无远端同源基因 3; DLX3

HGNC 批准的基因符号:DLX3

细胞遗传学位置:17q21.33 基因组坐标(GRCh38):17:49,990,004-49,995,223(来自 NCBI)

▼ 描述

Distal-less 基因家族,包括 DLX3,包含至少 6 个不同的成员,它们共享与果蝇 Distal-less(Dll) 基因中相似的同源基因序列。

▼ 克隆和表达

Price 等(1998)克隆并测序了DLX3基因。推导的 288 个氨基酸蛋白质在其 C 末端区域包含同源框。人DLX3与小鼠Dlx3具有98%的同一性,人DLX3的同源结构域与小鼠、墨西哥蝾螈(axolotl)、蝾螈、斑马鱼和爪蟾Dlx3的同源结构域具有100%的同一性。Northern 印迹分析在人胎盘中检测到 2.5 kb 的转录物。

▼ 基因结构

Price 等(1998)确定DLX3基因含有3个编码外显子。

▼ 基因功能

Hassan 等人(2004) 发现 Msx2(123101)、Dlx3、Dlx5(600028) 和 Runx2(600211) 调节小鼠胚胎中骨钙素(OC)(BGLAP; 112260) 的表达,因此与骨形成的控制有关。Msx2 与转录抑制的 OC 染色质相关,Dlx3 和 Dlx5 与 Runx2 一起启动 OC 转录。在第二次调节转换中,Dlx3 关联减少,Dlx5 募集增加,与成骨细胞分化的矿化阶段一致。OC 启动子中 Dlx3 和 Dlx5 的出现与 RNA 聚合酶 II 占据增加所代表的转录增加相关。

▼ 测绘

使用体细胞混合作图面板和 FISH,Scherer 等人(1995) 将人类 DLX3 基因定位到染色体 17q21.3-q22。中村等人(1996) 发现人类 DLX3 和 DLX4(601911) 在 17 号染色体上相距 10 kb。DLX3 与 HOX2 基因簇(例如 HOX2A;142960)位于相同的一般区域,而 DLX1 和 DLX2 与 2 号染色体上的 HOX4 簇(例如 HOX4A;142980)同线,DLX5 和 DLX6 位点位于7q 上 HOX1 簇(例如 HOX1A;142950)附近。这些观察结果为人类 2、7 和 17 号染色体之间的同源关系提供了另一个证据。

▼ 分子遗传学

Price 等(1998) 指出,毛齿骨综合征(TDO; 190320) 定位于染色体 17q21,该区域包括远端较少同源基因基因家族的 2 个成员 DLX3 和 DLX7(也称为 DLX4; 601911)。他们在 DLX3 基因中发现了一个 4 bp 缺失(600525.0001),该缺失与 6 个家族的 TDO 表型相关。

牙釉质生成不全,发育不全型,伴有牛牙症(AI4; AIHHT; 104510) 是一种与牙釉质缺陷和牙髓腔扩大相关的常染色体显性性状。董等人(2005) 研究了一个该疾病已遗传 3 代的家庭,其中 5 个同胞中有 11 名受影响者,其中有 1 例是男性间遗传。连锁分析将表型对应到染色体 17q21-q22(lod 评分 = 3.3),突变分析发现与该疾病相关的 DLX3 基因中存在 2 bp 缺失(560delCT;600525.0002)。这是首次报道 D​​LX3 同源域内的突变;DLX3 中与 TDO 相关的 4-bp 缺失位于同源域之外。董等人(2005) 得出结论认为 TDO 和某些形式的 AIHHT 是等位基因。

赖特等人(2008)分析了一个具有减弱的TDO表型的3代家族中的DLX3基因,并鉴定了所有受影响个体中560delCT突变的杂合性。注意到该家族中受影响的个体在头发、牙齿和骨骼方面发生了变化,尽管程度比 4-bp 缺失个体(600525.0001) 的变化要小,作者得出结论,这种突变导致 TDO 具有减弱的表型,而不是之前报道的 AIHHT。

▼ 动物模型

Morasso 等人(1999) 发现小鼠 Dlx3 基因的定向删除导致第 9.5 天到第 10 天之间的胚胎死亡,因为胎盘缺陷改变了迷路层的发育。原位杂交显示,Dlx3基因最初在胎盘外锥细胞和绒毛膜板中表达,随后在绒毛尿囊胎盘的迷路滋养层中表达,其中在Dlx3 -/- 胚胎中观察到主要缺陷。他们发现,到发育第 10.5 天,受影响的胎盘组织中配对样同源域基因 Esx1 的表达强烈下调,这表明 Dlx3 是维持 Esx1 表达、正常胎盘形态发生和胚胎存活所必需的。

▼ 等位基因变异体(2 个选定示例):.

0001 三齿齿骨综合征
DLX3、4-BP DEL、NT3198
在 6 个三齿骨综合征(TDO; 190320) 家系的所有受影响成员中,Price 等人(1998)发现DLX3基因的1个等位基因中从核苷酸3198开始的4G核苷酸缺失。删除导致DLX3 3-prime末端部分发生移码,但同源结构域保持完整。缺失等位基因中核苷酸 3398 处存在框内终止密码子;这产生了比正常 DLX3 蛋白短 32 个氨基酸的突变蛋白。TDO 患者最明显的临床表现是牛牙症和牙齿釉质缺陷。在早期小鼠牙齿形成中,Dlx3 主要在牙齿的神经嵴衍生的间充质成分中表达,该成分随后会形成牙本质和牙髓。小鼠出生前胡须和毛囊强烈表达Dlx3,其次是出生后表达减少。这可能与 TDO 患者出生时观察到的卷曲头发有关,超过一半的病例在婴儿期头发会变直。TDO 患者的颅骨变化比头发和牙齿异常更难以理解,但在鳃弓的致密间质中检测到了小鼠 Dlx3 表达,随后这些间质凝结并骨化形成颅骨和面部骨骼。

普莱斯等人(1998) 在弗吉尼亚家族中发现了相同的 4-bp 缺失。在 6 个原始家族和弗吉尼亚家族的所有受影响受试者中,鉴定出了围绕 DLX3 基因的 3 个标记的常见单倍型。普莱斯等人(1998) 得出结论,这些家族中所有受影响的个体都从共同祖先遗传了相同的 DLX3 基因缺失。

.0002 釉质形成不完善,IV 型
三齿牙骨综合征,包括
DLX3、2-BP DEL、560CT
在 3 代家族的受影响成员中,患有釉质形成不完善、发育不全型、牛牙症(AI4;104510),呈常染色体显性谱系模式,Dong 等人(2005) 在 DLX3 基因 560delCT 中发现了一个 2 bp 的缺失,导致移码改变了 DNA 结合同源域的最后 2 个氨基酸,并引入了一个提前终止密码子,将蛋白质截断了 88 个氨基酸。

Wright 等人在具有 TDO 减毒表型的 3 代家庭的 7 名受影响成员中(2008) 鉴定了 DLX3 基因中 560delCT 突变的杂合性。在 5 名未受影响的家庭成员中未发现该突变。作者注意到,该家族中受影响的个体的头发变化与 4 bp 缺失(600525.0001) 的个体相似,牙齿和骨骼也发生变化,尽管程度较轻,作者得出结论,这种突变导致 TDO 具有减弱的表型,而不是之前报道的 AIHHT。