锌指蛋白 235; ZNF235

  • 锌指蛋白 93,小鼠,同源物; ZFP93
  • 锌指蛋白 270; ZNF270
  • HZF6

HGNC 批准的基因符号:ZNF235

细胞遗传学位置:19q13.31 基因组坐标(GRCh38):19:44,286,347-44,305,706(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

Abrink 等人通过使用基于包含 H/C 连接的 Kruppel 相关锌指蛋白保守区域的简并寡核苷酸筛选人单核细胞系(U-937) cDNA 文库,(1995)分离出编码 42 种不同的 Kruppel 相关锌指蛋白的 cDNA,其中包括 ZFP93,他们将其称为 HZF6。 部分 ZFP93 cDNA 缺乏 5 引物和 3 引物编码序列,编码至少 7 个锌指基序。 Northern 印迹分析在 HeLa 细胞、U-937 细胞和 PMA 诱导的 U-937 细胞中检测到主要的 5.5 kb ZFP93 转录物,在单核细胞/巨噬细胞谱系中表达较高。

Shannon 和 Stubbs(1998) 分离了代表全长 ZFP93 转录物的 cDNA。 预测的 738 个氨基酸的 ZFP93 蛋白包含一个非常靠近 N 末端的 KRAB A 结构域、一个相邻的 KRAB B 结构域、一个间隔区和 15 个串联排列的 C2H2 型锌指。 对成人组织进行 Northern blot 分析,检测到 3.1 kb ZFP93 转录物广泛表达,包括脾脏、胸腺、血液白细胞、肝脏、胰腺、小肠、结肠、肾脏、心脏、大脑、骨骼肌、睾丸、前列腺、卵巢和胎盘。

▼ 基因家族

锌指蛋白已被证明可与核酸相互作用并具有多种功能,例如刺激转录、转录抑制、与单链 DNA 结合、与 RNA 结合或双功能 DNA 和 RNA 结合活性。 锌指结构域是一个保守的氨基酸序列基序,包含 2 个特定位置的半胱氨酸和 2 个参与锌配位的组氨酸。 锌指通过半胱氨酸和组氨酸的至少 5 种不同组合中的 1 种结合二价锌离子,包括真核 C2H2、C4 和 C6 基序。 果蝇蛋白 Kruppel 属于相关 C2H2 锌指蛋白的一个非常大的家族,其中锌指基序位于更小或更大的串联阵列中。 连接连续锌指重复序列的间隔区(称为 H/C 连接)在该家族成员中高度保守,显示出比指基序更高程度的同源性。 锌指区域外的结构保守基序将 Kruppel 家族细分为更小的亚家族。 其中一个基序是 Kruppel 相关框(KRAB),它是一个大约 75 个氨基酸的结构域,通常位于蛋白质的 N 末端,并且可能形成亮氨酸拉链样结构(Abrink 等人总结,1995)。

▼ 测绘

Shannon 和 Stubbs(1998) 通过 PCR 将 ZFP93 基因定位到 19q13.2 粘粒重叠群内的特定粘粒。

香农等人(1996) 将同源小鼠 Zfp93 基因定位在靠近 7 号染色体 Xrcc1 基因的包含 KRAB 的锌指基因簇内。