染色体传输保真度因子 18; CHTF18

  • 染色体传输保真度因子 18,酿酒酵母,同源物
  • CTF18
  • CHL12,酵母,同源物;CHL12

HGNC 批准的基因符号:CHTF18

细胞遗传学定位:16p13.3 基因组坐标(GRCh38):16:788,619-798,073(来自 NCBI)

▼ 说明

CHTF18、CHTF8(613202) 和 DCC1(DSCC1; 613203) 是替代复制因子 C(RFC)(参见 600404)复合物的组成部分,该复合物在细胞周期的 S 期将 PCNA(176740) 加载到 DNA 上(Merkle 等人,2003 年;Bermudez 等人,2003 年)。

▼ 克隆和表达

Ohta 等人通过液相色谱和串联质谱鉴定与 PCNA 相互作用的蛋白质,然后对 HeLa 细胞 cDNA 文库进行 PCR(2002) 克隆了 CHTF18,他们将其称为 CHL12。

Merkle 等人通过在人类数据库中搜索与酿酒酵母 Ctf18 相似的序列(2003) 鉴定出人类 CHTF18。推导的蛋白质的计算分子量为 110 kD。它具有 N 端核定位信号,随后是富含脯氨酸的结构域、具有 NTP 结合基序的 NTPase 结构域、中央 RFC 保守结构域、锚蛋白(参见 106410)重复结构域和 2 个 C 端亮氨酸拉链基序。在S期同步T24膀胱癌细胞中CHTF18和DCC1的表达增加。免疫组织化学分析显示,CHTF18、CHTF8 和 DCC1 以弥漫性方式定位于核异染色质,并且在核仁中含量较少。SDS/PAGE分析检测到CHTF18的表观分子量约为110 kD。

贝尔穆德斯等人(2003) 确定 CHTF18 蛋白含有 975 个氨基酸,计算分子量为 107 kD。

▼ 基因功能

Ohta 等人(2002) 发现人类 CHL12 是与固定化重组 PCNA 相互作用的 20 多种核蛋白和细胞质蛋白之一。亲和层析、共表达和免疫沉淀分析表明,CHL12 不直接与 PCNA 相互作用,而是与 RFC2(600404)、RFC3(600405)、RFC4(102577) 和 RFC5(600407) 形成五聚体复合物,并且该复合物与 PCNA 结合。

通过免疫共沉淀分析,Merkle 等人(2003) 发现 CHTF18、CHTF8 和 DCC1 彼此关联并与 RFC3(p38) 亚基关联,表明这些蛋白质可能作为钳装载复合物发挥作用。CHTF18、CHTF8 和 DCC1 也选择性结合 PCNA。

Bermudez 等人通过免疫沉淀与人类 293T 细胞中带有表位标记的 CTF18 相关的蛋白质(2003)确定CTF18是7亚基内聚-RFC复合物的组成部分,他们将其称为CTF18-RFC。该复合物还包含化学计量的 DCC1、CTF8(CHTF8) 和 RFC2-5 亚基。这 7 个亚基还组装成 CTF18、RFC2-5 和 DCC1-CTF8 二聚体的 5 亚基复合物。体外翻译组件的组装表明,CTF8 结合 5 亚基复合物中的 CTF18,而不是单独的 CTF18,并且 DCC1 的添加稳定了完整的 7 亚基 CTF18-RFC 复合物。5 和 7 亚基 CTF18-RFC 复合物均表现出较弱的 DNA 依赖性 ATP 酶活性,该活性受到引物单链 DNA 的刺激。ssDNA 依赖性 ATP 酶活性的最大刺激需要添加 RPA(参见 179837)和 PCNA。7 亚基和 5 亚基 CTF18-RFC 复合物均将 PCNA 加载到引物和带缺口的环状 DNA 上,但不加载到单链环状 DNA 或单切口环状 DNA 上。CTF18-RFC 还释放了 PCNA,并以 ATP 依赖性方式预加载到 DNA 上。两种 CTF18-RFC 复合物均支持 PCNA 依赖性 DNA 聚合酶 δ(参见 174761)催化的单引物 DNA 延伸。CTF18 亚基还显示出与粘连蛋白亚基 SMC1(参见 300040)和 SCC1(RAD21;606462)的弱相互作用。贝尔穆德斯等人(2003) 得出的结论是,CTF18-RFC 复合体起到 PCNA 钳加载器的作用,并且可能将姐妹染色单体的内聚力与 DNA 复制联系起来。CTF18-RFC 还释放了 PCNA,并以 ATP 依赖性方式预加载到 DNA 上。两种 CTF18-RFC 复合物均支持 PCNA 依赖性 DNA 聚合酶 δ(参见 174761)催化的单引物 DNA 延伸。CTF18 亚基还显示出与粘连蛋白亚基 SMC1(参见 300040)和 SCC1(RAD21;606462)的弱相互作用。贝尔穆德斯等人(2003) 得出的结论是,CTF18-RFC 复合体起到 PCNA 钳加载器的作用,并且可能将姐妹染色单体的内聚力与 DNA 复制联系起来。CTF18-RFC 还释放了 PCNA,并以 ATP 依赖性方式预加载到 DNA 上。两种 CTF18-RFC 复合物均支持 PCNA 依赖性 DNA 聚合酶 δ(参见 174761)催化的单引物 DNA 延伸。CTF18 亚基还显示出与粘连蛋白亚基 SMC1(参见 300040)和 SCC1(RAD21;606462)的弱相互作用。贝尔穆德斯等人(2003) 得出的结论是,CTF18-RFC 复合体起到 PCNA 钳加载器的作用,并且可能将姐妹染色单体的内聚力与 DNA 复制联系起来。

通过单分子分析,Terret 等人(2009) 证明 RFC-CTF18 夹钳加载器控制人类细胞中复制叉的速度间隔和重新启动活动,并且是粘连蛋白 SMC3 亚基(606062) 的稳健乙酰化和姐妹染色单体凝聚所必需的。出乎意料的是,特雷特等人(2009) 发现粘连蛋白乙酰化本身是叉持续性的核心决定因素,因为在缺乏 Eco1 相关乙酰转移酶 ESCO1(609674) 或 ESCO2(609353) 的细胞中发现了缓慢移动的复制叉(包括源自 Roberts 综合征(268300) 患者的细胞,其中 ESCO2 是双等位基因突变的),以及在表达无法被复制的 SMC3 形式的细胞中。乙酰化。这种缺陷是粘连蛋白与 2 个调节辅助因子超稳定相互作用的结果,WAPL(610754) 和 PDS5A(613200);去除任一辅因子都可以在没有 ESCO1、ESCO2 或 RFC-CTF18 的情况下使分叉快速进展。特雷特等人(2009) 得出的结论是,他们的结果显示了一种钳加载器依赖性叉进展的新机制,该机制是由粘连蛋白环的翻译后修饰和结构重塑介导的。这种调节机制的丧失会导致 DNA 损伤的自发累积,并可能导致罗伯茨综合征粘连病的异常。

▼ Mapping

Hartz(2009) 根据 CHTF18 序列(GenBank BC006437) 与基因组序列(GRCh37) 的比对,将 CHTF18 基因对应到染色体 16p13.3。