半胱氨酰-tRNA合成酶1 , 小头畸形、发育迟缓和脆发综合征

20 种天然存在的氨基酸中的每一种与其同源 tRNA 同工异接受家族的连接均由特定的氨酰-tRNA 合成酶催化,例如 CARS(Cruzen 等,1993)。

▼ 克隆与表达
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洛等人(2014)报道了每个人类氨酰 tRNA 合成酶的大量天然催化无效值的发现。剪接事件保留非催化域,同时烧蚀催化域以创建具有多种功能的催化无效域。每个合成酶都被转化为几种新的信号蛋白,其生物活性与催化亲本的生物活性“正交”。重组氨酰 tRNA 合成酶变体在一系列基于细胞的检测中具有特定的生物学活性:所有物种中约有 46% 影响转录调节,22% 细胞分化,10% 免疫调节,10% 细胞保护,4% 分别用于增殖、脂肪生成/胆固醇转运和炎症反应。洛等人(2014)鉴定了细胞质氨酰 tRNA 合成酶的框内剪接变体。他们为 CysRS 鉴定了 1 个催化无效和 1 个催化结构域保留的剪接变体。

▼ 测绘
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克鲁森等人(1993)通过对一组人类/中国仓鼠体细胞杂交体的分析,将 CARS 基因分配到 11 号染色体。通过荧光原位杂交,他们精确定位到染色体 11p15.5。

▼ 细胞遗传学
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在 ALK( 105590 ) 阳性间变性大细胞淋巴瘤患者中,Cools 等人(2002)发现 at(2;11;2)(p23;p15;q31) 重排导致来自染色体 11p15 的 CARS 基因的外显子剪接为来自染色体 2p23 的 ALK 基因的外显子。预测的融合蛋白包含与 ALK 的 562 个氨基酸融合的 CARS 的 606 个 N 端氨基酸,包括 ALK 激酶域。

▼ 分子遗传学
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Kuo 等人在来自 3 个无关家庭的 4 名患有小头畸形、发育迟缓和脆发综合征(MDBH; 618891 ) 的患者中进行了研究(2019)报告了 CARS1 基因突变的纯合子或复合杂合子( 123859.0001 - 123859.0005 )。对患者成纤维细胞的分析显示 CARS 活性显着降低,这与变体的功能丧失效应一致。

▼ 等位基因变体( 5 精选示例):
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.0001 小头畸形、发育迟缓和脆发综合征
CARS1, 1-BP DUP, NT2061
在一名 34 岁的欧洲和法裔加拿大血统(家庭 1)男性中,患有小头畸形、发育迟缓和头发脆化综合征(MDBH;618891 ),Kuo 等人(2019)鉴定了 CARS1 基因中 1 bp 重复(c.2061dup,NM_001751.5)的纯合性,导致预计会导致过早终止密码子(Ser688GlnfsTer2)的移码。他未受影响的父母都是突变的杂合子,该突变也存在于 gnomAD 数据库中,仅处于杂合状态(2/251,406)。患者成纤维细胞的免疫印迹分析显示约 78 kD 的单条带,与截断蛋白的预测大小一致。与对照相比,来自患者成纤维细胞的蛋白质裂解物的氨酰化反应显示 CARS 活性降低 70%,与功能丧失效应一致。酵母互补测定,使用单倍体酵母菌株,其中内源酵母 CARS 直向同源物已被删除,证明突变蛋白不支持任何酵母细胞生长,

.0002 小头畸形、发育迟缓和脆发综合征
CARS1, ARG341HIS
Kuo 等人在一名患有小头畸形、发育迟缓和头发脆性综合征(MDBH; 618891 )的 35 岁荷兰女性(家庭 2)中进行了研究(2019)鉴定了 CARS1 基因中 c.1022G-A 转换(c.1022G-A,NM_001751.5)的复合杂合性,导致在高度保守的残基处发生 arg341 到他的(R341H)替换,以及 c.1138C -T 转换,导致 gln380-to-ter(Q380X) 替换。两种突变都发生在催化域内,预计截断会导致反密码子结合域的完全丧失。先证者未受影响的父母各有1个突变的杂合子,这两种突变在gnomAD数据库中均以低频率存在,但仅处于杂合状态(次要等位基因频率分别为0.00004和0.000005)。患者成纤维细胞的免疫印迹分析显示,与对照细胞相比,全长 CARS 蛋白的数量显着减少,并且未检测到截短的蛋白。与对照相比,来自患者成纤维细胞的蛋白质裂解物的氨酰化反应显示 CARS 活性降低了约 80%,这与变体的功能丧失效应一致。酵母互补试验使用单倍体酵母菌株,其中内源性酵母 CARS 直向同源物已被删除,证明 Q380X 突变体不支持任何酵母细胞生长,与野生型生存力拯救相反,证实 Q380X 变体的功能丧失。R341H 突变体与酵母细胞生长严重减少但未消融有关,氨酰化分析显示,与野生型 CARS 相比,R341H 突变体的活性降低了 50%。与变体的功能损失效应一致。酵母互补试验使用单倍体酵母菌株,其中内源性酵母 CARS 直向同源物已被删除,证明 Q380X 突变体不支持任何酵母细胞生长,与野生型生存力拯救相反,证实 Q380X 变体的功能丧失。R341H 突变体与酵母细胞生长严重减少但未消融有关,氨酰化分析显示,与野生型 CARS 相比,R341H 突变体的活性降低了 50%。与变体的功能损失效应一致。酵母互补试验使用单倍体酵母菌株,其中内源性酵母 CARS 直向同源物已被删除,证明 Q380X 突变体不支持任何酵母细胞生长,与野生型生存力拯救相反,证实 Q380X 变体的功能丧失。R341H 突变体与酵母细胞生长严重减少但未消融有关,氨酰化分析显示,与野生型 CARS 相比,R341H 突变体的活性降低了 50%。确认 Q380X 变体功能丧失。R341H 突变体与酵母细胞生长严重减少但未消融有关,氨酰化分析显示,与野生型 CARS 相比,R341H 突变体的活性降低了 50%。确认 Q380X 变体功能丧失。R341H 突变体与酵母细胞生长严重减少但未消融有关,氨酰化分析显示,与野生型 CARS 相比,R341H 突变体的活性降低了 50%。

.0003 小头畸形、发育迟缓和脆发综合征
CARS1, GLN380TER
讨论 CARS1 基因中的 c.1138C-T 转变(c.1138C-T,NM_001751.5),导致 gln380-to-ter(Q380X) 取代,在 35- Kuo 等人的一岁荷兰妇女(家庭 2)患有小头畸形、发育迟缓和头发脆化综合征(MDBH;618891 )(2019),见123859.0002。

.0004 小头畸形、发育迟缓和脆发综合征
CARS1, SER359LEU
在一位患有小头畸形、发育迟缓和头发脆性综合征(MDBH; 618891 )的荷兰兄弟姐妹(家庭 3 )中,Kuo 等人(2019)鉴定了 CARS1 基因中 c.1076C-T 转变(c.1076C-T,NM_001751.5)的复合杂合性,导致 ser359 到 leu(S359L) 取代和 c.1199T-A 颠换,导致在一个保守残基的 leu400 到 gln(L400Q) 替换中,两者都发生在催化域内。他们未受影响的父母各有 1 个突变的杂合子。S359L 变体存在于 gnomAD 数据库中,但仅存在于杂合性中(次要等位基因频率,0.00004),而 L400Q 在 gnomAD 中未发现。患者成纤维细胞的免疫印迹分析显示,与对照细胞相比,全长 CARS 蛋白的数量显着减少,并且未检测到截短的蛋白。与对照组相比,来自患者成纤维细胞的蛋白质裂解物的氨酰化反应显示 CARS 活性降低了约 40%,与变体的功能损失效应一致。酵母互补测定使用单倍体酵母菌株,其中内源酵母 CARS 直向同源物已被删除,证明 L400Q 突变体不支持任何酵母细胞生长,这与野生型生存力拯救相反,证实了 L400Q 变体的功能丧失。S359L 突变体与酵母细胞生长严重减少但未消融相关,氨酰化分析显示,与野生型 CARS 相比,S359L 突变体的活性降低了 84%。确认 L400Q 变体功能丧失。S359L 突变体与酵母细胞生长严重减少但未消融相关,氨酰化分析显示,与野生型 CARS 相比,S359L 突变体的活性降低了 84%。确认 L400Q 变体功能丧失。S359L 突变体与酵母细胞生长严重减少但未消融相关,氨酰化分析显示,与野生型 CARS 相比,S359L 突变体的活性降低了 84%。

.0005 小头畸形、发育迟缓和脆发综合征
CARS1, LEU400GLN
讨论 CARS1 基因中的 c.1199T-A 颠换(c.1199T-A,NM_001751.5),导致 leu400 到 gln(L400Q)取代,在荷兰兄弟的复合杂合状态下发现Kuo 等人的姐妹(家庭 3)患有小头畸形、发育迟缓和头发脆化综合征(MDBH; 618891 )(2019),见123859.0004。