角蛋白 35,I 型; KRT35

  • K35
  • KA30
  • 角蛋白,头发,酸性,5; KRTHA5
  • 角蛋白,硬,I 型,5; HA5

HGNC 批准的基因符号:KRT35

细胞遗传学位置:17q21.2 基因组坐标(GRCh38):17:41,476,709-41,481,150(来自 NCBI)

▼ 说明

有关头发角蛋白的一般信息,请参阅 KRTHA1(601077)。

▼ 克隆与表达

罗杰斯等人(1996) 在研究 HA2(KRTHA2; 602760) 基因组序列时鉴定了 KRTHA5 基因,他们将其称为 HA5。 作者利用部分 HA5 基因组片段筛选人头皮 cDNA 文库,孤立出 HA5 cDNA。 基因组和 cDNA 序列的比较揭示了 3-prime 非编码区中存在内含子。 与编码 α 螺旋结构域的区域中预期的 6 个保守内含子一起,HA5 基因具有 7 个内含子。 预测的 425 个氨基酸的 HA5 蛋白包含一个带有 8 个半胱氨酸和 10 个脯氨酸残基的 C 端结构域。 其 N 端结构域与 HA1(KRTHA1)、HA3A(KRTHA3A; 602761)、HA3B(KRTHA3B; 602762) 和 HA4(KRTHA4; 602763) 的 N 端结构域缺乏序列同源性,所有这些结构域在长度和序列上都非常保守。 Northern 印迹分析在人类头皮中检测到 1.8 kb HA5 转录本,但在无毛表皮中未检测到。 原位杂交检测到HA5转录本主要存在于毛球的基质上细胞和最下层皮质细胞中,表明HA5在毛发形态发生的早期表达; 在角质层中未检测到转录本。 参见 Langbein 等人(1999) 了解有关毛囊中 KRTHA5 基因表达模式的更多信息。

罗杰斯等人(1998)报道推导的KRTHA5蛋白有426个氨基酸。

▼ 测绘

罗杰斯等人(1996) 将 HA5 基因定位在 17q12-q21 上 HA2 基因上游 8 kb 处,发现这 2 个基因的转录方向相同。

罗杰斯等人(1998) 分离并表征了 2 个重叠的人类 PAC 克隆,它们在 17q12-q21 上覆盖 190 kb,包含 9 个 I 型毛发角蛋白基因、1 个转录的毛发角蛋白假基因和 1 个孤儿外显子。 基因的顺序是5-素数--KRTHA6(604540)--KRTHA5--KRTHA2--孤儿外显子--KRTHA8(604542)--KRTHA7(604541)--假基因--KRTHA1--KRTHA4--KRTHA3B--KRTHA3A--3-素数。 头发角蛋白基因的大小范围为4.2至7.5 kb,基因彼此间隔5.5至18.4 kb; 所有内容均位于约 140 kb 以内。 除KRTHA5有8个外显子外,所有基因均含有7个外显子。 每个基因从5素数到3素数方向转录。 根据序列同源性,基因可分为 3 个串联排列的基因亚簇。 其中一个亚簇(A 组)由 KRTHA1、KRTHA3A、KRTHA3B 和 KRTHA4 组成,它们具有 89% 的总体氨基酸同一性。 第二个亚簇(B 组)包含 KRTHA7 和 KRTHA8,以及头发角蛋白假基因(作者将其称为 HAA)。 功能性毛发角蛋白和假设的 HAA 毛发角蛋白具有大约 81% 的总体氨基酸同一性。 第三个亚群,即 C 组,由结构上不太相关的毛发角蛋白 KRTHA2、KRTHA5 和 KRTHA6 组成,它们具有约 70% 的氨基酸同一性。