免疫球蛋白超家族受体转位相关基因

涉及 1q21-q23 易位断点的染色体异常在 B 细胞非霍奇金淋巴瘤（见 BCL9；602597）和多发性骨髓瘤（MM；见254500）中很常见。通过克隆 FR4 多发性骨髓瘤细胞系中（1;14）（q21;q32）染色体易位的断点，然后进行外显子捕获和筛选脾 cDNA 文库，Hatzivassiliou 等人（2001）获得编码 IRTA1 的 3 种亚型的 cDNAs（ 605876）和 IRTA2 的 4 种亚型。3 种主要的 IRTA2 mRNA 同种型（ITRA2A、ITRA2B 和 ITRA2C）各有其独特的 3 元非翻译区，并且它们编码的蛋白质共享一个共同的氨基酸序列，直到残基 560，包括一个信号肽和 6 个细胞外 Ig 型域。序列分析预测 IRTA2A 是一种 759 个氨基酸的分泌糖蛋白，具有 8 个细胞外 Ig 型结构域，其 C 末端有 13 个独特的、主要是极性的残基。在常见的 560 个氨基酸之后，IRTA2B 只有 32 个额外的残基，其疏水性与其通过 GPI 锚定点与质膜的对接是相容的。977 个氨基酸的 IRTA2C 蛋白与 IRTA2A 共享前 746 个氨基酸。IRTA2C 共有 9 个细胞外 Ig 型结构域，具有 8 个潜在的 N-连接糖基化位点；一个 23 个残基的跨膜区；和一个 104 个残基的胞质结构域和 3 个共有的 SH2 结合结构域，所有这些结构域都表现出 ITIM（基于免疫受体酪氨酸的抑制基序）的特征，并由单独的外显子编码。第四种异构体 IRTA2D 编码 152 个氨基酸的肽。Northern 印迹分析在淋巴结、脾脏、骨髓和小肠中检测到 2.8-、4.4-、5.3-和 0.6-kb 的 IRTA2 转录物，其中 IRTA2A 亚型占优势。原位杂交分析在扁桃体生发中心中心细胞中检测到 IRTA2 表达，但在中心母细胞以及上皮内和滤泡间区域中没有检测到。所有这些都表现出 ITIM（基于免疫受体酪氨酸的抑制基序）的特征，并由单独的外显子编码。第四种异构体 IRTA2D 编码 152 个氨基酸的肽。Northern 印迹分析在淋巴结、脾脏、骨髓和小肠中检测到 2.8-、4.4-、5.3-和 0.6-kb 的 IRTA2 转录物，其中 IRTA2A 亚型占优势。原位杂交分析在扁桃体生发中心中心细胞中检测到 IRTA2 表达，但在中心母细胞以及上皮内和滤泡间区域中没有检测到。所有这些都表现出 ITIM（基于免疫受体酪氨酸的抑制基序）的特征，并由单独的外显子编码。第四种异构体 IRTA2D 编码 152 个氨基酸的肽。Northern 印迹分析在淋巴结、脾脏、骨髓和小肠中检测到 2.8-、4.4-、5.3-和 0.6-kb 的 IRTA2 转录物，其中 IRTA2A 亚型占优势。原位杂交分析在扁桃体生发中心中心细胞中检测到 IRTA2 表达，但在中心母细胞以及上皮内和滤泡间区域中没有检测到。

中山等人（2001）通过对人类 B 细胞系的抗 IgM 交联激活的基因进行代表性差异分析，孤立克隆了 IRTA2，他们称之为 BXMAS1。推导出的 977 个氨基酸蛋白质包含 8 个 ITIM 和 8 个潜在的 N-连接糖基化位点。Northern 印迹分析在激活后 24 至 36 小时内检测到 B 细胞中的 6.7-kb 转录物和 14-和 17-kb 之间的较大转录物。仅在脾脏中检测到表达的组织的Northern印迹分析原位杂交分析表明IRTA2在扁桃体组织的外套区中的表达，但在生发中心细胞中没有。

▼ 基因功能

Hatzivassiliou 等人使用 FISH 和 Northern 印迹分析（2001）确定具有 1q21 异常的伯基特淋巴瘤（BL；参见113970 ）细胞系经常过度表达 IRTA2 基因。然而，在具有正常 1q21 染色体的 BL 细胞系和 BL 衍生的生发中心中心母细胞中，无法检测到 IRTA2 表达。Hatzivassiliou 等人（2001）得出结论，IRTA2 表达在 1q21 染色体畸变的 BL 中经常失调。

正痘病毒 MHC I 类样蛋白（OMCP）以高亲和力结合NK 和 T 细胞上的 NKG2D（KLRK1; 611817）。坎贝尔等人（2010）表明 OMCP 还与缺乏 NKG2D 的人和小鼠单核细胞和 B 细胞结合。使用流式细胞仪分析，他们证明了 OMCP 与小鼠 Fcrl5 的结合，后者在 B 细胞中高度表达。坎贝尔等人（2010）建议 FCRL5 和 B 淋巴细胞参与防御人畜共患痘病毒。

▼ 基因结构

中山等人（2001）确定 IRTA2 基因包含 16 个外显子，跨越 58 kb。

▼ 测绘

通过基因组序列分析，Hatzivassiliou 等人（2001）确定 IRTA1 和 IRTA2 基因在染色体 1q21 上相距 21 kb，并且以相同的方向转录。此外，IRTA1 和 IRTA2 基因在 1q21 上与其他 IRTA 相关基因（IRTA3、IRTA4 和 IRTA5）形成重叠群，并且与 MUC1 基因（ 158340 ）位于端粒，与 FCGR2B 基因（ 604590 ）位于着丝粒。