赖氨酸脱甲基酶2A; KDM2A

  • F框 和富含亮氨酸的重复蛋白 11; FBXL11;FBL11
  • CXXC 手指蛋白 8; CXXC8
  • KIAA1004
  • JMJC 结构域组蛋白去甲基化酶 1; JHDM1A

HGNC 批准的基因符号:KDM2A

细胞遗传学位置:11q13.2 基因组坐标(GRCh38):11:67,119,262-67,258,081(来自 NCBI)

▼ 说明

F 框以最初观察到的细胞周期蛋白 F(CCNF; 600227) 命名,是一个约 40 个氨基酸的基序,可结合 SKP1(601434)。 F框 蛋白(例如 FBXL11)是称为 SCF(SKP1、滞蛋白(参见 603134)、F框 蛋白)的模块化 E3 泛素蛋白连接酶的组件,其在磷酸化依赖性泛素化中发挥作用。

▼ 克隆与表达

Winston 等人使用以 SKP1 作为诱饵的酵母 2-杂交筛选,然后搜索序列数据库(1999) 和 Cenciarelli 等人(1999) 分别鉴定了 33 种哺乳动物和 26 种人类 F框 蛋白。 这些含有富含亮氨酸重复序列的 C 末端(FBXL,例如 SKP2(601436))、WD40 结构域(FBXW,例如 BTRCP(603482))或无可识别基序(FBXO,例如 CCNF)。

通过搜索序列数据库,Ilyin 等人(2000) 鉴定了编码 FBXL11 的 cDNA,他们将其称为 FBL7。 他们预测 FBXL11 与 Nagase 等人报道的 496 个氨基酸的 KIAA1004 蛋白相同(1999),包含至少 6 个高度简并的富含亮氨酸的重复序列。 通过 RT-PCR 分析,Nagase 等人(1999) 检测到 FBXL11 普遍表达,在脑、睾丸和卵巢中水平最高,其次是肺; 最低表达在胰腺中。 在大脑内,小脑和丘脑底核的表达最高。

金等人(2004) 报道称 FBXL11 蛋白含有一个 N 端 JmjC 结构域(存在于 cupin 金属酶中)、中央锌指和 PHD 结构域、一个 C 端 F 框和 8 个 C 端富含亮氨酸的重复序列。

▼ 基因功能

Tsukada 等人使用生化测定与色谱法相结合(2006) 纯化了一种新的包含 JmjC 结构域的蛋白 JHDM1,该蛋白特异性地使组蛋白 H3 在赖氨酸 36 处去甲基化(H3-K36;参见 602810)。 在 Fe(II) 和 α-酮戊二酸存在下,JHDM1 使 H3-甲基-K36 去甲基化并生成甲醛和琥珀酸。 JHDM1 的过度表达降低了体内二甲基-H3-K36(H3K36me2) 的水平。 含有 JmjC 结构域的蛋白质的去甲基化酶活性是保守的,因为酿酒酵母中的 JHDM1 同源物也具有 H3-K36 去甲基化酶活性。 因此,冢田等人(2006) 将 JmjC 结构域鉴定为一种新的去甲基化酶特征基序,并揭示了从酵母到人类都保守的蛋白质去甲基化机制。

▼ 测绘

金等人(2004) 指出 FBXL11 基因对应到染色体 11q31.1,小鼠 Fbxl11 基因对应到染色体 19A。