YIPPEE-LIKE 2; YPEL2

HGNC 批准的基因符号：YPEL2

细胞遗传学位置：17q22 基因组坐标（GRCh38）：17:59,331,654-59,401,731（来自 NCBI）

▼ 克隆与表达

Hosono 等人通过搜索与 YPEL1（608082） 相似的序列，然后搜索睾丸 cDNA 文库的 5-prime 和 3-prime RACE（2004）克隆了YPEL2。 推导的 119 个氨基酸蛋白与小鼠和猴子 Ypel2 具有 100% 的氨基酸一致性，与果蝇 Yippee 具有 45% 的氨基酸一致性。 YPEL2 与 YPEL1、YPEL3（609724） 和 YPEL4（609725） 具有 85.0 至 96.6% 的氨基酸同一性。 所有 YPEL 蛋白均包含 86 个氨基酸的 YPEL 共有序列。 PCR分析检测成人心脏、肾、肺、胰腺、胎盘、骨骼肌、白细胞、前列腺、脾和睾丸以及胎儿脑、心脏、肾、肝、肺、骨骼肌和脾中的YPEL2表达。 COS-7绿猴肾细胞的免疫荧光染色将猴Ypel2定位于间期的中心体和核仁，以及有丝分裂期期间有丝分裂器周围的几个点状结构。

德布鲁因等人（2020） 通过 qPCR 评估了 YPEL2 在多种健康人体组织中的表达，并观察到在研究的组织中普遍存在表达，其中在大脑中的相对表达最高。 YPEL2 表达存在于视网膜组织中，单细胞视网膜 RNAseq 数据集显示 YPEL2 在视杆细胞中的表达水平最高。

▼ 基因结构

细野等人（2004） 确定 YPEL2 基因包含 5 个外显子，跨度约为 70 kb。 外显子 1 未翻译。 小鼠Ypel2基因具有相同的结构。

▼ 测绘

通过基因组序列分析，Hosono 等人（2004） 将人类 YPEL2 基因对应到染色体 17q23.2，将小鼠 Ypel2 基因对应到染色体 11C。

▼ 细胞遗传学

de Bruijn 等人在来自 22 个患有常染色体显性遗传性视网膜色素变性（RP17; 600852） 家族的受影响个体中（2020） 鉴定了染色体 17q22 处 8 个不同结构变异（SV） 的杂合性。 SV 与疾病分离并且完全渗透，并且在 gnomAD 或基因组变异数据库中没有发现任何 SV。 所有 RP17 SV 共享一个 11.5 kb 的共同重复或三重区域（chr17：57,499,214-57,510,765；GRCh37），具有破坏从 YPEL2 延伸到长非编码 RNA LINC01476 的基因组区域的独特断点。 对断点连接序列的分析表明存在重复元件以及微同源性、更长的同源性或小的插入和/或缺失，这表明SV的潜在机制包括（微）同源性介导的修复和从重编程的患者成纤维细胞开发的非同源末端连接的组合，表明YPEL2位于其自己的拓扑相关结构域（TAD）内，该结构域富含具有视网膜转录因子结合位点的增强子。 RP17 RO 的 Hi-C 图揭示了 GDPD1（616317） 和 YPEL2 视网膜增强子之间异位接触的新 TAD 的产生，并且所有 RP17 SV 的建模与新 TAD 一致，导致异位视网膜特异性增强子 -GDPD1 可及性。 通过 RO 中的 qPCR，作者证实了 GDPD1 和进入 neo-TAD 的视网膜增强子的表达增加。 作者得出结论，导致 GDPD1 视网膜表达增加的 TAD 结构改变可能是疾病的收敛机制，与显着的功能获得一致。