裂解和聚腺苷酸化特异性因子 6; CPSF6

  • 前体 mRNA 切割因子 Im,68-KD 亚基; CIM68

HGNC 批准的基因符号:CPSF6

细胞遗传学位置:12q15 基因组坐标(GRCh38):12:69,239,567-69,274,357(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

大多数真核生物 mRNA 初级转录物在输出到细胞质之前都会在内部和细胞核末端进行加工。 修饰包括通过核酸内切裂解产生新的 3-prime 末端,然后对上游裂解产物进行聚腺苷酸化。 裂解因子(CF) Im 和 IIm 是发生裂解和聚腺苷酸化所必需的,它们参与 3-prime 加工的第一步。 已显示 25(604978)、59 和 68 kD 的三种主要多肽以及 72 kD 的较低丰度多肽与 CF Im(CFIM) 活性共纯化。 鲁格塞格等人(1998)纯化了CFIM并从25-和68-kD亚基中获得了肽序列。 通过搜索具有 68-kD 亚基肽序列的序列数据库,他们鉴定了编码 68-kD 亚基的 cDNA。 推导的 551 个氨基酸的 68 kD 亚基包含 3 个不同的结构域:核糖核蛋白(RNP) 类型的 N 端 RNA 结合结构域、富含脯氨酸的中间部分和 C 端交替电荷结构域,后者几乎完全由与谷氨酸和天冬氨酸残基交替的精氨酸残基和几个丝氨酸/精氨酸二肽组成。 该结构域组织强烈让人想起参与前 mRNA 剪接的 SR 蛋白和 SR 蛋白相关多肽中发现的结构域组织。 鲁格塞格等人(1998)证明CFIM活性可以仅从25-和68-kD多肽在体外重建。 多项证据表明 CFIM 至少以 2 种不同的形式存在。 切割反应动力学分析表明,CFIM 与 RNA 的相互作用是 3-prime 末端加工复合物组装的最早步骤之一,并促进其他加工因子的募集。

▼ 基因结构

拉赛亚等人(2013) 表明,HIV-1 衣壳突变体 N74D 和 P90A 分别因与辅因子(CPSF6) 和亲环蛋白(NUP358, 601181 和 CYPA, 123840) 的相互作用而受损,无法在原代人单核细胞衍生的巨噬细胞中复制,因为它们触发先天传感器,导致 NFKB(参见 164011) 和 IRF3(6037) 的核易位34),产生可溶性I型干扰素,并诱导抗病毒状态。 CPSF6 的缺失和短发夹 RNA 的表达使得野生型病毒能够触发先天传感器和 IFN 的产生。 在每种情况下,抑制的复制都通过干扰素受体阻断来挽救,这证明了干扰素在限制中的作用。 IFN 的产生依赖于病毒逆转录而不是整合,这表明病毒逆转录产物包含 HIV-1 病原体相关分子模式。 最后,Rasaiyaah 等人(2013) 证明他们可以使用非免疫抑制性环孢菌素类似物通过药理学诱导野生型 HIV-1 感染,以刺激 IFN 分泌和抗病毒状态。 作者得出的结论是,HIV-1 已经进化到使用 CPSF6 和亲环蛋白来掩盖其复制,从而能够逃避先天免疫传感器并在原代人类巨噬细胞中诱导细胞自主先天免疫反应。