信号识别颗粒,19-KD; SRP19

HGNC 批准的基因符号:SRP19

细胞遗传学位置:5q22.2 基因组坐标(GRCh38):5:112,861,286-112,898,370(来自 NCBI)

▼ 描述

SRP19 在信号识别颗粒(SRP) 的组装中发挥重要作用,信号识别颗粒是一种普遍保守的核糖核蛋白复合物,可介导分泌蛋白和膜蛋白向细胞膜的共翻译靶向。SRP19 与核仁中已有的游离 SRP RNA 结合,这是真核生物中 SRP54(604857) 与 SRP RNA 螺旋 8 结合的先决条件(Wild 等人总结,2001)。

▼ 克隆和表达

Lingelbach 等人通过使用抗 SRP19 探针筛选肝脏 cDNA 文库(1988) 分离出编码 144 个氨基酸蛋白质的人类 SRP19 cDNA。序列分析表明,SRP19 包含一个非常基本的 C 端结构域,由 7 个赖氨酸残基组成,中间间隔 2 个甘氨酸残基。Northern 印迹分析揭示了 HeLa 细胞中 0.9 kb 转录物的表达。SDS-PAGE 分析表明,SRP19 表达为 19 kD 蛋白,大小与犬 SRP19 相同。功能分析确定 SRP19 蛋白与犬胰腺中的 7SL RNA 结合。

▼ 基因结构

Groden 等人(1991)确定SRP19基因由5个外显子组成。

▼ 基因功能

Joslyn 等人鉴定出 2 个 100 至 260 kb 的小嵌套缺失(1991) 在患有腺瘤性结肠息肉病(APC; 175100) 的患者中,Groden 等人(1991) 在 5 号染色体上约 100 kb 的范围内鉴定出 3 个基因。其中之一是 DP1(125265);第二个是 APC 中的突变基因,被称为 DP2.5(611731)。第三个是被发现与SRP19具有相同序列的基因。堀井等人(1993) 不仅讨论了 APC 基因内的选择性剪接的发生,而且还讨论了 APC 基因和邻近的 SRP19 基因之间的选择性剪接的发生。

▼ 基因家族

信号识别颗粒(SRP)是一种核糖核蛋白复合物,介导蛋白质靶向内质网(ER)。该复合物由 7S(或 7SL)RNA 和 6 种不同的蛋白质组成:SRP9(600707)、SRP14(600708)、SRP19、SRP54、SRP68(604858) 和 SRP72(602122)。这些蛋白质以单体(SRP19 和 SRP54)或异二聚体(SRP9/SRP14 和 SRP68/SRP72)形式与 7S RNA 结合。SRP9 和 SRP14 与 SRP 的 Alu 结构域结合,而其他 4 个蛋白属于 S 结构域。SRP 至少具有 3 个与蛋白质亚基相关的不同功能:信号识别、翻译停滞以及通过与对接蛋白相互作用实现 ER 膜靶向(Lingelbach 等人总结,1988)。

有关信号识别粒子数据库的信息,请参阅 Larsen 等人(1998)。

▼ 生化特征

晶体结构

野生等人(2001) 报道了人 SRP19 与其在 SRP RNA 螺旋 6 上的主要结合位点复合的 1.8 埃分辨率晶体结构,该复合物由由不寻常的 GGAG 四环闭合的茎环结构组成。蛋白质-RNA 相互作用是由加宽的主沟和四环的特异性识别介导的,没有任何直接的蛋白质碱基接触,并且包括高度有序的水分子的复杂网络。野生等人(2001)基于晶体学和生化数据提出了由SRP19、SRP54和SRP RNA组成的SRP核心组装模型。

冷冻电子显微镜

哈利克等人(2004) 提出了靶向复合物的结构,该复合物由与携带信号序列的活性 80S 核糖体结合的哺乳动物 SRP 组成。这种结构通过冷冻电子显微镜确定为 12 埃分辨率,使 Halic 等人得以实现(2004) 生成 SRP 功能构象的分子模型。该模型显示了 SRP 的 S 结构域如何在新生链出口位点接触大核糖体亚基以结合信号序列,以及 Alu 结构域如何进入核糖体的延伸因子结合位点,解释了其延伸抑制活性。

▼ 测绘

SRP19 基因定位于染色体 5q21-q22,位于 DP1(125265) 和 APC(611731) 基因之间(Groden et al., 1991)。