尿调节蛋白样1; UMODL1

HGNC 批准的基因符号:UMODL1

细胞遗传学位置:21q22.3 基因组坐标(GRCh38):21:42,062,876-42,142,995(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

Shibuya 等人通过计算机分析鉴定了 21 号染色体耳聋关键区域(601702) 中的基因,然后进行 PCR 以及胎儿肾脏、胎儿胸腺和睾丸 cDNA 的 5-prime 和 3-prime RACE(2004)克隆了 UMODL1 的 2 个剪接变体,他们将其命名为 UMODL1L 和 UMODL1S。 推导的 1,374 个氨基酸的 UMODL1L 蛋白具有非常规的乳清酸性蛋白(WAP) 结构域; 3 个钙结合 EGF 样(EGF-CA) 结构域; 2 个纤连蛋白(135600) 3 型(FN3) 结构域; 海胆精子蛋白、肠激酶(PRSS7; 606635) 和集聚蛋白(AGRN; 103320)(SEA) 结构域; 透明带(ZP)结构域; 3个跨膜结构域; 复杂性较低的中心区域; 和 4 个 PEST 图案。 推导的 1,246 个氨基酸的 UMODL1S 蛋白与 UMODL1L 相同,只是它缺少跨膜结构域 2 之后的低复杂性中心区域。 UMODL1L 和 UMODL1S 的 C 端半部分与尿调节素(UMOD; 191845) 具有相似性。 Northern 印迹分析未检测到 UMODL1 表达。 RT-PCR 显示 UMODL1L 在睾丸中表达最高,在肾脏和胎儿胸腺中表达较低,在其他检查组织中几乎没有表达。 RT-PCR显示UMODL1S在睾丸中表达最高,在前列腺和胎儿胸腺中表达较低,在其他组织中很少或没有表达。 几种 UMODL1 剪接变体在睾丸中表达,但都含有提前终止密码子。 荧光标记的 UMODL1L 和 UMODL1S 在转染的 HEK293 细胞的细胞质中表达。

▼ 基因结构

涩谷等人(2004) 确定 UMODL1 基因至少包含 23 个外显子,跨度约为 80 kb。

▼ 测绘

通过基因组序列分析,Shibuya 等人(2004) 将 UMODL1 基因定位到染色体 21q22.3。