NOP9 核仁蛋白; NOP9

  • NOP9,酿酒酵母,同源物

HGNC 批准的基因符号:NOP9

细胞遗传学位置:14q12 基因组坐标(GRCh38):14:24,299,849-24,309,123(来自 NCBI)

▼ 说明

NOP9 是一种进化上保守的核仁蛋白,参与核糖体 RNA(rRNA) 加工(Wang 和 Ye 的总结,2017)。

▼ 克隆与表达

汤姆森等人(2007) 鉴定了酵母 Nop9,它含有多个类似 pumilio(见 607204)的 RNA 结合重复序列。 免疫荧光分析将酵母 Nop9 定位于核仁。

▼ 基因功能

Thomson 等人使用梯度分析和亲和纯化(2007) 将酵母 Nop9 鉴定为 90S 前核糖体和前 40S 颗粒的组成部分。 Nop9 的缺失会抑制细胞生长并阻止前 rRNA 的加工,导致 18S rRNA 合成丧失。 Nop9 耗尽的细胞在成熟前 40S 颗粒方面也存在缺陷,这些颗粒不会从核仁中释放出来。 体外 RNA 结合测定显示 Nop9 具有强大的 RNA 结合活性。

▼ 生化特征

张等人(2016) 以 2.1 埃分辨率确定了酵母 Nop9 的晶体结构。 Nop9 包含 11 个呈 C 状排列的 pumilio 重复序列。 Nop9 识别并结合 20S pre-rRNA 中的内部转录间隔区 1(ITS1) 片段,特别是包含单链和双链体区域的 ITS1 RNA 片段。 Nop9-ITS1 RNA 复合物的小角 X 射线散射模型和生化探测证实,Nop9 识别并结合了 ITS1 RNA 茎环的碱基。 作者指出,核酸内切酶 Nob1(613586) 的结合位点与 Nop9 的结合位点重叠,它在细胞质中切割 20S pre-rRNA,形成 18S rRNA,但不在核仁中。 Nop9 的缺失降低了 20S pre-rRNA 水平,通过缺失 Nop9 和 Nob1 可以将其恢复到正常水平。 作者得出结论,Nop9 通过阻止 Nob1 裂解来稳定核仁中的 20S pre-rRNA,从而防止过早裂解。

Wang 和 Ye(2017) 发现酵母 Nop9 特异性识别 18S rRNA 的中心 11 个核苷酸序列。 作者确定了游离态和 RNA 结合态的 Nop9 晶体结构。 游离的 Nop9 结构显示 10 个 pumilio 重复序列和 2 个末端伪重复序列排列成 U 形支架。 RNA结合的Nop9结构在不对称单元中包含2个复合物。 两种复合物在局部结构和RNA-蛋白质相互作用方面高度相似,但它们的整体形状略有不同。 RNA结合后Nop9结构变得更加紧凑,不对称单元中的2个Nop9-RNA复合物显示出略有不同的曲率。 靶RNA的11个核苷酸的Nop9结合序列结合在Nop9结构的内表面,并被Nop9中的2段pumilio重复序列以二分方式识别,而结合序列的3个中心碱基未被识别。

▼ 测绘

Gross(2019) 根据 NOP9 序列(GenBank BC025332) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 NOP9 基因对应到染色体 14q12。