肽基-脯氨酰异构酶G; PPIG

  • CYCLOPHILIN G

HGNC 批准的基因符号:PPIG

细胞遗传学位置:2q31.1 基因组坐标(GRCh38):2:169,584,342-169,641,405(来自 NCBI)

▼ 正文

肽基-脯氨酰顺/反异构酶蛋白家族(PPIases) 包括亲环蛋白、FK506 结合蛋白(例如 FKBP1A;186945)和小鸟蛋白(例如 PIN4、300252)亚家族。 亲环蛋白与蛋白质的折叠、转移和组装有关。

▼ 克隆与表达

Nestel 等人使用酵母 2 杂交筛选来鉴定与 Clk(CLK1; 601951) 相互作用的蛋白质(1996) 分离出小鼠基因的部分克隆,他们将其称为 CARS-Cyp。 通过用小鼠克隆筛选胸腺 cDNA 文库,他们组装了人类同源物 PPIG 的全长 cDNA。 Bourquin 等人使用酵母 2 杂交筛选来鉴定与 RNA 聚合酶 II(POLR2A;180660) 最大亚基的磷酸化 C 末端结构域(CTD) 相互作用的蛋白质(1997) 从 B 淋巴细胞 cDNA 文库中孤立克隆了 PPIG,他们将其称为 SRcyp/CASP10。 PPIG 预计编码一种 754 个氨基酸的蛋白质,其中包含 2 个 Nopp140(140 kD 的核仁磷蛋白)相关结构域和一个主要存在于前 mRNA 剪接因子中的大型 C 端富含丝氨酸/精氨酸(SR) 的结构域。 PPIG 的 N 末端区域包含亲免素/亲环素特征性的肽基-脯氨酰顺反异构酶结构域。 PPIG 与 NKTR(161565)(一种骨髓特异性核蛋白)具有 37.8% 的序列同一性。 通过 Northern 印迹分析,Nestel 等人(1996) 在肺、肝、肾、小肠、睾丸和脑中检测到 PPIG 表达水平相似。 他们在人类 B 细胞 RNA 中检测到主要 4 kb 和次要 10 kb PPIG 转录本。 尽管 PPIG 广泛表达,但 NK 细胞中似乎不存在 PPIG。 通过 Northern blot 分析,Bourquin 等人(1997) 检测到广泛表达的单个 3.0-kb PPIG 转录物。

Bourquin 等人使用缺失突变体分析(1997) 确定在酵母 2 杂交检测中,PPIG 的 SR 结构域是与 POLR2A 的 CTD 相互作用所必需的。 使用 GST 融合蛋白,他们证实 PPIG 直接与 CTD 相互作用。 通过免疫染色,他们证明 PPIG 分布在核斑点(富含剪接因子的核区室)中,并与剪接因子 SC35(SFRS2;600813)共定位。 他们得出的结论是,PPIG 可能是结合 CTD 的剪接因子复合物的一个组成部分,从而将 RNA 加工与转录联系起来。

▼ 测绘

国际辐射混合测绘联盟将 PPIG 基因测绘到 2 号染色体(SHGC-33882)。