RET 手指蛋白样 1; RFPL1

  • RFP-LIKE 1

HGNC 批准的基因符号:RFPL1

细胞遗传学位置:22q12.2 基因组坐标(GRCh38):22:29,387,908-29,442,454(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

通过分析 22q12-q13 的粘粒基因组克隆和 PCR,Seroussi 等人(1999) 获得了编码 RET 指蛋白(RFP; 602165)-like-1(RFPL1)、RFPL2(605969) 和 RFPL3(605970) 以及反义 RFPL1S(605972) 和 RFPL3S(605971) 的 cDNA。 推导的 287 个氨基酸的 RFPL1 蛋白与 RFPL2 和 RFPL3 具有 91% 至 94% 的一致性。 RFPL1 的外显子 1 编码假定的 RING 样基序,与 RFP 的相同性为 29%,外显子 2 编码 B30-2 结构域,与 RFP 的相同性为 41%。 Northern 印迹分析揭示了 1.5 kb RFPL1 转录物的表达,该转录物在前列腺中丰富,而在成人大脑、胎儿肝脏和胎儿肾脏中含量较低。 在睾丸中强烈表达的 1.2-kb 转录物和在成人和胎儿大脑中强烈表达的 6-kb 转录物似乎分别代表 RFPL3S 和 RFPL1S。 对 Opitz 综合征家族(300000) 和无关的正常个体进行分析,结果检测到 RFPL1 的多态性蛋白质截短等位基因,该基因与 OS 表型无关。

▼ 基因结构

RFPL1 基因包含 2 个外显子(Seroussi 等,1999)。

▼ 基因功能

Bonnefont 等人使用微阵列表达分析(2008) 发现人类 RFPL1、RFPL2 和 RFPL3 基因被皮质生成转录因子 PAX6 反式激活(607108)。 实时 PCR 表明 RFPL1,2,3 在胚胎干细胞源性神经发生和胎儿新皮质中高表达。

▼ 测绘

RFPL1 基因与 RFPL2 和 RFPL3 位于染色体 22q12.2-q13.3 上的簇中(Seroussi 等,1999;Bonnefont 等,2008)。

▼ 进化

博内丰等人(2008) 观察到,在分化的人类胚胎干细胞和发育中的人类新皮质中,神经发生开始时出现高 RFPL1,2,3 转录水平,而独特的小鼠 RFPL 基因在肝脏中表达,但在神经组织中不表达。 对RFPL基因家族进化史的研究表明,RFPL1,2,3基因祖先是在Euarchonta-Glires分裂后出现的。 随后的重复事件导致大约 3400 万年前卡他类动物中存在多个 RFPL1,2,3 基因,导致类人猿谱系中基因拷贝数的增加。 在卡他尼中,RFPL1,2,3 表达谱向肝脏上方的新皮质和小脑分化。 重要的是,与小脑、黑猩猩和猕猴的新皮质相比,人类的皮质 RFPL1,2,3 表达显着增加。 还观察到 RFPL 蛋白质进化的加速,在 RFPL1,2,3 簇和 2 个新功能化事件中出现正选择的迹象(在所有 RFPL 中获得特定的 RFPL 定义基序,在卡他尼 RFPL1,2,3 中获得 N 端 29 个氨基酸序列)。 因此,博内丰等人(2008) 提出 RFPL1,2,3 基因的最近出现和增殖有助于灵长类动物新皮质大小和/或组织的变化。