SUSHI、VON Willebrand 因子 A 型、EGF 和 五聚环蛋白 结构域 1; SVEP1

  • POLYDOM
  • 选择素样成骨细胞衍生的蛋白质; SELOB

HGNC 批准的基因符号:SVEP1

细胞遗传学位置:9q31.3 基因组坐标(GRCh38):9:110,365,247-110,579,740(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

Gilges 等人通过在小鼠骨髓 cDNA 文库中筛选 EGF(131530) 样结构域(2000) 克隆了小鼠 Svep1,他们将其称为 Polydom。 Svep1 转染的 COS-7 细胞表达超过 400 kD 的蛋白质,与 N-糖基化一致。 人体组织的 Northern 印迹分析检测到胎盘中的表达,而在其他组织中检测到很少或没有表达。 在小鼠肺和胎盘中检测到高水平的 Svep1 表达,并且在小鼠胚胎中从交配后第 11 天到交配后第 17 天可检测到 Svep1 mRNA。 对造血细胞和基质细胞系的 RT-PCR 分析检测到,除了在小鼠骨髓基质贴壁层、小鼠成纤维细胞和 3 种基质细胞系中高表达外,大多数细胞系中几乎没有表达或没有表达。

Shur 等人通过 PCR 检测人骨髓基质细胞 RNA(2006) 克隆了 SVEP1,他们将其称为 SELOB。 SVEP1 与其小鼠和大鼠同源物具有超过 80% 的同一性。 推导的 3,574 个氨基酸的 SVEP1 蛋白的计算分子量为 370 kD。 SVEP1 包含一个冯维勒布兰德因子(VWF; 193400) A 型结构域、2 个透明蛋白重复(HYR) 结构域、一个富含半胱氨酸的 TNF 受体结构域、一个五聚蛋白结构域、一个 RGD 细胞附着位点、2 个 EGF 结构域、7 个 EGF 样钙结合结构域和 34 个具有选择蛋白超家族补体结合重复序列特征的补体控制蛋白(CCP) 重复序列。 SVEP1 与粘附蛋白的选择素家族相似(参见 SELP,173610),但不包含凝集素结构域。 免疫沉淀和蛋白质印迹分析在间充质原代培养细胞裂解物和小鼠基质成骨细胞中检测到 SVEP1。 免疫组织化学和共聚焦显微镜将 SVEP1 定位于细胞膜和细胞质。

▼ 基因功能

Shur 等人通过免疫组织化学和 FACS 分析(2006) 指出,与高密度生长的细胞相比,低密度小鼠基质成骨 MBA15 细胞中 SVEP1 的表达量高出 8 倍。 SVEP1 表达还与较小的细胞大小相关,并且与 SVEP1 抗体一起孵育的 MBA15 细胞显示细胞附着减少,表明 SVEP1 在细胞附着过程中发挥作用。

Schwanzer-Pfeiffer 等人使用微阵列分析和定量实时 PCR(2010) 发现在内毒素血症的人类细胞培养模型中,SVEP1、SRPX2(300642) 和 KIAA0247(SUSD6; 616761) 的表达显着上调。 通过小干扰 RNA(siRNA) 敲低 SVEP1 会降低受刺激的人脐静脉内皮细胞(HUVEC) 表面 E-选择素(SELE; 131210) 的表达,但对 ICAM1(147840) 表面表达没有影响。 SVEP1 敲除增加了受刺激的 HUVEC 上清液中可溶性 ICAM1 和 E-选择素的浓度。

▼ 基因结构

舒尔等人(2006)确定SVEP1基因包含48个外显子。

▼ 测绘

通过 FISH,Gilges 等人(2000) 将 SVEP1 基因定位到染色体 9q32,并将相应的小鼠 Svep1 基因定位到小鼠染色体 4B-4C2 的同线区域。 通过基因组序列分析,Shur 等人(2006) 将 SVEP1 基因定位到染色体 9q32。

▼ 动物模型

在国际小鼠表型联盟(IMPC) 创建的 1,751 个敲除等位基因的研究中,Dickinson 等人(2016) 发现人类 SVEP1 小鼠同源物的敲除是纯合致死的(定义为在断奶前筛选至少 28 只幼崽后不存在纯合小鼠)。 3D成像显示,E15.5和E18.5的Svep1纯合敲除胚胎均表现出多种缺陷,包括严重水肿和变色、肾盂发育异常、肺部严重发育不良和心肌薄弱。