微RNA LET7E; MIRLET7E

  • LET7,线虫,E 的同系物; LET7E
  • miRNA LET7E
  • MIRNLET7E

HGNC 批准的基因符号:MIRLET7E

细胞遗传学位置:19q13.41 基因组坐标(GRCh38):19:51,692,785-51,692,863(来自 NCBI)

▼ 说明

MicroRNA(miRNA) 是一种小型非编码调节 RNA,可通过靶向特定 mRNA 来下调转录。 Let7 是 miRNA 家族的创始成员之一,首次在秀丽隐杆线虫中被发现。 线虫 let7 有几种人类同源物,所有这些 LET7 miRNA 都具有相同的种子序列,这对于目标识别至关重要。 在人类 LET7 miRNA 中,LET7B(611249) 和 LET7E 差异最大,有 4 个核苷酸差异。 在人类、小鼠和线虫中,LET7 的表达在胚胎阶段几乎检测不到,但在分化后和成熟组织中表达增加(Lee 和 Dutta,2007)。 有关 LET7 的更多信息,请参阅 LET7A1(605386)。

▼ 克隆与表达

Lagos-Quintana 等人使用定向克隆程序从 HeLa 细胞总 RNA 中克隆 miRNA(2001) 鉴定了秀丽隐杆线虫 let7 的 9 个人类同源物,包括 LET7E。 LET7E 序列是 UGAGGUAGGAGGUUGUAUAGU。 Northern 印迹分析检测到 HeLa 细胞、小鼠肾脏和成年斑马鱼中的 LET7E 表达。

▼ 基因功能

Lee 和 Dutta(2007) 使用数据库分析、荧光素酶报告基因检测和诱变,在 HMGA2(600698) 的 3 素子 UTR 中确定了 6 个功能性 LET7 靶位点。 作者用 LET7B 和 LET7E 的组合异位表达来代表所有 LET7 miRNA,减少了肺癌细胞系中 HMGA2 的表达和细胞增殖。 相反,抑制 LET7 会诱导 HMGA2 mRNA 和蛋白质。 没有 3-prime UTR 的 HMGA2 ORF 的过表达挽救了 LET7 对肺癌细胞的生长抑制作用。

通过数据库分析,Zwiers 等人(2012) 在 IL23R(607562) 的 3-prime UTR 中鉴定了 LET7E 和 LET7F 的假定结合位点(参见 MIRLET7F1; 612146),该结合位点被与炎症性肠病(IBD17; 612261) 相关的 SNP(rs10889677) 废除。 荧光素酶分析证实了计算机预测。

▼ 测绘

Gross(2007) 根据成熟 LET7E 序列(UGAGGUAGGAGGUUGUAUAGU) 与基因组序列(构建 36.1)的比对,将 MIRNLET7E 基因对应到 19 号染色体。