设置含有蛋白质 7 的结构域; SETD7

  • SET7
  • SET9
  • 组蛋白 H3-赖氨酸 4 特异性甲基转移酶
  • H3-K4-HMTase
  • KIAA1717

HGNC 批准的基因符号:SETD7

细胞遗传学位置:4q31.1 基因组坐标(GRCh38):4:139,492,973-139,556,218(来自 NCBI)

SUV39H1(300254) 对组蛋白 H3(参见 602810)在赖氨酸 9(K9) 处的甲基化以及随后异染色质蛋白 1(HP1;参见 604478) 的募集与基因沉默相关。除了 K9 之外,H3 甲基化也发生在 K4、K27 和 K36 处。王等人(2001) 报道了 H3-K4 特异性甲基转移酶(H3-K4-HMTase) 的纯化、分子鉴定和功能表征,由于其 C 末端存在 SET 结构域,他们将其命名为 SET7。作者确定 SET7 cDNA 与 Nagase 等人报道的 KIAA1717 cDNA 相同(2000),编码一种 366 个氨基酸的蛋白质,与其小鼠同源物有 96% 的同一性。

西冈等人(2002) 从 HeLa 细胞中分离出 SET7,他们将其命名为 SET9。预测的蛋白质包含 SET 结构域,但缺少 SET 前和后结构域。

▼ 基因功能

Wang 等人(2001)表明SET7在体外和体内使H3-K4甲基化,并且H3-K4的甲基化和H3-K9的甲基化相互抑制。此外,还发现 SET7 和 SUV39H1 的 H3-K4 甲基化和 H3-K9 甲基化分别对随后 p300 的组蛋白乙酰化具有不同的影响(602700)。这项研究为 H3-K4 和 H3-K9 甲基化对转录的差异影响提供了分子解释。

崔可夫等人(2004) 报道了通过 Set9 甲基转移酶的赖氨酸甲基化调节 p53(191170) 的新机制。Set9 特异性地甲基化 p53 C 端调控区内的 lys372 位点。甲基化 p53 仅限于细胞核,修饰对其稳定性产生积极影响。Set9 以依赖于 p53 甲基化位点的方式调节 p53 靶基因的表达。Set9与p53肽和辅因子产物S-腺苷-L-高半胱氨酸的三元复合物的晶体结构为该赖氨酸甲基转移酶识别p53提供了分子基础。

Binda 等人使用一组赖氨酸甲基转移酶(KMT) 筛选人类 H2AZ(142763) 底物(2013) 确定 SETD6(616424) 和 SETD7 是 H2AZ 的主要 KMT。突变分析和 KMT 测定表明 SETD6 主要甲基化 H2AZ 的 lys7,其中 lys4 可能是第二个位点。SETD7 甲基化 lys13 和可能的其他 lys 残基。

▼ 生化特征

进化上保守的 SET 结构域存在于大多数已知具有组蛋白赖氨酸甲基转移酶活性的蛋白质中。威尔逊等人(2002) 描述了人类 SET7 大片段的晶体结构,其中包含 N 端 β-折叠结构域以及保守的 SET 结构域。诱变鉴定了该蛋白质 C 末端的 2 个残基,这些残基似乎对于组蛋白 H3 的 lys4 的催化活性至关重要。此外,辅因子 S-腺苷甲硫氨酸(AdoMet) 与该结构域结合。威尔逊等人(2002) 提出的生化数据支持不变残基在催化、AdoMet 结合以及与肽底物相互作用中的作用。

肖等人(2003) 鉴定了人 SET7/9 与组蛋白肽和辅因子的三元复合物的高分辨率晶体结构,这表明肽底物和辅因子结合在酶的相对表面上。目标赖氨酸通过将其侧链插入穿过酶的狭窄通道来访问酶和 S-腺苷-L-甲硫氨酸辅因子的活性位点,连接两个表面。肖等人(2003) 从结构和溶液研究表明,SET7/9 与大多数其他 SET 蛋白不同,完全是一种单甲基化酶。该结构表明了酶对组蛋白靶标特异性的分子基础,Xiao 等人(2003) 提出了甲基化反应模型,该模型解释了 SET 家族中许多不变残基的作用。

▼ Mapping

Gross(2015) 根据 SETD7 序列(GenBank AF448510) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 SETD7 基因对应到染色体 4q31.1。