长基因间非编码 RNA 1081; LINC01081

• 长非编码 RNA TCONS_00024764
• lncRNA TCONS_00024764
• TCONS_00024764

HGNC 批准的基因符号：LINC01081

细胞遗传学位置：16q24.1 基因组坐标（GRCh38）：16:86,225,579-86,286,246（来自 NCBI）

▼ 说明

长非编码 RNA（lncRNA），例如 LINC01081，被认为参与染色质结构和基因表达的远程控制（Szafranski et al., 2013）。

▼ 克隆与表达

Szafranski 等人通过寻找肺泡毛细血管发育不良伴肺静脉错位（ACDMPV; 265380）（一种致命的肺部发育障碍）患者 16 号染色体区域中缺失的基因，发现了这一区域的基因缺失（2013） 识别了 LINC01081，他们将其称为 TCONS_00024764。 定量PCR检测到TCONS_00024764在新生儿肺中表达，在HEK293细胞中表达量低得多，在人肺微血管内皮细胞和淋巴母细胞中几乎没有表达。

▼ 测绘

通过基因组序列分析，Szafranski 等人（2013） 将 LINC01081 基因对应到染色体 16q24.1。

▼ 细胞遗传学

已在 ACDMPV 患者中发现 FOXF1 基因（601089） 的杂合突变，该基因位于 16q24.1 上的 LINC01081 基因附近。 萨弗兰斯基等人（2014）报道了一名患有严重新生儿发病的 ACDMPV 的患者，导致出生后 13 天死亡，这与位于 FOXF1 基因上游约 272 kb 的 16q24.1 中的 194 kb 缺失有关，使 FOXF1 保持完整并破坏了 LINC01081。 一名在 7 个月大时较晚出现 ACDMPV 的无关患者在 FOXF1 基因上游 306 kb 处存在 1.5 Mb 的缺失，使 FOXF1 和 LINC01081 保持完整，但删除了部分 LINC01082（614978）。 与对照组相比，该患者的肺组织中 FOXF1 表达减少了 70%。 两次缺失均发生在母体染色体上，表明 FOXF1 具有父系印记。 在胎儿肺成纤维细胞中使用 2 种不同的 siRNA 敲低 LINC01081 表达，使 FOXF1 转录水平降低了 14% 和 20%。 这些发现表明 LINC01081 和 LINC01082 是 FOXF1 的远程增强子。 萨弗兰斯基等人（2014） 得出的结论是，这些患者的不一致表型表明 LINC01081 对 FOXF1 表达的调节导致了 ACDMPV 症状的出现。