肝细胞癌上调的长非编码RNA； HULC

• 在肝癌中高度上调
• 长非编码RNA HULC
• lncRNA HULC

HGNC 批准的基因符号：HULC

细胞遗传学定位：6p24.3 基因组坐标（GRCh38）：6:8,652,208-8,653,845（来自 NCBI）

▼ 克隆与表达

Panzitt 等人使用肝细胞癌（HCC; 114550） 特异性 cDNA 微阵列平台（2007） 鉴定了 HULC，一种新型 mRNA 样非编码 RNA（ncRNA）。 Northern 印迹分析检测到主要存在于 HCC 患者组织中的约 500 个核苷酸的转录物。 HULC RNA 定位于细胞质并与核糖体共纯化。 文字记录似乎没有翻译。 潘齐特等人（2007） 在几种灵长类动物中鉴定出了 HULC 直系同源物，但在小鼠或大鼠中没有发现。

Li 等人使用 Northern blot 分析（2021） 发现 HULC 在正常人肝脏中特异性表达。

▼ 基因结构

潘齐特等人（2007）确定HULC基因含有2个外显子，这两个外显子都具有高CpG含量。 外显子 1 主要由长末端重复组成，表明存在逆转录转座子的整合。

▼ 测绘

通过基因组序列分析，Panzitt 等人（2007） 将 HULC 基因定位到染色体 6p24.3。

▼ 基因功能

Panzitt 等人使用定量 RT-PCR（2007） 在 HCC 肝组织和 HCC 患者 4 份血液样本中的 3 份中检测到 HULC RNA 显着升高。 与正常组织相比，在非肿瘤性局灶性结节性增生和肝硬化肝组织中，HULC 也上调，但程度较小。 在 2 种人类 HCC 细胞系中敲低 HULC 导致许多基因的表达发生改变，表明 HULC 可能是一种非编码调节 RNA。 潘齐特等人（2007） 发现 HULC 与其假定的靶序列之间没有显着的同源性，这表明任何调节作用可能是间接的。

李等人（2021） 在小鼠和人类中鉴定出与苯丙氨酸羟化酶（PAH; 612349） 相互作用的 lncRNA，这种突变会导致苯丙酮尿症（PKU; 261600）。 与胚胎肝脏相比，小鼠 lncRNA Pair（PAH 激活 lincRNA）是成年肝脏中表达最上调的 lncRNA 之一。 Pair -/- 小鼠表现出色素沉着不足、生长迟缓和血清苯丙氨酸升高，但 Pah 及其辅因子四氢生物蝶呤（BH4） 水平正常。 突变小鼠在约 8 至 10 个月大时还会出现癫痫发作、大脑体积缩小、酪氨酸羟化酶（TH; 191290） 降低，同时酪氨酸减少。 Pull-down 实验表明 Pair 与 Pah 形成复合物。 作者发现 PAH 也与人类 HULC 有关。 晶体结构分析表明，HULC的核苷酸184至216区域与PAH的氨基酸thr63和his64形成氢键。 他们提出 lncRNA 可以稳定 PAH 和 phe 的相互作用。 将 HULC 模拟物引入 PKU 患者的 PAH 突变细胞中，增加了 17 个 PAH 突变体中的 11 个将 phe 转化为 tyr 的 PAH 活性，包括最常见的 PAH 突变，表明 HULC 模拟物可能提供可能的治疗作用。 李等人（2021） 指出，小鼠和人类 lncRNA 之间的低保守性阻碍了与人类疾病有关的 lncRNA 的发现。 他们指出，人类 HULC 和小鼠 Pair 均在其 N 端调节域与 PAH 相关，并且 HULC 可以挽救 Pair 缺陷细胞中的 Pah 活性，反之亦然。