RHO GTP 酶激活蛋白 26; ARHGAP26

  • 与粘着斑激酶相关的 GTP 酶调节剂;GRAF
  • KIAA0621

此条目中代表的其他实体:

  • 包含 GRAF/MLL 融合基因

HGNC 批准的基因符号:ARHGAP26

细胞遗传学位置:5q31.3 基因组坐标(GRCh38):5:142,770,369-143,229,010(来自 NCBI)

▼ 克隆和表达

Borkhardt 等人(2000) 指出,急性白血病中涉及 11q23 的相互易位已被证明显示出混合谱系白血病(MLL; 159555) 基因和各种不同伙伴基因之间的融合,总共 23 个。在患有幼年粒单核细胞白血病(JMML; 607785) 的婴儿中检测到独特的 t(5;11)(q31;q23) 和MLL 基因重排提供了克隆另一个 MLL 融合伴侣基因的机会。通过克隆这种易位中的断点,Borkhardt 等人(2000) 发现了 GTP 酶激活蛋白(GAP) 家族的一个成员,他们将其鉴定为禽类 GRAF 基因的人类同源物(Hildebrand 等,1996)。

石川等人(1998) 从人脑 cDNA 文库中克隆了 GRAF cDNA,并将其命名为 KIAA0621,发现它编码推导的 753 个氨基酸的蛋白质,分子量为 87 kD。

▼ 基因功能

Hildebrand 等人(1996) 确定 GRAF 基因与 BCR 基因(151410) 高度同源,BCR 基因也参与白血病相关易位。禽类 GRAF 蛋白以 SH3 结构域依赖性方式与 pp125(FAK) 的 C 端结构域结合,并刺激 GTP 结合蛋白 RhoA 的 GTPase 活性,pp125(FAK) 是酪氨酸激酶之一,预计是整联蛋白信号转导途径的关键组成部分。因此,GRAF 充当 RhoA 的负调节因子。

Shibata 等人使用酵母 2-杂交分析、体外结合测定和免疫沉淀分析(2001) 表明 PKN-β(PKN3; 610714) 与 GRAF 和 GRAF2(ARHGAP10; 609746) 相互作用。PKN-β 磷酸化重组 GRAF 和 GRAF2 的组成型活性形式。突变分析表明 PKN-β 的接头区域与 GRAF 和 GRAF2 的 SH3 结构域结合。

▼ 测绘

Ishikawa 等人。Borkhardt 等(1998) 将 GRAF 基因对应到 5 号染色体(2000) 发现 GRAF 基因位于 5q31 区域之外,该区域在血液恶性肿瘤中通常被删除;然而,至少在某些情况下两个等位基因的失活表明 GRAF 基因的缺失和突变可能有助于 del(5q) 血液疾病的发生和进展。作者:FISH,Borkhardt 等(2000) 确认了 GRAF 到 5q31 的分配。

▼ 分子遗传学

Borkhardt 等人(2000) 对 13 个血液恶性肿瘤病例的几个 cDNA 克隆进行了测序,其中 1 个 GRAF 等位基因被删除。在 1 名幼年型粒单核细胞白血病(JMML; 607785) 患者中,他们在第二个 GRAF 等位基因(605370.0001) 的 GAP 结构域内发现了点突变。在另外 2 名患者中,他们在 GRAF cDNA 中发现了 52 或 74 bp 的插入,这产生了读码移码,随后出现了提前终止密码子(605370.0002-605370.0003)。这些突变显然是体细胞事件。

▼ 等位基因变体(3 个选定示例):

.0001 白血病、幼年粒单核细胞、体细胞
ARHGAP26、ASN417SER
源自幼年粒单核细胞白血病患者的白血病细胞(JMML;607785),且 11q 上的 MLL 基因与 5q 上的 GRAF 基因融合,博克哈特等人(2000) 在另一个 GRAF 等位基因中,在核苷酸 1255 处鉴定出 A 到 G 的转变,导致氨基酸 417 处的天冬酰胺被丝氨酸取代。这被认为是白血病发生过程中的第二次打击。

.0002 白血病,幼年骨髓单核细胞,体细胞
ARHGAP26,52-BP INS
Borkhardt 等人在来自幼年型粒单核细胞白血病(JMML; 607785) 和涉及 GRAF 和 MLL 基因的相互易位 t(5;11)(q31;q23) 患者的白血病细胞中(2000)发现GRAF基因的另一个等位基因在外显子12和13的剪接处携带52bp的插入。外显子/内含子边界位于核苷酸1290/91处。插入导致阅读移码,从而产生终止密码子。预测的截短 GRAF 蛋白几乎缺少整个 GAP 结构域,因此很可能不起作用。52 bp 插入(核苷酸 32560-32611)源自位于相邻近 13 kb 长内含子的 3 引物剪接位点上游的 524 bp 长序列。因为插入嵌入在完美的剪接供体和受体位点中,所以它被认为是异常剪接的结果。

.0003 白血病、幼年粒单核细胞、体细胞
ARHGAP26、74-BP INS
在幼年粒单核细胞白血病患者的白血病细胞中(JMML; 607785) 和 at(5;11)(q31;q23),涉及 MLL 的 N 末端部分和 GRAF 基因的 C 末端部分,Borkhardt 等等人(2000) 发现另一条 5 号染色体上的 GRAF 等位基因在外显子 15 和 16 之间的 60 kb 长内含子中携带 74 bp 的插入。该插入可能产生终止密码子。预测的蛋白质缺乏 GRAF 的 SH3 结构域,该结构域被证明是与粘着斑激酶相互作用所必需的。