磷脂酰肌醇聚糖锚生物合成 L 类蛋白; PIGL

HGNC Approved Gene Symbol: PIGL

细胞遗传学定位:17p11.2 基因组坐标(GRCh38):17:16,217,208-16,351,799(来自 NCBI)

▼ 描述

糖基磷脂酰肌醇(GPI) 被许多真核细胞表面蛋白用作膜锚。GPI 生物合成的第一步涉及 N-乙酰氨基葡萄糖(GlcNAc) 从 UDP-GlcNAc 转移到磷脂酰肌醇(PI)。第二步是 GlcNAc-PI 的 N-脱乙酰化,由 PIGL 进行(渡边等人总结,1999)。

有关 PIG 基因家族以及 PIG 蛋白在 GPI 生物合成中的作用的信息,请参阅 PIGA(311770)。

▼ 克隆与表达

Nakamura 等人使用表达克隆(1997) 鉴定了一种大鼠基因,他们将其称为 PIGL,该基因补充了 GlcNAc-PI N-脱乙酰化缺陷的细胞系的表型。通过 EST 数据库检索大鼠 PIGL 序列,Watanabe 等人(1999) 鉴定了人类 PIGL cDNA 并使用 RACE 延伸了 5-prime 末端。PIGL 编码推导的 252 个氨基酸的蛋白质,与大鼠蛋白质有 77% 的同一性。Watanabe 等人通过转染哺乳动物 PIGL 缺陷细胞(1999) 证明酿酒酵母 Gpi12 是人和大鼠 PIGL 的直系同源物。酵母中 Gpi12 的破坏会导致致命的表型。Watanabe 等人使用纯化的重组大鼠 PIGL(1999) 证明 PIGL 在体外具有 GlcNAc-PI N-脱乙酰酶活性,金属离子可增强该活性。中村等人。

▼ 测绘

国际辐射混合定位联盟将 PIGL 基因定位到染色体 17p12-p11.2(WI-6323)。

▼ 分子遗传学

Ng 等人在 6 名无关个体中患有 CHIME 综合征(280000),也称为 Zunich 神经外胚层综合征(2012) 鉴定了 PIGL 基因中 2 个突变的复合杂合性。所有患者的 1 个等位基因(L167P; 605947.0001) 均携带创始人错义突变。5 名患者的另一个等位基因(605947.0002-605947.0004) 携带截短突变,而第 6 名患者的染色体 17p12-p11.2 存在 1 Mb 缺失,包括另一个等位基因上的 PIGL 基因。所有患者以前均已报道过(参见,例如,Zunich 和 Kaye(1983、1984);Zunich 等人,1985;Zunich 等人,1988;Schnur 等人,1997;Shashi 等人,1995;Tinschert 等人,1996)。这些突变是通过全外显子组测序发现的,并通过桑格测序证实。Zunich 神经外胚层综合征是一种极为罕见的常染色体隐性多系统疾病,临床特征为缺损、先天性心脏缺陷、游走性鱼鳞病样皮肤病、智力低下和耳朵异常。其他临床特征包括独特的面部特征、生长异常、泌尿生殖异常、癫痫发作和喂养困难。来自 2 名患者的细胞系显示出 2 个 GPI 锚定标记物的缺陷,包括 CD59(107271),证实该疾病是由于 PIGL 缺陷所致。吴等人(2012) 指出 GPI 锚定缺陷导致显着的临床多样性。泌尿生殖系统异常、癫痫发作和喂养困难。来自 2 名患者的细胞系显示出 2 个 GPI 锚定标记物的缺陷,包括 CD59(107271),证实该疾病是由于 PIGL 缺陷所致。吴等人(2012) 指出 GPI 锚定缺陷导致显着的临床多样性。泌尿生殖系统异常、癫痫发作和喂养困难。来自 2 名患者的细胞系显示出 2 个 GPI 锚定标记物的缺陷,包括 CD59(107271),证实该疾病是由于 PIGL 缺陷所致。吴等人(2012) 指出 GPI 锚定缺陷导致显着的临床多样性。

▼ 动物模型

在国际小鼠表型联盟(IMPC) 创建的 1,751 个敲除等位基因的研究中,Dickinson 等人(2016) 发现人类 PIGL 小鼠同源物的敲除是纯合致死的(定义为在断奶前筛选至少 28 只幼崽后不存在纯合小鼠)。

▼ 等位基因变异体(4 个选定示例):.

0001 缺损、先天性心脏病、鱼鳞病样皮肤病、智力低下和耳朵异常综合征
PIGL、LEU167PRO
Ng 等人在 6 名无关个体中患有 CHIME 综合征(280000),也称为 Zunich 神经外胚层综合征(2012) 鉴定了 PIGL 基因中 2 个突变的复合杂合性。所有患者的外显子 5 均携带 500T-C 转变,导致 1 个等位基因催化结构域中的高度保守残基发生 leu167 到 pro(L167P) 取代,以及另一个等位基因上 PIGL 基因的第二个致病性突变。Zunich 等人先前报道了两个同胞(1988) 在外显子 2(274delC; 605947.0002) 中存在 1-bp 缺失,导致另一个等位基因发生移码和提前终止。Shashi 等人报道的一名患者(1995) 在外显子 6 中携带 653C-T 转换,导致在另一个等位基因上产生 gln218-to-ter(Q218X; 605947.0003)。另一名患者的内含子 3 发生 G 到 A 的转变(427-1G-A;605947. 0004)在另一个等位基因上。最后,Tinschert 等人报告的一位患者(1996) 染色体 17p12-p11.2 被删除了 1 Mb,其中包括另一个等位基因上的 PIGL 基因。杂合 L167P 突变在 2 个大型公共数据库(国家心肺血液研究所(NHLBI) 外显子组测序项目和千人基因组计划数据库)的近 13,000 个对照等位基因中的 8 个中被发现。由于所有患者都有欧洲血统,Ng 等人(2012) 假设该变体具有创始人效应,并使用微卫星标记证实了这一点。所有 PIGL 突变均通过全外显子组测序鉴定,并通过桑格测序确认。来自 2 名患者的细胞系显示出 2 个 GPI 锚定标记物的缺陷,包括 CD59(107271),证实该疾病是由于 PIGL 缺陷所致。Tinschert 等人报告的一位患者(1996) 染色体 17p12-p11.2 被删除了 1 Mb,其中包括另一个等位基因上的 PIGL 基因。杂合 L167P 突变在 2 个大型公共数据库(国家心肺血液研究所(NHLBI) 外显子组测序项目和千人基因组计划数据库)的近 13,000 个对照等位基因中的 8 个中被发现。由于所有患者都有欧洲血统,Ng 等人(2012) 假设该变体具有创始人效应,并使用微卫星标记证实了这一点。所有 PIGL 突变均通过全外显子组测序鉴定,并通过桑格测序确认。来自 2 名患者的细胞系显示出 2 个 GPI 锚定标记物的缺陷,包括 CD59(107271),证实该疾病是由于 PIGL 缺陷所致。Tinschert 等人报告的一位患者(1996) 染色体 17p12-p11.2 被删除了 1 Mb,其中包括另一个等位基因上的 PIGL 基因。杂合 L167P 突变在 2 个大型公共数据库(国家心肺血液研究所(NHLBI) 外显子组测序项目和千人基因组计划数据库)的近 13,000 个对照等位基因中的 8 个中被发现。由于所有患者都有欧洲血统,Ng 等人(2012) 假设该变体具有创始人效应,并使用微卫星标记证实了这一点。所有 PIGL 突变均通过全外显子组测序鉴定,并通过桑格测序确认。来自 2 名患者的细胞系显示出 2 个 GPI 锚定标记物的缺陷,包括 CD59(107271),证实该疾病是由于 PIGL 缺陷所致。2 包括另一个等位基因上的 PIGL 基因。杂合 L167P 突变在 2 个大型公共数据库(国家心肺血液研究所(NHLBI) 外显子组测序项目和千人基因组计划数据库)的近 13,000 个对照等位基因中的 8 个中被发现。由于所有患者都有欧洲血统,Ng 等人(2012) 假设该变体具有创始人效应,并使用微卫星标记证实了这一点。所有 PIGL 突变均通过全外显子组测序鉴定,并通过桑格测序确认。来自 2 名患者的细胞系显示出 2 个 GPI 锚定标记物的缺陷,包括 CD59(107271),证实该疾病是由于 PIGL 缺陷所致。2 包括另一个等位基因上的 PIGL 基因。杂合 L167P 突变在 2 个大型公共数据库(国家心肺血液研究所(NHLBI) 外显子组测序项目和千人基因组计划数据库)的近 13,000 个对照等位基因中的 8 个中被发现。由于所有患者都有欧洲血统,Ng 等人(2012) 假设该变体具有创始人效应,并使用微卫星标记证实了这一点。所有 PIGL 突变均通过全外显子组测序鉴定,并通过桑格测序确认。来自 2 名患者的细胞系显示出 2 个 GPI 锚定标记物的缺陷,包括 CD59(107271),证实该疾病是由于 PIGL 缺陷所致。肺和血液研究所(NHLBI) 外显子组测序项目和 1000 基因组项目数据库。由于所有患者都有欧洲血统,Ng 等人(2012) 假设该变体具有创始人效应,并使用微卫星标记证实了这一点。所有 PIGL 突变均通过全外显子组测序鉴定,并通过桑格测序确认。来自 2 名患者的细胞系显示出 2 个 GPI 锚定标记物的缺陷,包括 CD59(107271),证实该疾病是由于 PIGL 缺陷所致。肺和血液研究所(NHLBI) 外显子组测序项目和 1000 基因组项目数据库。由于所有患者都有欧洲血统,Ng 等人(2012) 假设该变体具有创始人效应,并使用微卫星标记证实了这一点。所有 PIGL 突变均通过全外显子组测序鉴定,并通过桑格测序确认。来自 2 名患者的细胞系显示出 2 个 GPI 锚定标记物的缺陷,包括 CD59(107271),证实该疾病是由于 PIGL 缺陷所致。所有 PIGL 突变均通过全外显子组测序鉴定,并通过桑格测序确认。来自 2 名患者的细胞系显示出 2 个 GPI 锚定标记物的缺陷,包括 CD59(107271),证实该疾病是由于 PIGL 缺陷所致。所有 PIGL 突变均通过全外显子组测序鉴定,并通过桑格测序确认。来自 2 名患者的细胞系显示出 2 个 GPI 锚定标记物的缺陷,包括 CD59(107271),证实该疾病是由于 PIGL 缺陷所致。

.0002 畸形、先天性心脏病、鱼鳞病、智力低下和耳朵异常综合征
PIGL, 1-BP DEL, 274C
用于讨论 PIGL 基因(274delC) 中的 1-bp 缺失,该缺失在 2 个患有 CHIME 综合征的同胞中以复合杂合状态发现(280000)吴等人(2012),参见 605947.0001。

.0003 畸形、先天性心脏病、鱼鳞病、精神发育迟滞和耳朵异常综合征
PIGL, GLN218TER
用于讨论 Ng 等人在 CHIME 综合征(280000) 患者的复合杂合状态下发现的 PIGL 基因中的 gln218-to-ter(Q218X) 突变等人(2012),参见 605947.0001。

.0004 缺损、先天性心脏病、鱼鳞病样皮肤病、智力低下和耳朵异常综合征
PIGL, IVS3AS, GA, -1
用于讨论 PIGL 基因(427-1G-A) 中的剪接位点突变,该突变是由 N 在 CHIME 综合征(280000) 患者的复合杂合状态下发现的g等人(2012),参见 605947.0001。