含溴相邻同源结构域蛋白 1; BAHD1

  • BAH 结构域蛋白 1
  • KIAA0945

HGNC 批准的基因符号:BAHD1

细胞遗传学位置:15q15.1 基因组坐标(GRCh38):15:40,439,756-40,468,236(来自 NCBI)

▼ 说明

BAHD1 参与异染色质形成并与雌性细胞中不活跃的 X 染色体(Xi) 相关(Bierne et al., 2009)。

▼ 克隆与表达

Nagase 等人通过对从按大小分级的成人脑 cDNA 文库获得的克隆进行测序,(1999)克隆了 BAHD1,他们将其命名为 KIAA0945。 推导的蛋白质含有779个氨基酸。 RT-PCR ELISA 检测到卵巢中 BAHD1 的表达量最高,而在所有其他检查组织中表达量低得多,几乎一致。 在胎儿大脑中检测到最低表达。

使用 PCR,Bierne 等人(2009) 从人类细胞系中克隆了 BAHD1。 推导的蛋白质包含一个大的 N 端富含脯氨酸结构域、一个中央核定位信号和一个 C 端溴邻同源(BAH) 结构域。 表位或荧光标记的 BAHD1 定位于转染细胞的细胞核,并在过表达时与异染色质的电子密集斑块相关。

▼ 基因功能

Bierne 等人使用蛋白质下拉分析(2009) 表明表位标记的 BAHD1 与 HP1-α(CBX5; 604478) 和 MBD1(156535) 相互作用。 HP1-α 和 MBD1 分别通过结合甲基化组蛋白 H3(参见 602810)和甲基化 DNA,在抑制性染色质的形成中发挥关键作用。 荧光标记的 BAHD1 的过度表达导致 BAHD1 在异染色质位点积累,同时 HP1-α 募集到这些 BAHD1 相关位点。 BAHD1 异染色质灶主要与 lys27 上三甲基化的组蛋白 H3(H3K27me3) 重叠,这是兼性异染色质的一个特定特征,但很少与在组成型异染色质中发现的 H3K9me3 重叠。 BAHD1 还与女性细胞中的 Xi 共定位。 C 端 BAH 结构域的删除干扰了 BAHD1 与 H3K27me3 在雄性细胞和雌性细胞核焦点处的共定位(Xi 除外)。 微阵列分析鉴定出 192 个转录物通过小干扰 RNA 敲低 HEK293 细胞中的 BAHD1 诱导至少 1.4 倍。 一半的靶标与细胞死亡、细胞生长和增殖以及癌症有关,包括 IGF2(147470),这是 BAHD1 耗竭后上调程度最高的基因。 HEK293 细胞中的染色质免疫沉淀显示 BAHD1 结合 IGF2 启动子 3 上游的 2 个 CpG 岛,并抑制 IGF2 及其反义转录物 IGF2AS 的表达(610146)。 BAHD1 过表达还将 MBD1 和 HDAC5(605315) 招募到 IGF2 启动子 3 上游富含 CpG 的区域。HEK293 细胞核提取物的共免疫沉淀和蛋白质印迹分析表明,表位标记的 BAHD1 与 SP1(189906)、MBD1 和 HDAC5 相互作用。 比尔恩等人(2009) 得出结论,BAHD1 通过招募参与异染色质组装的蛋白质来充当沉默子。

莱布雷顿等人(2011) 发现分泌的李斯特菌毒力因子 LntA 可以靶向宿主细胞核中的染色质阻遏蛋白 BAHD1,从而激活干扰素刺激的基因。 缺乏 LntA 的细菌感染上皮细胞时,会诱导 IFN-lambda(IFNL1;607403)表达; 然而,BAHD1-染色质相关复合物抑制了下游干扰素刺激的基因。 相反,在感染表达 LntA 的细菌的细胞中,LntA 阻止 BAHD1 募集到干扰素刺激的基因并刺激其表达。 BAHD1 杂合子小鼠或 LntA 组成型表达时,小鼠李斯特菌病减少。 因此,莱布雷顿等人(2011) 得出结论,LntA-BAHD1 相互作用可能调节 IFN-lambda 介导的免疫反应,以控制宿主的细菌定植。

▼ 测绘

通过辐射杂交分析,Nagase 等人(1999) 将 BAHD1 基因对应到 15 号染色体。Hartz(2011) 根据 BAHD1 序列(GenBank AB023162) 与基因组序列(GRCh37) 的比对,将 BAHD1 基因对应到染色体 15q15.1。