mRNA 1A 脱帽； DCP1A

开盖酶 1，酿酒酵母，A 的同源物
DCP1，酿酒酵母，A 的同源物
SMAD4-相互作用转录因子； SMIF

HGNC 批准的基因符号：DCP1A

细胞遗传学定位：3p21.1 基因组坐标（GRCh38）：3:53,283,428-53,347,542（来自 NCBI）

▼ 说明

DCP1A 是 mRNA 脱帽复合物的核心成分，是调节 mRNA 衰减的关键因素（Lykke-Andersen, 2002）。 DCP1A 也是 SMAD4（600993）的反式激活因子，并参与 TGF-β（190180）信号通路（Bai et al., 2002）。

▼ 克隆与表达

Bai 等人以 SMAD4 作为诱饵，对人胰腺 cDNA 文库进行酵母 2 杂交筛选（2002）克隆了 DCP1A，他们将其称为 SMIF。推导的蛋白质含有582个氨基酸。 Northern 印迹分析在所有检查的组织中检测到 7 kb 转录物。蛋白质印迹分析揭示了几种哺乳动物细胞系中存在 70 kD 的蛋白质。白等人（2002）还从 17 天胚胎 cDNA 文库中克隆了小鼠 Smif。人类和小鼠蛋白质的总体序列同一性为 90%，N 端 Smad4 结合区的序列同一性为 98%。

通过搜索与酿酒酵母 Dcp1 相似的基因，Lykke-Andersen（2002）鉴定了 2 个远缘人类同源物：DCP1A 和 DCP1B（609843）。表位标记的 DCP1A 定位于点状细胞质灶，并带有一些核染色。

▼ 基因功能

白等人（2002）发现 SMIF 与 SMAD4 特异性相互作用，而不与任何其他 SMAD 蛋白相互作用。通过缺失分析，他们确定 SMIF 的 N 端 100 个氨基酸以及 SMAD4 的残基 tyr/phe301 和 trp302 是这种相互作用所必需的。共转染实验表明，用 TGF-β 或骨形态发生蛋白 4（BMP4；112262）处理会导致 SMAD4/SMIF 相互作用，随后导致它们的核转位和积累。在 SMAD4 不存在的情况下，SMIF 仍保留在胞质中。 Bai 等人使用几种瞬时报告基因检测来监测 TGF-β 依赖性转录活性（2002）确定 SMAD4/SMIF 复合物是转录单位，因为单独的蛋白质都没有活性。通过使用缺失突变，他们发现 SMIF 的反式激活结构域与 N 端 SMAD4 结合结构域分开，并定位于氨基酸 124-390。

Lykke-Andersen（2002）发现 DCP1A 和 DCP2（609844）以不依赖于 RNA 的方式在 mRNA 脱帽复合物中直接相互作用。与 N 端 GST 标签融合的重组 DCP1A 在脱帽活性中无活性，但在人胚胎肾细胞中表达的 FLAG 标签的 DCP1A 具有活性。 asn20 和 arg59 的突变使 DCP1A 脱帽活性分别降低 4 倍和 12 倍，并且这两种突变都会导致蛋白质稳定性降低。免疫共沉淀分析表明，无论是否存在其他 UPF 蛋白，DCP1A 和 DCP2 都会与无义介导的衰变因子 UPF1（RENT1; 601430）相互作用。 Lykke-Andersen（2002）得出结论，UPF 蛋白可能会将人类脱帽复合物募集到含有过早终止密码子的 mRNA 上。

Fenger-Gron 等人使用质谱法（2005）发现 EDC3（YJDC; 609842）、RCK（DDX6; 600326）和 HEDLS（RCD8; 606030）与来自 HEK293 细胞裂解物的 DCP1A 和 DCP2（609844）进行共免疫纯化。 HeLa 细胞中 DCP2、RCK 或 EDC3 的过度表达减少了内源性 DCP1A 和 XRN1（607994）与细胞质加工体的关联。过表达的 DCP1A 和 DCP2 相互作用需要 HEDLS。

▼ 测绘

国际辐射混合测绘联盟将 SMIF 基因定位到 3 号染色体（SGC34070）。