AlkB 同源物 5，RNA 脱甲基酶; ALKBH5

• AlkB，大肠杆菌，同源物，5
• ABH5

HGNC 批准的基因符号：ALKBH5

细胞遗传学定位：17p11.2 基因组坐标（GRCh38）：17:18,183,827-18,209,953（来自 NCBI）

▼ 说明

N（6）-甲基腺苷（m（6）A） 是最常见的 mRNA 修饰。 ALKBH5 充当脱甲基酶，从 mRNA 中去除 m（6）A（Zheng et al., 2013）。

▼ 克隆与表达

通过数据库分析来识别与 ABH 基因相似的序列（参见 ALKBH1；605345），然后对睾丸 cDNA 文库进行 PCR，Tsujikawa 等人（2007） 克隆了 ALKBH5，他们将其称为 ABH5。 推导的 458 个氨基酸蛋白具有 C 端 AlkB 同源结构域，预计该结构域将充当 2-氧化戊二酸和 Fe（II） 依赖性加氧酶结构域。 定量实时 PCR 检测到所有 16 个检查组织中都有可变的 ABH5 表达，其中肺中表达最高，其次是睾丸、胰腺、脾脏和卵巢。 荧光标记的 ABH5 在转染的 HeLa 细胞的细胞质和细胞核中表达。 细胞质ABH5呈弥漫性和点状分布。

使用定量 RT-PCR，Zheng 等人（2013）在所有检查的小鼠器官中检测到 Alkbh5 表达，其中睾丸中表达最高，其次是肺。

▼ 测绘

Hartz（2010） 根据 ALKBH5 序列（GenBank AK000315） 与基因组序列（GRCh37） 的比对，将 ALKBH5 基因定位到染色体 17p11.2。

郑等人（2013） 指出小鼠 Alkbh5 基因定位于 11 号染色体。

▼ 基因功能

郑等人（2013） 发现重组人 ALKBH5 在体外完全使 RNA/DNA 底物中的 m（6）A 去甲基化。 ALKBH5 强烈偏爱单链底物，但它也会使环结构中的 m（6）A 去甲基化。 HeLa 细胞的敲低和过表达研究证实 ALKBH5 使总 mRNA 中的 m（6）A 去甲基化。 ALKBH5 的敲低导致核 mRNA 消失以及核斑点中磷酸化 ASF/SF2（SRSF1; 600812） 和磷酸化 SC35（SRSF2; 600813） 的丢失。 郑等人（2013） 假设 ALKH5 与 mRNA 加工和核输出因子结合发挥作用。

刘等人（2019） 报道称，为了应对病毒感染，宿主细胞会损害 RNA m6A 去甲基化酶 ALKBH5 的酶活性。 这种行为会增加 α-酮戊二酸脱氢酶（OGDH; 613022） mRNA 上的 m6A 甲基化，从而降低其 mRNA 稳定性和蛋白质表达。 OGDH 减少会减少病毒复制所需的代谢物衣康酸的产生。 由于体内 Ogdh 和衣康酸产量减少，Alkbh5 缺陷小鼠表现出对病毒暴露的先天免疫反应孤立的抵抗力。 刘等人（2019） 得出的结论是，他们的研究结果表明，m6A RNA 修饰介导的 OGDH-衣康酸途径下调会重新编程细胞代谢以抑制病毒复制，从而提出了控制病毒感染的潜在目标。

▼ 动物模型

郑等人（2013） 发现 Alkbh5 -/- 小鼠能够存活，解剖学正常，并且已成年。 雄性 Alkbh5 -/- 小鼠由于细胞凋亡影响减数分裂中期精母细胞而导致生育能力受损。 Alkbh5 -/- 肺显示 m（6）A 含量升高。 在睾丸中，Alkbh5 的缺乏显着改变了参与精子发生和 p53（TP53; 191170） 相互作用网络的基因的表达。