黑色素瘤抗原,D 族,4; MAGED4

  • MAGEE1
  • KIAA1859

HGNC 批准的基因符号:MAGED4

细胞遗传学定位:Xp11.22 基因组坐标(GRCh38):X:52,184,887-52,192,267(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

通过基因表达的系列分析(SAGE),Sasaki 等人(2001) 鉴定出 MAGED4,他们称之为 MAGEE1,是一种在胶质母细胞瘤中相对于星形胶质细胞高度表达的基因。 通过PCR和5-prime RACE,他们克隆了3个剪接变体,分别含有741、739和414个氨基酸,共享N端348个氨基酸。 除了最后 2 个 C 端氨基酸外,2 个较长的异构体是相同的。 414 个氨基酸同工型具有独特的 66 个氨基酸尾部。 这 2 个长亚型与 MAGED1(300224) 在 421 至 600 个氨基酸上具有 78.3% 的酸同一性。Northern 印迹分析检测到 3-kb 转录物仅在人胶质瘤细胞系、原发性胶质母细胞瘤、正常脑和卵巢中表达,在睾丸或胎盘中没有表达。 RT-PCR 分析检测到神经胶质瘤中 2 种长亚型的表达,而短亚型在所有检查的肿瘤样本中都有表达。

Nagase 等人通过寻找编码胎儿大脑中表达的大蛋白质的序列(2001) 鉴定了编码 MAGED4 的部分 cDNA,他们将其命名为 KIAA1859。

通过 RT-PCR 分析,Chomez 等人(2001) 在所有检查的正常组织和肿瘤组织中检测到可变的 MAGED4 表达。 数据库分析揭示了 3 个小鼠 MAGED 基因,但没有 MAGED4 的直系同源物。

Ito 等人使用免疫荧光显微镜(2006) 发现 MAGED4 位于 A549 肺癌细胞的细胞骨架丝附近。 从末期到有丝分裂后阶段,MAGED4 相对于 β-微管蛋白更集中地集中在中央纺锤体和中体(TUBB; 191130)。

▼ 基因功能

Ito 等人使用免疫组织化学和 RT-PCR(2006)发现MAGED4在非小细胞肺癌中表达上调,但MAGED4在正常肺组织中不表达。 但不同病理阶段MAGED4表达无显着差异。 在MAGED4水平高的肿瘤中,肿瘤细胞的增殖活性显着更高。

▼ 基因结构

河野等人(2001)确定MAGED4基因包含13个外显子。 外显子 2、3 和 12 的选择性剪接产生至少 3 个亚型。 启动子区域包含 Sp1 和 AML1a 的转录因子结合位点(RUNX1; 151385)。 无法识别出传统的 TATA 框或 CCAAT 框,但识别出了以转录起始位点为中心的 CpG 岛。

▼ 测绘

通过辐射混合分析,Kawano 等人(2001) 将 MAGED4 基因定位到染色体 Xp11,与 MAGED2(300470) 位于同一基因座。 MAGED4 基因的几乎完全相同的重复,称为 MAGED4B(300765),也位于染色体 Xp11 上,并且 2 个拷贝相距约 116 kb(Hartz, 2009)。