剪接因子 3A,亚基 1; SF3A1

  • SF3A,120-KD 子单元; SF3A120
  • 剪接体相关蛋白,114-KD; SAP114
  • PRP21,酿酒酵母,同源物; PRP21

HGNC 批准的基因符号:SF3A1

细胞遗传学位置:22q12.2 基因组坐标(GRCh38):22:30,331,987-30,356,893(来自 NCBI)

▼ 说明

在 2 次酯交换反应中,内含子从核前 mRNA 中去除。 剪接发生在大核糖核蛋白颗粒(剪接体)中。 剪接体中间复合物按照 E、A、B 和 C 的顺序在前 mRNA 上形成,催化反应发生在复合物 C 中。U2 小核核糖核蛋白(snRNP;参见 180690)是剪接体组装和 mRNA 剪接所必需的蛋白质之一。 功能性 U2 snRNP 由 12S 单元和 2 个剪接因子组成,SF3A 由 3 个蛋白质组成,包括 SF3A1,SF3B 由 4 个蛋白质组成(参见 SF3B1;605590)(Kramer 等人(1995)、Wang 等人(1998) 和 Isono 等人(2001) 总结)。

▼ 克隆与表达

Kramer 等人通过使用与 SF3A 120-kD 亚基微肽序列相对应的简并引物进行 PCR,然后筛选 HeLa 细胞 cDNA 文库(1995) 分离出编码 SF3A1 的 cDNA,他们将其命名为 SF3A120。 序列分析预测,该蛋白由 793 个氨基酸组成,富含脯氨酸和带电氨基酸。 SF3A1 包含靠近其 N 末端的 2 个 SURP 模块(参见 SFRS8;601945)和位于其 C 末端的泛素(191339) 样区域。 Northern 印迹分析显示 3.2-、3.8-和 5.7-kb 转录本的普遍表达,其中 5.7-kb 转录本的表达量低于其他两个转录本。 蛋白质印迹分析显示网织红细胞裂解物或 HeLa 细胞表达 120 kD 蛋白质。

▼ 基因功能

通过与 SF3A1 的截短衍生物的结合分析,Kramer 等人(1995) 确定 SF3A1 通过其 SURP 结构域与 SF3A3(605596) 相互作用,但与 SF3A2(600796) 主要通过 SURP 模块 C 端的 130 个氨基酸区域相互作用。

▼ 测绘

通过体细胞杂交分析,Kramer 等人(1995) 将 SF3A1 基因定位到 22 号染色体。