NOP58 核糖核蛋白; NOP58

  • NOP58,酿酒酵母,同系物

    • NOP5

HGNC 批准的基因符号:NOP58

细胞遗传学位置:2q33.1 基因组坐标(GRCh38):2:202,265,762-202,303,660(来自 NCBI)

▼ 说明

据预测,NOP58 在核糖体 RNA 的成熟中发挥作用(Nelson 等人,2000)。

▼ 克隆与表达

Lyman 等人使用大鼠肝脏 Nop58 查询 EST 数据库,然后对 HeLa 细胞 cDNA 文库进行 3-prime 和 5-prime RACE(1999)克隆了NOP58。 推导的 529 个氨基酸蛋白质的计算分子量为 59.6 kD,与其在小鼠、大鼠、线虫、酵母和植物中的直系同源物具有显着的同一性。 HeLa 细胞的共聚焦免疫荧光显微镜检测到强 NOP58 染色,该染色与原纤维蛋白(FBL; 134795) 阳性核仁部分重叠,而在其他核灶中表达较弱。 通过 SDS-PAGE 检测,NOP58 的表观分子量为 66 kD。

Nelson 等人使用鼠 Nop5 筛选人 M426 成纤维细胞 cDNA 文库(2000)克隆了 NOP58,他们称之为 NOP5。 NOP5 具有进化上保守的高电荷 C 端结构域和几个潜在的蛋白激酶磷酸化位点。 Northern 印迹分析检测到,在所有 12 个受检查的人体组织中,大约 2.2 kb NOP5 转录物的表达存在差异,其中在骨骼肌、心脏、肝脏和肾脏中表达最高,在脾脏、胸腺和结肠中表达最低。 在所有检查的人类细胞系中均检测到 NOP5。 通过 SDS-PAGE 检测,体外翻译的 NOP5 的表观分子量为 60 kD。

▼ 基因功能

通过免疫共沉淀分析,Lyman 等人(1999) 发现 NOP58 与 HeLa 细胞提取物中的几个框 C/D 小核仁 RNA(snoRNA) 相互作用,包括 U3(SNORD3A; 180710) 和 U8(SNORD118; 616663)。 NOP58 与 snoRNA 的关联不会被高盐条件破坏,这表明人 NOP58 是框 C/D 小核仁核糖核蛋白(snoRNP) 的稳定核心成分。

Nelson 等人使用差异显示 RT-PCR(2000) 发现有丝分裂原 PDGF(参见 173430) 诱导小鼠 NIH3T3 成纤维细胞中 Nop5 的表达。 PDGF 诱导的 M426 人成纤维细胞中 NOP5 表达的动力学表明 NOP5 是一种早期反应基因。

▼ 测绘

Hartz(2016) 根据 NOP58 序列(GenBank AF123534) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 NOP58 基因对应到染色体 2q33.1。