ENDO/核酸外切酶,ENDOG 样; EXOG

  • 核酸内切酶 G-LIKE 1; ENDOGL1
  • ENGL

HGNC 批准的基因符号:EXOG

细胞遗传学定位:3p22.2 基因组坐标(GRCh38):3:38,496,126-38,526,303(来自 NCBI)

▼ 说明

EXOG 是一种内切核酸酶 G(ENDOG; 600440) 样线粒体内切/外切核酸酶,具有内切核酸酶和 5-prime-to-3-prime 外切核酸酶活性(Cymerman et al., 2008)。

▼ 克隆与表达

通过分析来自 3p22-p21.3 的 515 kb 克隆片段(该区域在各种癌症中通常被删除),Daigo 等人(1999) 鉴定了 10 个基因,其中 4 个是新的。 他们将新基因之一命名为 ENGL(核酸内切酶 G 样),因为预测的 368 个氨基酸 ENGL 蛋白与核酸内切酶 G(ENDOG;600440) 具有 38% 的同一性。 Northern 印迹分析显示,ENGL 在所有测试组织中均以 1.7 kb mRNA 的形式表达。 在心脏、肝脏、骨骼肌和睾丸中检测到了另外一个 2.1 kb mRNA,命名为 ENGLb。 ENGLb 转录物包含 6 个 ENGL 外显子中 4 个的全部或部分,以及分析的基因组克隆中不存在的 3-prime 外显子。

赛默曼等人(2008) 报道称,368 个氨基酸的 EXOG 蛋白的计算分子量为 41.1 kD。 它包含 N 端线粒体前导序列(MLS)、中心催化丝氨酸-甘氨酸-组氨酸(SRGH) 基序和 C 端卷曲螺旋结构域。 预测的螺旋跨膜片段位于 MLS 内。 共聚焦免疫组织化学分析显示 EXOG 定位于 HeLa 细胞中的线粒体。 线粒体亚分级、免疫金电子显微镜和共聚焦激光扫描显微镜显示 EXOG 特异性定位于线粒体内膜。

▼ 基因功能

通过分析转染的 HEK293 细胞,Cymerman 等人(2008) 表明 EXOG 对环状单链 DNA 具有高核酸内切酶活性。 缺乏 N 末端 MLS 的重组 EXOG 对环状单链 DNA 表现出类似的偏好,但在长时间孵育后它也会切割超螺旋和开放环状 DNA。 EXOG 对单链和双链 DNA 以及单链 RNA 显示出 5-prime-to-3-prime 核酸外切酶活性。 它对核糖体 RNA 底物几乎没有核酸内切酶活性。 SRGH 催化基序内保守的 his140 的突变或 C 末端卷曲螺旋结构域的去除消除了 EXOG 活性。 赛默曼等人(2008) 还发现天然存在的 SNP 导致 gly277-to-val(G277V) 取代使 EXOG 失活。 突变分析表明 EXOG N 端 MLS 内的跨膜片段是 EXOG 线粒体定位所必需的。

▼ 基因结构

大悟等人(1999)确定EXOG基因含有6个外显子。 赛默曼等人(2008) 发现它的跨度为 28.35 kb。

▼ 测绘

大悟等人(1999) 在 3p22-p21.3 的 515 kb 克隆片段中鉴定出 EXOG 基因。 EXOG 是克隆区域中端粒最长的基因,位于 ActRIIB(ACVR2B; 602730) 基因旁边。 赛默曼等人(2008) 指出 EXOG 基因对应到染色体 3p21.3。