杂合的突变,这在 ExAC 数据库中不存在。

▼ 等位基因变体( 8个精选示例):

.0001 GABA-转氨酶缺乏症
ABAT, ARG220LYS
Jaeken 等人报道的一名GABA 转氨酶缺乏症患者( 613163 )(1984),麦地那-考维等人(1999)确定了 ABAT 基因中的 754A-G 转换,导致高度保守残基中的 arg220 到赖氨酸(R220K) 取代。突变体在大肠杆菌中的表达,然后是重组蛋白的分离和酶学表征,揭示了一种酶,其 Vmax 降低到野生型活性的 25%。患者的第二个等位基因仍未确定。辻等人(2010)指出,Jaeken 等人报告的患者中的 R220K 替代(1984)由 c.659G-A 过渡(c.659G-A,NM_000663.3)引起。他们确定了该患者的第二个突变:c.1433T-C 转换,导致 leu478-to-pro(L478P) 取代( 137150.0007 )。

.0002 GABA-转氨酶缺乏症
ABAT,三素数删除
在一名 GABA 转氨酶缺乏症患者( 613163 ) 中,Medina-Kauwe 等人(1999)鉴定了 GABAT 基因的 3 素末端的缺失。

.0003 GABA-转氨酶缺乏症
ABAT, ARG92GLN
在一名 28 个月大的日本女性 GATA 转氨酶缺乏症( 613163 ) 中,Tsuji 等人(2010)鉴定了 ABAT 基因中的复合杂合突变:c.275G-A 转换(c.275G-A, NM_000663.3),导致 arg92 到 gln(R92Q) 取代和外显子缺失(c .199-?_316+?; 137150.0004 )。

.0004 GABA-转氨酶缺乏症
ABAT, c.199-?_316+?
Tsuji 等人讨论了在 GABA 转氨酶缺乏症患者中以复合杂合状态发现的 ABAT 基因中的外显子缺失(c.199-?_316+?, NM000663.3)(2010),见137150.0003。

.0005 GABA-转氨酶缺乏症
ABAT,IVS11AS,AG,-2
Nagappa 等人在儿童中,由非近亲父母所生,有 GABA 转氨酶缺乏症的证据( 613163 )(2017 年)鉴定了 ABAT 基因中的复合杂合突变:内含子 11 中的剪接位点突变(c.862-2A-G)和外显子 16 中的 c.1505T-C 转换,导致 leu502 到 pro( L502P) 替换( 137150.0006 )。每个亲本对于其中一个突变都是杂合的。这些突变是通过对一组涉及各种神经系统疾病的 593 个基因的靶向外显子组测序发现的,并通过 Sanger 测序证实。1000 Genomes Project 数据库中不存在任何突变。

.0006 GABA-转氨酶缺乏症
ABAT、LEU502PRO
为了讨论 ABAT 基因中的 c.1505T-C 转变,导致 leu502 到 pro(L502P) 取代,这是在Nagappa 等人在有 GAGA 转氨酶缺乏( 613163 )证据的儿童中发现的(2017),见137150.0005。

.0007 GABA-转氨酶缺乏症
ABAT、LEU478PRO
讨论 ABAT 基因中的 c.1433T-C 转换(c.1433T-C,NM_000663.3),导致 leu478 到 pro(L478P) 取代,在复合杂合状态的患者中发现Tsuji 等人的GABA 转氨酶缺乏症( 613163 )(2010),见137150.0001。

.0008 GABA-转氨酶缺乏症
ABAT, ARG377TRP
Koenig 等人对一名 8 岁男孩,由墨西哥血统的近亲所生,患有 GABA 转氨酶缺乏症( 613163 )(2017)在 ABAT 基因中发现了一个纯合的 c.1129C-T 转换(c.1129C-T, NM_000663.4),导致 arg377 到 trp(R377W) 取代。每个父母都是杂合的突变,这在 ExAC 数据库中不存在。