胰岛素样生长因子 2 mRNA 结合蛋白 2; IGF2BP2

  • IGF2 mRNA 结合蛋白 2;内啡肽2

HGNC 批准的基因符号:IGF2BP2

细胞遗传学位置:3q27.2 基因组坐标(GRCh38):3:185,643,129-185,825,045(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

尼尔森等人(1999) 从横纹肌肉瘤(268210) 细胞系 RD 中纯化了几种 IMP 蛋白,这些蛋白与 IGF2(147470) 5-prime 非翻译区中的前导 3 mRNA 结合。他们使用根据 IMP1(IGF2BP1;608288)的胰蛋白酶片段设计的简并引物对总 RD mRNA 进行 RT-PCR,然后对胎盘 cDNA 文库进行 PCR,克隆了 IMP2。推导的 598 个氨基酸蛋白质的计算分子量为 66 kD。IMP2包含6个特征性RNA结合模块,包括2个N​​端RRM结构域和4个中央和C端KH结构域。它与 IMP1 和 IMP3(IGF2BP3; 608259) 具有 59% 的氨基酸同一性。Northern blot 分析检测到成年小鼠组织中没有 Imp1、Imp2 或 Imp3 的表达。然而,小鼠胚胎的 Northern 印迹分析显示,所有 3 个 Imp 转录本的表达在胚胎第 12 天达到峰值。5 并在出生前下降。RNA斑点印迹分析检测到人胎肝、肺、肾、胸腺和胎盘中IMP2表达,其中胎肝中表达量最高。

通过使用肝细胞癌(114550) 自身抗体对 HepG2 和膀胱癌 cDNA 表达文库进行免疫筛选,然后对结直肠腺癌细胞系 cDNA 文库进行 5-prime RACE,Zhang 等人(1999) 克隆了 IMP2,他们将其称为 p62。推导的 556 个氨基酸蛋白质的计算分子量为 62 kD。体外翻译的 IMP2 cDNA 的蛋白质印迹分析证实分子量为 62 kD。IMP2 与 IMP3 具有 66.5% 的氨基酸同一性。Northern 印迹分析在大多数检查组织中检测到 3.7 和 5.2 kb 的转录本,其中心脏、胎盘、骨骼肌和胰腺中的水平最高。骨骼肌转录本比 3.7 kb 转录本迁移得更慢。在几种癌细胞系中也检测到高水平的 3.7-kb 转录物。

▼ 基因功能

通过迁移率变化分析,Nielsen 等人(1999) 证实 IMP2 结合 IGF2 前导序列 3 mRNA。

布兰茨等人(2004) 表明,在 Hmga2(600698) 缺失的小鼠胚胎中,Imp2 表达下调,但 Hmga2 缺失对 Imp1 或 Imp3 的表达没有影响。

▼ Mapping

Gross(2015) 根据 IGF2BP2 序列(GenBank BC021290) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 IGF2BP2 基因对应到染色体 3q27.2。

▼ 分子遗传学

哈佛大学、麻省理工学院博德研究所、隆德大学和诺华生物医学研究所的糖尿病遗传学计划(2007) 分析了 1,464 名 2 型糖尿病患者(参见 125853)和 1,467 名匹配对照者的 386,731 个常见 SNP,每个对照都针对葡萄糖代谢、血脂、肥胖和血压进行了表征。该小组与芬兰-美国 NIDDM 遗传学调查(FUSION) 和 Wellcome Trust 病例控制联盟/英国 2 型糖尿病遗传学联盟(WTCCC/UKT2D) 合作,在 IGF2BP2 的第二个内含子中鉴定并确认了与 2 型糖尿病相关的基因座。rs4402960 的证据在初始扫描中较弱(P = 0.034),但在复制样本中很明显(P = 5.5 x 10(-9))。对于相同的 SNP、表型、

Zeggini 等人从 Wellcome Trust 病例对照联盟(2007) 生成的 1,924 例糖尿病病例和 2,938 例人群对照的全基因组基因型数据开始(2007) 通过分析 3,757 个额外病例和 5,346 个对照,并将其发现与其他国际联盟的同等数据相结合,着手检测重复的糖尿病关联信号。所有研究的综合证据(P 约等于 8.6 x 10(-16))确定 rs4402960 是真正的 2 型糖尿病易感基因座。

Scott 等人采用全基因组关联策略(2007) 对 1,161 名芬兰 2 型糖尿病病例和 1,174 名芬兰正常耐糖对照进行了基因分型,其中包含超过 315,000 个 SNP,并估算了超过 200 万个额外常染色体 SNP 的基因型。作者对这些 SNP 进行了关联分析,以确定易患 2 型糖尿病的遗传变异,将其 2 型糖尿病关联结果与哈佛大学、麻省理工学院、隆德大学、诺华生物医学研究所的糖尿病遗传学计划(2007) 和 Wellcome Trust 病例对照联盟(2007) 的糖尿病遗传学计划的结果进行了比较,并对另外 1,215 例芬兰 2 型糖尿病病例和 1 例中的 80 个 SNP 进行了基因分型。 ,258 芬兰正常葡萄糖耐量对照。

▼ 等位基因变异体(1 个选定示例):.

0001 2 型糖尿病,对
IGF2BP2 的易感性,rs4402960
在 2 型糖尿病的全基因组关联研究中(125853),哈佛和麻省理工学院博德研究所、隆德大学和诺华生物医学研究所的糖尿病遗传学计划(2007),Zeggini 等等人(2007)和斯科特等人(2007) 发现 rs4402960 的 T 等位基因增加了对 2 型糖尿病的易感性。组合分析获得的 P 值为 8.9 x 10(-16)。