PAXIP1 相关的富含谷氨酸蛋白 1; PAGR1

  • PTIP 相关蛋白 1; PA1
  • 16 号染色体开放解读码组 53; C16ORF53

HGNC 批准的基因符号:PAGR1

细胞遗传学定位:16p11.2 基因组坐标(GRCh38):16:29,816,151-29,822,488(来自 NCBI)

▼ 说明

PAGR1 是 Set1 样多蛋白组蛋白甲基转移酶复合物的一个组成部分(Cho et al., 2007)。

▼ 克隆与表达

Cho 等人通过在表达小鼠 Ptip 的 HeLa 细胞系中亲和纯化 PTIP(PAXIP1; 608254) 相关蛋白,然后进行质谱分析(2007) 鉴定出了 PAGR1,他们将其命名为 PA1。 预测的 254 个氨基酸蛋白质与小鼠直系同源物具有 87% 的序列同一性。 当 PA1 在 HeLa 细胞中异位表达时,定位于细胞核。

▼ 基因功能

Cho 等人使用质谱和蛋白质纯化(2007) 鉴定 PA1 是 PTIP 相关蛋白更大复合体的一部分,包括 ASH2L(604782)、RBBP5(600697)、WDR5(609012)、NCOA6(605299)、MLL3(606833)、MLL4(606834) 和 DPY30(612032)。 该蛋白质复合物是一种类似 Set1 的组蛋白甲基转移酶复合物,具有组蛋白 H3 赖氨酸 4(H3K4) 甲基转移酶活性。 GST 下拉分析表明 PA1 直接与 PTIP 相互作用,但不与 ASH2L、RBBP5、WDR5 或 NCOA6 相互作用。 PA1 需要 PTIP 才能与复合体的其余部分相互作用。

▼ 测绘

Gross(2014) 根据 PAGR1 序列(GenBank BC003640) 与基因组序列(GRCh37) 的比对,将 PAGR1 基因定位到染色体 16p11.2。