半胱天冬酶 9,凋亡相关半胱氨酸蛋白酶; CASP9

  • 凋亡蛋白酶激活因子3;APAF3

HGNC 批准的基因符号:CASP9

细胞遗传学定位:1p36.21 基因组坐标(GRCh38):1:15,491,400-15,524,911(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

Li et al.(1997) 报道了从 HeLa 细胞中纯化出第三种凋亡激活因子 APAF3,该因子参与体外 半胱天冬酶-3(600636) 激活。APAF3 被鉴定为 半胱天冬酶 家族的成员并指定为 半胱天冬酶-9(CASP9)。

▼ 生化特征

晶体结构

盐崎等人(2003) 以 2.4 埃的分辨率报道了与 XIAP 的 BIR3 结构域形成的抑制复合物中 半胱天冬酶-9 的晶体结构。该结构表明 BIR3 结构域与 半胱天冬酶-9 单体形成异二聚体。与 BIR3 相互作用的 半胱天冬酶-9 表面也介导其同源二聚化。由于缺乏同源二聚化提供的支持序列元件,单体 半胱天冬酶-9 没有催化活性。作者得出结论,XIAP 以单体状态隔离 半胱天冬酶-9,从而阻止催化活性。

▼ 基因功能

Li 等人(1997) 确定在细胞色素 c(123970) 和 dATP 存在的情况下,半胱天冬酶-9 和 APAF1(602233) 通过各自的 NH2 末端 CED-3 同源结构域相互结合,这一事件导致 半胱天冬酶-9 激活。激活的 半胱天冬酶-9 依次裂解并激活 半胱天冬酶-3。S-100 提取物中 半胱天冬酶-9 的耗尽会减少 半胱天冬酶-3 的激活。半胱天冬酶-9 活性位点的突变(cys287 至 ala)减弱了 半胱天冬酶-3 的激活和体内细胞凋亡反应,表明 半胱天冬酶-9 是由细胞色素 c 和 dATP 触发的凋亡蛋白酶级联的最上游成员。

APAF1 在细胞色素 c/dATP 依赖性途径中激活 pro半胱天冬酶-9,需要蛋白水解裂解才能生成成熟的 半胱天冬酶 分子。斯里尼瓦苏拉等人(1998) 表明,删除 APAF1 WD40 重复序列使 APAF1 具有组成型活性,并且能够孤立于细胞色素 c 和 dATP 处理 pro半胱天冬酶-9。APAF1 介导的 pro半胱天冬酶-9 加工通过 pro半胱天冬酶-9 本身的内在自催化活性发生在 asp315。斯里尼瓦苏拉等人(1998) 提供的证据表明 APAF1 可以形成寡聚体,并且可以通过寡聚化其前体分子来促进 pro半胱天冬酶-9 自激活。一旦激活,半胱天冬酶-9 可以启动涉及下游刽子手 半胱天冬酶-3、-6 和 -7 的生化级联反应。

XIAP(300079) 与 半胱天冬酶-9 相互作用并抑制其活性,而 SMAC(605219) 通过与 XIAP 相互作用缓解这种抑制。斯里尼瓦苏拉等人(2001) 证明 XIAP 通过与 半胱天冬酶-9 小亚基上连接肽的氨基末端结合而与活性 半胱天冬酶-9-APAF1 全酶复合物结合,在 pro半胱天冬酶-9 在 asp315 处进行蛋白水解加工后,该小亚基会暴露出来。支持这一观察结果的是,点突变消除了 半胱天冬酶-9 的蛋白水解过程,但没有消除其催化活性,或连接肽的删除,阻止了 半胱天冬酶-9 与 XIAP 的关联及其伴随的抑制。斯里尼瓦苏拉等人(2001) 指出 半胱天冬酶-9 连接肽的 N 端 4 个残基与成熟 SMAC 和果蝇蛋白 Hid/Grim/Reaper 中的 N 端四肽具有显着的同源性,定义了一类保守的 IAP 结合基序。与这一发现一致,半胱天冬酶-9 连接肽和 SMAC 与 XIAP 的 BIR3 结构域的结合是相互排斥的,表明 SMAC 通过破坏 半胱天冬酶-9 连接肽与 BIR3 的相互作用来增强 半胱天冬酶-9 活性。斯里尼瓦苏拉等人(2001) 得出的结论是,他们的研究揭示了一种机制,其中 2 个保守肽(一个来自 SMAC,另一个来自 半胱天冬酶-9)与 XIAP 的 BIR3 结构域结合,对 半胱天冬酶 活性和细胞凋亡具有相反的作用。半胱天冬酶-9 连接肽和 SMAC 与 XIAP 的 BIR3 结构域的结合是相互排斥的,表明 SMAC 通过破坏 半胱天冬酶-9 连接肽与 BIR3 的相互作用来增强 半胱天冬酶-9 活性。斯里尼瓦苏拉等人(2001) 得出的结论是,他们的研究揭示了一种机制,其中 2 个保守肽(一个来自 SMAC,另一个来自 半胱天冬酶-9)与 XIAP 的 BIR3 结构域结合,对 半胱天冬酶 活性和细胞凋亡具有相反的作用。半胱天冬酶-9 连接肽和 SMAC 与 XIAP 的 BIR3 结构域的结合是相互排斥的,表明 SMAC 通过破坏 半胱天冬酶-9 连接肽与 BIR3 的相互作用来增强 半胱天冬酶-9 活性。斯里尼瓦苏拉等人(2001) 得出的结论是,他们的研究揭示了一种机制,其中 2 个保守肽(一个来自 SMAC,另一个来自 半胱天冬酶-9)与 XIAP 的 BIR3 结构域结合,对 半胱天冬酶 活性和细胞凋亡具有相反的作用。

马斯登等人(2002) 确定 BCL2(151430) 控制的细胞死亡途径不需要 半胱天冬酶-9 或其激活剂 APAF1。他们的证据表明,两者都不是造血稳态所必需的(BCL2 家族在造血稳态中起主要作用),具有自身反应性的胸腺细胞的删除取决于 BIM(603827),而不取决于 APAF1。因为 APAF1 或 半胱天冬酶-9 的缺失最多会稍微延迟细胞凋亡,Marsden 等人(2002) 得出结论,凋亡体不是细胞凋亡的重要触发因素,而是放大 半胱天冬酶 级联的机器。他们发现 BCL2 过度表达会增加小鼠的淋巴细胞数量并抑制许多细胞凋亡刺激,但 APAF1 和 半胱天冬酶-9 的缺失却不会。在缺乏 APAF1 或 半胱天冬酶-9 的细胞中,半胱天冬酶 活性仍然可辨别,而有效的 半胱天冬酶 拮抗剂既能抑制细胞凋亡,又能延缓细胞色素 c 的释放。马斯登等人(2002) 得出结论,BCL2 孤立于细胞色素 c/APAF1/半胱天冬酶-9 凋亡体调节 半胱天冬酶 激活程序,这似乎是放大而不是启动 半胱天冬酶 级联。

CASP9 活性在与凋亡体复合物结合后急剧增加。尹等人(2006) 和 Pop 等人(2006) 证明凋亡体通过诱导接近引起其二聚化来激活 CASP9。此外,尹等人(2006) 发现凋亡体通过直接与 proCASP3 相互作用或通过诱导结合的 CASP9 的构象变化来增强 CASP9 对 proCASP3 的亲和力。

周等人(2009) 提出了一组经过高度验证的靶标,这些靶标对于果蝇中几种刺激引起的细胞凋亡是必需的。其中,Tango7(其人类同源物是PCID1(609641))被确定为新的效应子。缺乏该基因的细胞在诱导效应 半胱天冬酶 活性之前的一个步骤中抵抗细胞凋亡,果蝇中 Tango7 的定向沉默可防止 半胱天冬酶 依赖性程序性细胞死亡。与该模型系统中已知的凋亡调节因子不同,Tango7 活性并不影响果蝇 DIAP1(人类同源物 DIAPH1,602121)的刺激依赖性损失,而是调节顶端 半胱天冬酶 Dronc(人类同源物 CASP9)的水平。同样,Chew 等人(2009) 发现人类 PCID1 影响 半胱天冬酶-9,揭示了影响凋亡体的新调控轴。

▼ 基因结构

Hadano 等人(1999) 确定 CASP9 基因包含 9 个外显子,跨越大约 35 kb 的基因组 DNA。

FISH、Hadano 等人绘制的地图(1999) 将 CASP9 基因定位到染色体 1p36.3-p36.1。

▼ 动物模型

Kuida 等(1998) 通过靶向破坏人类 CASP9 基因的小鼠同源物培育出小鼠。大多数 Casp9 敲除小鼠在围产期死亡,其大脑明显增大且畸形,这是由于大脑发育过程中细胞凋亡减少所致。Casp9 缺失可阻止体内胚胎大脑中 Casp3 的激活,并且 Casp9 缺陷的胸腺细胞表现出对部分凋亡刺激的抵抗力,包括缺乏 Casp3 样裂解和延迟的 DNA 片段化。此外,Casp9 缺陷细胞的胞浆提取物中不存在细胞色素 c 介导的 Casp3 裂解,但在添加体外翻译的 Casp9 后又恢复了。这些结果表明 Casp9 是体内 半胱天冬酶 级联的关键上游激活剂。

哈克姆等人(1998) 还创建了 Casp9 被破坏的基因敲除小鼠。Casp9 -/- 胚胎干细胞和胚胎成纤维细胞对多种细胞凋亡刺激具有抵抗力,包括紫外线和伽马射线照射。Casp9 -/- 胸腺细胞也能抵抗地塞米松和伽马射线照射诱导的细胞凋亡,但对紫外线照射或抗 CD95 诱导的细胞凋亡敏感。突变细胞中线粒体膜电位的保留伴随着细胞凋亡的抵抗。此外,在紫外线刺激下,细胞色素 c 易位至 Casp9 -/- 胚胎干(ES) 细胞的胞质溶胶中,表明 Casp9 在细胞色素 c 的下游发挥作用。半胱天冬酶 加工在 Casp9 -/- ES 细胞中受到抑制,但在胸腺细胞或脾细胞中不受抑制。