类克鲁伯因子 17; KLF17

  • 锌指蛋白 393; ZNF393

HGNC 批准的基因符号:KLF17

细胞遗传学定位:1p34.1 基因组坐标(GRCh38):1:44,043,926-44,135,139(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

通过小鼠 EST 文库的指趾差异显示分析,Yan 等人(2002) 鉴定了小鼠 Znf393。 它编码 341 个氨基酸的蛋白质,包含富含脯氨酸和丝氨酸的 N 末端、核定位信号以及 C 末端的 3 个 C2H2 锌指。 Northern 印迹和 RT-PCR 分析显示 2.5 kb 转录物在睾丸和卵巢中表达,1.4 kb 转录物仅在睾丸中表达。 原位杂交分析显示 Znf393 在睾丸中发育的精子细胞和卵巢中生长的卵母细胞中表达。

van Vliet 等人通过使用 KLF3(609392) 的 DNA 结合域作为查询来搜索 EST 数据库,然后对基因组 DNA 进行 PCR(2006) 克隆了编码 ZNF393 的全长人类 cDNA,他们将其称为 KLF17。 推导的 389 个氨基酸蛋白含有 3 个 C 端 Kruppel 样锌指,是 KLF 转录因子家族的特征。 人类和小鼠 ZNF393 总体相似性仅为 54.8%,尽管它们的锌指具有 81.5% 的相似性,包括所有锌螯合半胱氨酸和组氨酸残基的严格保守性。 EST数据库分析表明ZNF393在睾丸、大脑和骨骼中表达。

▼ 基因功能

通过电泳迁移率变动分析,van Vliet 等人(2006) 发现 KLF17 结合 β-珠蛋白(141900) 启动子中的 CACCC 框,但不结合 γ-珠蛋白(参见 142250) 启动子中的变体 CACCC 框。 在报告基因检测中,KLF17 激活 β-珠蛋白 CACCC 框的转录。

古米雷迪等人(2009)表明转录调节因子KLF17和ID2(600349)在人和小鼠乳腺肿瘤细胞系以及原发性人乳腺癌中呈反向表达,其中KLF17主要在低转移潜力的细胞和肿瘤中表达,ID2主要在高转移潜力的细胞和肿瘤中表达。 电泳迁移率变动、染色质免疫沉淀和报告基因检测表明,小鼠 Klf17 直接与小鼠 Id2 基因 5 素 UTR 中 2 个 CACCC 框中的 1 个结合,并抑制其表达。 通过短发夹 RNA 敲低 KLF17 会导致上皮间质转化并增加体内转移,而 KLF17 和 ID2 的双重敲低使这些效应正常化。

▼ 基因结构

范弗利特等人(2006) 确定 ZNF393 基因包含 4 个外显子,跨度约为 15 kb。 外显子 4 指定 3 素数 UTR。 严等人(2002) 表明小鼠 Znf393 包含 3 个外显子,跨度约为 8 kb。

▼ 测绘

通过基因组序列分析,van Vliet 等人(2006) 将 ZNF393 基因定位到染色体 1p34.1。 他们在 12 号染色体上发现了一个加工过的假基因。

严等人(2002) 将小鼠 Znf393 定位到远端染色体 4。