序列相似度90的家族,成员A3; FAM90A3

  • FAM90A 副本 2

HGNC 批准的基因符号:FAM90A3P

细胞遗传学定位:8p23.1 基因组坐标(GRCh38):8:7,262,865-7,268,097(来自 NCBI)

▼ 说明

FAM90A3 属于灵长类特异性 FAM90A 基因家族的 II 亚家族,该基因家族源自多次重复和重排(Bosch 等,2007)。 有关 FAM90A 基因家族的背景信息以及 FAM90A 基因进化的信息,请参阅 FAM90A1(613041)。

▼ 克隆与表达

通过分析人类基因组序列(版本 36.1),Bosch 等人(2007) 鉴定了染色体 12p 上的 FAM90A1 基因和 8p 染色体上的 24 个附加 FAM90A 基因和假基因,包括 FAM90A3。 博世等人(2007) 将 FAM90A3 称为 FAM90A copy 2。推导的 434 个氨基酸的 FAM90A3 蛋白包含 CCHC 型锌指基序,表明它可能与 RNA 或 DNA 相互作用。 使用不区分各个 FAM90A 基因的引物进行的 RT-PCR 表明 FAM90A 亚家族 II 的成员(例如 FAM90A3)普遍表达。

▼ 基因结构

博世等人(2007)确定FAM90A3基因含有5个外显子。 外显子 1 是非编码的,包含 LINE 元件 L1MB3,最后一个外显子的序列 3-prime 包含 ERV-K 家族的长末端重复序列。 与 FAM90A 亚家族 II 的其他成员一样,FAM90A3 在其 5 素末端缺乏重复序列。

▼ 测绘

通过分析基因组序列(构建 36.1),Bosch 等人(2007) 将 FAM90A3 基因定位到染色体 8p23.1(坐标 7107719 至 7113030)。 它是第二个 FAM90A 拷贝,从远端到近端计数,位于 FAM90A 重复区域内,位于簇 A 内,簇 A 还包括 FAM90A15(613051)、FAM90A4P、FAM90A13(613049)、FAM90A5(613043) 和 FAM90A20(613059)。 簇 A 中的 FAM90A 拷贝在正链上从头到尾定向。