上游转录因子家族,成员 3; USF3

细胞遗传学定位:3q13.2 基因组坐标(GRCh38):3:113,648,384-113,696,656(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

倪等人(2017) 报道推导的 2,245 个氨基酸的 USF3 蛋白具有 N 末端碱性螺旋-环-螺旋结构域,随后是中央富含丝氨酸的结构域和富含谷氨酰胺的结构域,其中包括聚 Q 束。 USF3 还具有许多丝氨酸和苏氨酸磷酸化位点以及 1 个酪氨酸磷酸化位点。 数据库分析表明 USF3 表达无处不在,在小脑和骨骼肌中表达最高。

▼ 基因功能

倪等人(2017) 发现通过短干扰 RNA 敲低 USF3 可增强 HEK293T 和人甲状腺细胞系中的细胞迁移和间质标记物的表达。 USF3 敲低 HEK293T 细胞的透射电子显微镜显示线粒体肿胀,这是坏死的特征。 敲低细胞没有表现出凋亡特征,但它们表现出高非线粒体呼吸、线粒体超极化和对内质网应激的敏感性。

▼ 测绘

Hartz(2017) 根据 USF3 序列(GenBank BX537728) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 USF3 基因对应到染色体 3q13.2。

▼ 分子遗传学

Ni 等人在一个大家族(家族 1617)的 7 名同胞中患有乳头状甲状腺癌,并伴有其他 Cowden 综合征(参见 158350)特征(2017) 鉴定了 USF3 基因中一段谷氨酰胺内 2 个不同框内缺失的复合杂合性:Gln1472(del1Q; rs10606566) 和 Gln1470_Gln1472del(del3Q; rs112313093)。 没有提供患者的更多临床细节。 这些缺失是通过精细作图和全基因组测序发现的,并通过桑格测序证实,与家族中的疾病分开。 千人基因组计划数据库和 ExAC 数据库(频率分别为 0.4 和 0.3)均报告了这两种缺失,但在外显子组测序计划数据库或 40 个内部正常对照中均未发现。 随后,在 90 名具有 CS 或 CS 样表型的不相关 PTEN 突变阴性患者中的 26 名(29%) 以及 29 名非 CS 患者中的 7 名(24%) 中发现了这些种系复合杂合性缺失(del1Q/del3Q)。 非 CS 患者的发现被认为与 ExAC 数据库估计的结果相似。 对甲状腺癌数据集的分析显示,497 名个体中有 138 名(27%)具有种系 del1Q/del3Q,而只有 2 名(0.4%)仅在体细胞水平的肿瘤组织中具有 del1Q/del3Q。 总体而言,与对照相比,甲状腺肿瘤样本显示 USF3A mRNA 表达降低。 体外细胞表达研究表明,USF3A 的敲低或 del1Q/del3Q 的过表达会促进上皮间质转化(EMT) 信号传导的串扰,增强迁移,导致线粒体功能障碍和 ER 应激,从而为癌变创造微环境。 葡萄糖和谷氨酰胺的营养供应似乎会影响 USF3 缺失的细胞的代谢存活。 这些发现表明,与 USF3 功能障碍相关的癌症易感性在一定程度上取决于基因-环境相互作用。