PBX/打结 1 个 同源基因 2; PKNOX2

  • PBX 调节蛋白 2;PREP2

HGNC 批准的基因符号:PKNOX2

细胞遗传学位置:11q24.2 基因组坐标(GRCh38):11:125,164,750-125,433,388(来自 NCBI)

▼ 描述

同源域蛋白是序列特异性转录因子,它们共享高度保守的 DNA 结合域,在细胞增殖、分化和死亡中发挥重要作用。PKNOX2 属于 TALE(3 个氨基酸环延伸)类同源域蛋白,其特征是同源域内 α 螺旋 1 和 2 之间有 3 个氨基酸延伸(Imoto 等,2001)。

▼ 克隆与表达

Imoto 等人通过在数据库中搜索与 PKNOX1(602100) 相似的序列,然后对人脑 mRNA 进行 RT-PCR(2001)克隆了PKNOX2。推导的 460 个氨基酸蛋白质的计算分子量为 50.8 kD。PKNOX2 包含 2 个 N 端区域 HR1 和 HR2,与 PKNOX1 和 MEIS 蛋白中的区域同源(参见 601739),随后是 TALE 家族成员的非典型同源域特征和 C 端富含赖氨酸的核定位信号。PKNOX1 和 PKNOX2 的同源域具有 94% 的同一性。Northern 印迹分析检测到 4.6 kb PKNOX2 转录本。在脑和骨骼肌中表达最高,在胰腺、肺、心脏、肾、小肠、胸腺、脾和肾中表达中等,在结肠、肝脏和外周血白细胞中表达非常低。PKNOX2 的表达模式与 PKNOX1 不同,表明这些蛋白质具有不同的作用。表位标记的 PKNOX2 在转染的 COS-7 细胞的细胞核中表达,但在核仁中不表达。

Fognani 等人通过 RT-PCR 检测人类胎儿 mRNA(2002) 克隆了 PKNOX2,他们将其称为 PREP2。推导的蛋白质含有461个氨基酸。Northern 印迹分析显示 4 kb PREP2 转录物在心脏、大脑、骨骼肌和卵巢中表达最高。在胎盘、肺、胰腺、前列腺、睾丸和小肠中检测到较低表达,在肝、肾、脾、胸腺、结肠和外周血白细胞中未检测到表达。在睾丸中也检测到了 7 至 8 kb 的转录本。体外合成的PREP2的表观分子质量为70 kD。在缺乏 PBX1(176310) 的情况下,表位标记的 PREP2 主要在转染的小鼠成纤维细胞和昆虫细胞的细胞质中表达。

哈勒等人(2004) 克隆了小鼠 Prep2 的多个剪接变体,编码的亚型在 N 端和 C 端有所不同。使用识别全长 Prep2 的 N 端或 C 端半部的抗体对小鼠胚胎和几种哺乳动物细胞系进行蛋白质印迹和免疫组织化学分析,检测到 N 末端位于细胞质中的蛋白质和 C 末端位于细胞核中的蛋白质。

▼ 基因功能

Fognani 等人(2002) 表明,当与 2 种 PBX1 同种型 PBX1a 或 PBX1b 共表达时,PREP2 结合含有 PREP1-PBX 复合物结合位点的合成 DNA 序列。类似地,当与 HOXB1(142968) 和 PBX1a 共表达时,PREP2 结合来自 Hoxb2(142967) 基因增强子的寡核苷酸。PREP2 还可以与 HOXB1 和 PBX1b 形成三元复合物。然而,与 PREP1 不同,PREP2 的共表达降低了 HOXB1-PBX1 复合物的报告基因活性。福格纳尼等人(2002) 得出结论,PREP2 与 PREP1 一样,识别序列 TGACAG,并且可以将该序列与 PBX1 和 HOXB1 结合成三元复合物。

Haller 等人使用用表位标记构建体转染的小鼠成纤维细胞(2004) 表明小鼠 Prep2 的 N 末端结构域与细胞骨架元件相互作用,包括有丝分裂所有阶段的微管。免疫共沉淀分析表明 Prep2 的 N 末端也与 F-肌节蛋白和 G-肌节蛋白相互作用(参见 102610)。在某些条件下,肌节蛋白或微管细胞骨架元件的破坏导致表位标记的 Prep2 剂量依赖性重新定位到细胞核,包括核仁。

▼ 基因结构

Imoto 等人(2001) 确定 PKNOX2 基因至少包含 10 个外显子。福格纳尼等人(2002) 报道 PKNOX2 基因跨度约为 50.7 kb。

使用 FISH 进行绘图,Imoto 等人(2001) 将 PKNOX2 基因定位到染色体 11q24-q25。