含有三联基序的蛋白质 44; TRIM44

  • MC7

HGNC 批准的基因符号:TRIM44

细胞遗传学位置:11p13 基因组坐标(GRCh38):11:35,662,691-35,818,006(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

Gawin 等人通过在 11 号染色体区域寻找与 WAGR 综合征(194072) 相关的基因,(1999) 鉴定并克隆了 TRIM44 的 2 个 cDNA,他们将其命名为克隆 136759 和 50813。对几种人体组织的 Northern 印迹分析在所有检查的组织中检测到 6 kb 转录物。 在小鼠中,成年大脑和胚胎第 11 天后的胚胎发育过程中表达强烈。

布图等人(2001) 从小鼠大脑 cDNA 文库中克隆了 Trim44,并将其命名为 Mc7。 推导的 345 个氨基酸蛋白质的计算分子量为 38 kD。 然而,体外翻译产生的蛋白质产物的表观分子量为 18 和 27 kD。 对转录本的检查表明这些蛋白质是从替代起始密码子翻译而来的。 全长蛋白包含一个 N 端泛素水解酶(参见 USP39, 611594)型锌指结构域,随后是一个卷曲螺旋结构域、一个锌指 B 框同源结构域和靠近 C 端的第二个卷曲螺旋结构域。 Mc7 还包含几个潜在的磷酸化和 N-肉豆蔻酰化位点、单个推定的糖胺聚糖附着和 N-糖基化位点以及几个 PEST 基序。 Northern 印迹分析检测到成年小鼠小脑、大脑半球和胚胎小鼠脑中显着表达 Mc7。 在肾、肺和脾中检测到很少的表达,在肝、肠或心脏中未检测到表达。 小脑皮质的原位杂交表明,出生后第 5 天 Mc7 表达主要在外部颗粒层的神经母细胞和内部颗粒层的发育神经元中。 Mc7 也在浦肯野细胞中被发现,在出生后第 10 天树突树的分枝过程中变得尤其明显。 在成年小鼠小脑皮质中,表达主要局限于浦肯野细胞,颗粒神经元中也有少量表达。 Southern blot 分析在大鼠、猪和人类基因组中检测到 MC7 直向同源物。

▼ 测绘

Gawin 等人通过分析覆盖染色体 11p14.1-p13 的 PAC 重叠群(1999) 将 TRIM44 基因对应到染色体 11p13,着丝粒对应到 FJX1 基因(612206),端粒对应到 TRAF6 基因(602355)。

▼ 分子遗传学

在一个 4 代中国家庭中,无虹膜对应到染色体 11p13(AN3;617142),Zhang 等人(2015) 在 TRIM44 基因(G155R; 612298.0001) 中发现了一个杂合错义突变,该突变与家族中的疾病分离,并且在 ExAC 数据库中未发现。 功能分析表明,TRIM44 是限制 PAX6(607108) 表达的负调节因子,G155R 突变显着增强其活性,并进一步将 PAX6 表达降低至非常低的水平。

▼ 等位基因变异体(1 个选定示例):

.0001 ANIRIDIA 3(1 科)
TRIM44、GLY155ARG
在一个患有无虹膜症的中国家庭的 7 名受影响成员中(AN3; 617142),Zhang 等人(2015) 鉴定了 TRIM44 基因外显子 1 中 c.463G-A 转换(c.463G-A, NM_017583.4) 的杂合性,导致 ZF UBP 和 B框 结构域之间的保守残基处发生 gly155 至 arg(G155R) 取代。 该突变与家族中的疾病完全分离,并且在 ExAC 数据库中未发现。 HLE-B3 细胞中的功能分析表明,与野生型相比,G155R 变体显着增强 TRIM44 对 PAX6(607108) 表达的抑制。