同源基因 A11,反义; HOXA11AS

  • HOXA11S

HGNC 批准的基因符号:HOXA11-AS

细胞遗传学定位:7p15.2 基因组坐标(GRCh38):7:27,185,407-27,189,292(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

在使用来自 Hoxa11(142958) cDNA 序列 5 引物区域的探针进行的小鼠胚胎 cDNA 文库筛选中,Hsieh-Li 等人(1995) 检测到 Hoxa11 反义(Hoxa11s) 转录本。 Hoxa11s 转录本经过处理和聚腺苷酸化。 有义和反义 cDNA 显示超过 500 bp 的序列重叠。 作者观察到有义和反义转录本在发育中的小鼠肢体中的互补分布,这表明存在部分调节功能。 为了区分虚假转录本和功能转录本,Potter 和 Branford(1998) 描述了 HOXA11S 转录本的进化保守性。 他们观察到小鼠和人类 HOXA11S 在 500 bp 的重叠区域中具有 99% 的核苷酸序列同一性。

▼ 基因功能

周等人(2002) 证明 HOXA11S 转录物存在于成年小鼠和人类子宫内膜中。 HOXA11S 转录水平在月经周期中变化,RNA 水平峰值出现在增殖中期,与 mRNA 表达水平成反比变化。 HOXA11 蛋白水平与 mRNA 峰值水平在时间上相关。 在原代基质细胞培养物中,孕酮下调 HOXA11S 转录,随后上调 HOXA11 mRNA,表明反义转录物在调节 mRNA 表达中可能发挥作用。 作者提出 HOXA11S 通过转录干扰发挥作用,通过竞争共同基因的转录来抑制 HOXA11 表达,而不是通过有义/反义相互作用。

▼ 测绘

Gross(2014) 根据 HOXA11AS 序列(GenBank AF071166) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 HOXA11AS 基因对应到染色体 7p15.2。