VON Willebrand 因子 A 域包含蛋白 3B; VWA3B

  • VWA 域包含蛋白 3B

HGNC 批准的基因符号:VWA3B

细胞遗传学位置:2q11.2 基因组坐标(GRCh38):2:98,087,166-98,330,681(来自 NCBI)

▼ 描述

VWA3B 是一种细胞内蛋白,包含约 200 个氨基酸的冯维勒布兰德因子(VWF; 613160) A 型(VWA) 结构域。细胞内含有 VWA 的蛋白质在转录、DNA 修复、核糖体和膜转移以及蛋白酶体中发挥作用。许多 VWA 结构域结合金属离子,并且含有 VWA 的蛋白质通过介导蛋白质-蛋白质相互作用在多蛋白质复合物中发挥作用(Kawarai 等人总结,2016)。

▼人脑 cDNA 文库的 PCR 克隆和表达,Kawarai 等人(2016)克隆了VWA3B的5个剪接变体。最长的推导蛋白质包含 1,294 个氨基酸,并具有中心 VWA 结构域。实时半定量 RT-PCR 检测到小鼠组织中普遍存在 Vwa3b 表达,其中在眼、肝脏和脊髓中表达最高。在所有检查的小鼠大脑区域中均检测到可变的 Vwa3b 表达。全长人 VWA3B 在转染的 COS-1 细胞的细胞质中表达。

▼ 基因结构

Kawarai 等人(2016) 确定 VWA3B 基因至少包含 28 个外显子。

▼ 测绘

VWA3B 基因对应到染色体 2q11.2(Kawarai 等人,2016)。

▼ 分子遗传学

Kawarai 等人发现,日本人的 3 兄弟患有常染色体隐性遗传性小脑性共济失调 22(SCAR22;616948)(2016) 在 VWA3B 基因中发现了一个纯合错义突变(K622T; 614884.0001)。该突变是通过纯合性作图和全外显子组测序相结合发现的,与该家族中的疾病分离。对其他 26 个患有小脑变性的近亲家族的 VWA3B 基因进行测序,发现了几个 SNP,但没有明显的致病突变。

▼ 等位基因变异(1 个选定示例):.

0001 脊髓小脑性共济失调,常染色体隐性 22(1 个家族)
VWA3B、LYS622THR
Kawarai 等人的 3 名兄弟均由日本近亲出生,患有常染色体隐性遗传性小脑性共济失调 22(SCAR22;616948)(2016) 鉴定出 VWA3B 基因中的纯合 c.1865A-C 颠换,导致 VWA 结构域中高度保守的残基处发生 lys622 至 thr(K622T) 取代。该突变是通过纯合性作图和全外显子组测序相结合发现的,并通过桑格测序证实,该突变与该家族中的疾病分离,并且在 400 个日本对照染色体中未发现。该变体根据 dbSNP(版本 135)、1000 基因组计划和外显子组变异服务器数据库以及 106 个对照外显子组的内部数据库进行过滤。全外显子组测序揭示了 3 名患者共有 5 个额外的错义变异,其中 2 个位于 X 染色体上并预测为致病性:H2BFM 基因中的 T113P 和 ZNF182 基因中的 T341S(314993)。不能排除这些变异的作用,但被认为不太可能,因为该家庭的起源来自日本西部的一个同族通婚村庄,支持常染色体隐性遗传而不是 X 连锁隐性遗传。将突变型 VWA3B 蛋白转染到几种不同的培养细胞系中会导致细胞活力下降。