具有 Krab 和扫描结构域 3 的锌指蛋白; ZKSCAN3

  • 锌指蛋白 306; ZNF306

HGNC 批准的基因符号:ZKSCAN3

细胞遗传学定位:6p22.1 基因组坐标(GRCh38):6:28,349,912-28,369,173(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

Wang 等人通过筛选人结肠癌细胞系表达文库中 UPAR(PLAUR; 173391) 启动子活性的调节因子(2004) 克隆了 ZKSCAN3,他们将其称为 ZNF306。 推导的 538 个氨基酸蛋白属于 C2H2 锌指蛋白的 Kruppel 样亚家族,与 KLF4(602253) 具有显着相似性。

通过在 EST 数据库中搜索结直肠癌中上调的基因,Yang 等人(2008) 确定了 ZKSCAN3。 推导的蛋白质含有 2 个串联的 C2H2 锌指结构域。 免疫组织化学分析显示ZKSCAN3定位于肿瘤细胞核。

▼ 基因功能

杨等人(2008)表明,与邻近的非恶性粘膜相比,原发性结直肠肿瘤中 ZKSCAN3 的表达上调。 与非侵袭性肿瘤相比,侵袭性肿瘤中 ZKSCAN3 的表达较高。 Southern印迹分析显示,某些肿瘤中的过度表达部分是由于基因扩增所致。 在 2 个孤立的结肠癌细胞系中敲低 ZKSCAN3 会损害裸鼠中的锚定非依赖性生长和肿瘤生长,而在第三个细胞系中过表达则具有相反的效果。 靶向 ZKSCAN3 的小干扰 RNA 降低了裸鼠结肠癌细胞的致瘤性。

杨等人(2008) 确定 ZKSCAN3 结合共有 DNA 序列(G/T)(A/G)(A/G/T)GGGG。 表达谱显示,与亲代细胞相比,在转染的人结肠癌细胞中,ZKSCAN3 诱导了 204 个基因 2 至 29 倍,76 个基因减少了 2 至 5 倍。 在 ZKSCAN3 上调的基因中,大多数编码涉及生长、细胞迁移、血管生成和蛋白水解的蛋白质。 杨等人(2008) 证实 ZKSCAN3 结合整合素 β-4(ITGB4; 147557) 的启动子,该基因在体外和体内均被 ZKSCAN3 上调 6 倍。 通过短发夹 RNA 敲低 ITGB4 可以对抗结肠癌细胞系中 ZKSCAN3 增强的贴壁孤立集落形成。 杨等人(2008) 还证实 VEGF(192240) 是 ZKSCAN3 的直接靶标。 他们得出结论,ZKSCAN3 调节有利于肿瘤进展的基因表达。

▼ 测绘

通过基因组序列分析,Yang 等人(2008) 将 ZKSCAN3 基因定位到染色体 6p22.1。