WD 重复含有蛋白 33; WDR33

  • WD 重复蛋白,146-KD; WDC146

HGNC 批准的基因符号:WDR33

细胞遗传学位置:2q14.3 基因组坐标(GRCh38):2:127,701,026-127,811,186(来自 NCBI)

▼ 说明

WDR33 是切割和多腺苷酸化特异性因子(CPSF) 的亚基,可介导 mRNA 的 3 引物切割和 AAUAAA 依赖性多腺苷酸化(Schonemann et al., 2014)。

▼ 克隆与表达

伊藤等人(2001) 克隆了人类 WDR33,他们将其称为 WDC146。 推导的 1,376 个氨基酸 WDC146 的计算分子量为 146 kD。 它包含 8 个 N 端 WD40 重复序列、一个中央胶原蛋白样结构域和一个主要由甘氨酸、脯氨酸和精氨酸组成的 C 端结构域(GPR 结构域)。 人类 WDC146 蛋白与其啮齿动物直系同源蛋白(包括小鼠和大鼠)具有约 95% 的氨基酸同一性。 对人体组织的 Northern 印迹分析检测到 4 kb WDC146 转录物优先在睾丸中表达,在除结肠和小肠之外的所有其他检查组织中表达较弱。 在小鼠组织中也发现了类似的表达模式。 成年大鼠睾丸的原位杂交显示Wdc146 mRNA存在于精母细胞分裂的粗线期,但在其他阶段则没有。 表达主要存在于精母细胞中,在圆形精子细胞中表达较弱,但在细长精子细胞中未检测到。 在大鼠胸腺中,在皮质中观察到 Wdc146 表达,但在髓质中未观察到。 在大鼠脾脏白髓和边缘带中也检测到 Wdc146 表达,但在红髓中未检测到 Wdc146 表达。 荧光标记的 WDC146 蛋白在 ITO-II、Saos2、NIH3T3 和 293 细胞的核和核周区域表达。

▼ 基因功能

Chan 等人使用体外和体内测定法(2014) 发现人类 WDR33 直接联系 AAUAAA。 放射性标记的合成 RNA 和免疫沉淀分析表明,WDR33 特异性结合到跨越 AAUAAA 六聚体的狭窄区域。

Schonemann 等人使用来自昆虫细胞表达系统的纯化 CPSF 亚基(2014) 在体外用不同的亚基组合重建了 CPSF,发现 7 个 CPSF 亚基中的 4 个对于聚腺苷酸化活性是必要且充分的:CPSF160(CPSF1; 606027)、CPSF30(CPSF4; 603052)、FIP1(RRAGA; 612194) 和 WDR33。 WDR33 是必需的,并且似乎是 CPSF 结合底物 RNA 并触发聚腺苷酸化能力的基础。 通过光活化核糖核苷增强交联和免疫沉淀对 WDR33 靶标进行全转录组鉴定,结果表明 WDR33 在体内高度特异性地识别 AAUAAA 信号,并与含有 AAUAAA 序列的区域结合。 Pull-down 分析进一步表明,含有 WD40 重复序列的 WDR33 N 端区域对于 RNA 结合至关重要。

▼ 基因结构

伊藤等人(2001) 发现 WDR33 基因包含 22 个外显子,这些外显子分散成 3 个簇,跨度约为 105 kb。 外显子 1 是非编码的,起始密码子位于外显子 2 内。

▼ 测绘

伊藤等人(2001) 报道称 WDR33 已通过 FISH 定位到染色体 2q14.2-q21.1。

Gross(2018) 根据 WDR33 序列(GenBank BC013990) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 WDR33 基因对应到染色体 2q14.3。