神经元导航蛋白 1; NAV1

  • 孔膜和/或细丝相互作用样蛋白3; POMFIL3
  • KIAA1151

HGNC 批准的基因符号:NAV1

细胞遗传学位置:1q32.1 基因组坐标(GRCh38):1:201,539,126-201,826,968(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

Hirosawa 等人通过对从大小分级的脑 cDNA 文库中获得的克隆进行测序(1999) 获得了部分 NAV1 克隆,他们将其命名为 KIAA1151。 转录本的 3-prime 末端包含重复元素。 RT-PCR ELISA检测到在心脏、脑、肺和卵巢中中等表达,在肾脏、睾丸和胎儿脑中表达较低。 在骨骼肌、胰腺、脾脏以及成人和胎儿肝脏中未检测到表达。 NAV1 在所有检查的特定大脑区域中表达为中等到高,其中在杏仁核和脊髓中表达最高。

Coy 等人通过在数据库中搜索与 POMFIL1(NAV3; 611629) 相似的序列,然后筛选人类 cDNA 文库(2002) 克隆了 NAV1 和 NAV2(607026),他们分别将其称为 POMFIL3 和 POMFIL2。 推导的 POMFIL3 蛋白含有 1,877 个氨基酸,计算分子量为 202.6 kD。 POMFIL 蛋白的 C 末端高度保守,与 Unc53(一种参与轴突引导的秀丽隐杆线虫蛋白)具有显着的同源性。 所有 3 种 POMFIL 蛋白也含有相似的卷曲螺旋结构。 科伊等人(2002) 还鉴定了几种 POMFIL3 剪接变体。 Northern 印迹分析检测到胎儿大脑和心脏以及多种成人组织中多种 POMFIL3 转录物的可变表达。 POMFIL3 在成人大脑中的表达较低。 在发育中的小鼠胚胎中,Pomfil3 在神经元、中胚层和内胚层组织中表达显着。

Maes 等人通过在数据库中搜索 Unc53 同源物,然后筛选人类心脏和结直肠腺癌 cDNA 文库(2002)克隆NAV1。 NAV1 包含多个卷曲螺旋结构域、一个肌节蛋白结合结构域和一个 AAA 型 ATP 酶结构域,但缺乏 Unc53、NAV2 和 NAV3 中保守的 N 端钙调蛋白(参见 600806)样结构域。 Northern 印迹分析检测到 NAV1 转录物的组织特异性表达,范围为 5.5 至 11 kb。 11-kb 转录物在所有检查的组织中都有表达,5.5-kb 转录物在心脏中高度表达。 PCR 分析证实,大量 NAV1 转录物源自复杂的剪接模式以及替代转录起始和终止位点的使用。

▼ 基因结构

梅斯等人(2002) 确定 NAV1 基因包含 30 个外显子,跨度 135 kb。

▼ 测绘

Coy 等人使用辐射混合分析(2002) 将 NAV1 基因定位到染色体 1q31。 梅斯等人(2002) 通过基因组序列分析将 NAV1 基因定位到染色体 1q32.1。