HIF1A 反义 RNA 1; HIF1AAS1

  • 反义 HIF1-α,5-素
  • AHIF1A,5-PRIME

HGNC 批准的基因符号:HIF1A-AS1

细胞遗传学位置:14q23.2 基因组坐标(GRCh38):14:61,681,040-61,695,822(来自 NCBI)

▼ 说明

长非编码 RNA,例如 HIF1AAS1,参与多种过程,包括染色质修饰、转录调节、RNA 结合蛋白的募集以及 mRNA 成熟的调节(Bertozzi et al., 2011)。

▼ 克隆与表达

巴拉内罗等人(2010) 克隆了人类 HIF1AAS1,他们将其称为 5-prime AHIF1A。 HIF1AAS1 与 HIF1A 基因(603348) 的外显子 1 和内含子 1 互补,并且是非编码的。 Northern 印迹分析在 HCT116 结肠癌细胞中检测到 10 至 12 kb HIF1AAS1 转录本。

贝尔托齐等人(2011) 确定 HIF1AAS1 是聚腺苷酸化的并且具有 5 素帽结构。 RNA FISH 显示 HIF1A mRNA 和 HIF1AAS1 在人类细胞的核周区域聚集。 HIF1AAS1 与核膜蛋白 NUP62(605815) 共定位。

▼ 基因功能

巴拉内罗等人(2010) 表明抗癌剂喜树碱可抑制 DNA 拓扑异构酶 I(TOP1; 126420),增加反义转录物 5-prime AHIF1A 和 3-prime AHIF1A(HIF1AAS2; 614529) 的表达,并减少人类细胞系中初级 HIF1A 转录物的表达。 在缺氧和常氧条件下均检测到 5-prime AHIF1A 的表达。

贝尔托齐等人(2011) 发现喜树碱对 5-prime AHIF1A 和 3-prime AHIF1A 表达的影响是细胞系特异性的,因为在 HeLa 细胞中,喜树碱处理后只有 5-prime AHIF1A 上调。 定性 RT-PCR 检测到肾癌中 5-prime AHIF1A 和 3-prime AHIF1A 的上调。

▼ 测绘

巴拉内罗等人(2010) 确定 HIF1AAS1 基因位于相反的方向,并与染色体 14q23.2 上 HIF1A 基因的 5 素区重叠。