含有 FERM、ARHGEF 和 血小板-白细胞C 激酶底物 结构域的蛋白质 2; FARP2

  • FGD1相关的CDC42鸟嘌呤核苷酸交换因子;FRG
  • 血小板-白细胞C 激酶底物 同源结构域蛋白,C 族,成员 3;PLEKHC3
  • 包含 RHO 鸟嘌呤核苷酸交换因子的 FERM 结构域;FIR KIAA0793

HGNC 批准的基因符号:FARP2

细胞遗传学位置:2q37.3 基因组坐标(GRCh38):2:241,356,284-241,494,840(来自 NCBI)

▼ 描述

FARP2 充当小 GTP 酶(如 RAC1(602048))的鸟嘌呤核苷酸交换因子(GEF),并在调节肌节蛋白细胞骨架中发挥作用(Kubo 等人,2002)。

▼ 克隆和表达

通过对从尺寸分级的人脑 cDNA 文库中获得的克隆进行测序,Nagase 等人(1998) 克隆了 FARP2,他们将其命名为 KIAA0793。推导的 1,054 个氨基酸蛋白与 CDEP(FARP1; 602654) 具有显着的同一性。RT-PCR ELISA 检测到所有 10 个人体组织中都有 KIAA0793 表达。

Kubo 等人使用 Rho GEF(参见 601855)的 DBL(MCF2;311030)同源(DH)域来搜索数据库(2002) 确定了 FARP2,他们将其称为 FIR。推导的 1,055 个氨基酸蛋白质的计算分子量为 117 kD。它具有一个 N 端 FERM 结构域,随后是一个 DH 结构域和 2 个 血小板-白细胞C 激酶底物(PLEK; 173570) 同源(PH) 结构域。推导的 1,065 个氨基酸的小鼠直系同源物与人类 FIR 具有 83% 的氨基酸同一性。对 8 个小鼠组织的 Northern 印迹分析检测到大约 8 kb Fir 转录本,该转录本在脑、肺和睾丸中表达最高。RT-PCR 检测分离的大鼠皮质和海马神经元中 Fir 的表达。

宫本等人(2003) 报道 FRG 在其 FERM 和 DH 结构域之间具有富含脯氨酸的区域,并且 FRG 的催化 DH 结构域与 FGD1(300546) 具有显着的序列相似性。

▼ 基因功能

Kubo 等人(2002) 发现 FIR 的分离 DH 结构域在体外促进 RAC1 的核苷酸交换,但不促进 RHOA(165390) 或 CDC42(116952)。FIR 的 DH 结构域和第一个 PH 结构域在转染的 HEK293 细胞中显示出 GEF 活性。FERM 结构域将 FIR 定位于细胞质灶。FIR 在 NIH3T3 小鼠成纤维细胞中的表达导致板状伪足和褶边的发育,表明 Rac1 激活。大鼠皮质神经元中 FIR 的过度表达增强了神经突的生长和多个侧向生长锥的发育,其中一些生长锥来自细胞体。组成型活性 RAC1 突变体的表达也会引起神经突生长,而显性失活 RAC1 突变体则阻断 FIR 对神经突生长的影响。

宫本等人(2003) 发现分离的人类 FARP2 的 DH 和 PH 片段(他们称之为 FRG)促进了 CDC42 上的核苷酸交换,但不促进 RHOA 或 RAC1 上的核苷酸交换。使用 HEK293 细胞,他们表明 FRG 在由内皮素受体 A(EDNRA; 131243) 激活启动的信号传导通路中发挥核心作用,最终导致 JNK(MAPK8; 601158) 依赖性细胞运动抑制。该途径还涉及 FRG 在其 FERM、富含脯氨酸、DH 和第一个 PH 结构域内的 SRC(190090) 依赖性酪氨酸磷酸化,这激活了 FRG 对 CDC42 的 GEF 活性。

▼ Mapping

Hartz(2017) 根据 FARP2 序列(GenBank AB018336) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 FARP2 基因对应到染色体 2q37.3。