含有 COMM 结构域的蛋白质 9; COMMD9

  • 铜代谢 MURR1 域包含蛋白 9

HGNC 批准的基因符号:COMMD9

细胞遗传学位置:11p13 基因组坐标(GRCh38):11:36,272,291-36,289,427(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

Gawin 等人通过在 11 号染色体区域寻找与 WAGR 综合征(194072) 相关的基因,(1999) 鉴定并克隆了 COMMD9,他们将其命名为克隆 41188。Northern 印迹分析检测到在所有检查的人体组织中 1.5 kb 转录物的强表达。 在小鼠中,在所有成年组织和所检查的所有胚胎阶段都有很强的表达。

Burstein 等人通过数据库分析来鉴定与 MURR1(COMMD1; 607238) 相似的蛋白质,然后进行 PCR 扩增(2005) 克隆 COMMD9。 推导的蛋白质具有富含亮氨酸的 C 端铜代谢 MURR1(COMM) 结构域,预计会形成 β 片层。 数据库分析显示 COMMD3 在所有 13 个人体组织中表达,其中睾丸、胸腺和肺中表达最高,子宫、前列腺、卵巢和皮肤中表达最低。

▼ 基因功能

通过免疫共沉淀分析,Burstein 等人(2005) 发现 COMMD9 与 HEK293 细胞的内源性 COMMD1 相互作用。 COMMD9 强烈抑制 TNF(191160) 介导的 NF-kappa-B 激活(参见 NFKB1, 164011)。 蛋白质下拉分析显示 COMMD9 与 NF-kappa-B 亚基 RELB(604758) 和 p105(NFKB1) 相关,但与 RELA、p100(NFKB2; 164012) 或 CREL(REL; 164910) 无关。

Starokadomskyy 等人通过对用 COMMD1、COMMD9 和 COMMD10(616704) 亲和纯化的蛋白质进行质谱分析(2013) 确定了 CCDC22(300859)。 相互免疫沉淀和蛋白质下拉分析表明,CCDC22 与所检查的所有 10 个 COMM 结构域蛋白相互作用。 COMMD9 与 COMMD10、COMMD5(608216) 和 COMMD6(612377) 交互。 在与 滞蛋白 的蛋白质复合物中也检测到了 CCDC22 和 COMM 结构域蛋白(参见 CUL1,603134),其充当靶蛋白泛素化的连接酶。

▼ 测绘

Gawin 等人通过分析覆盖染色体 11p14.1-p13 的 PAC 重叠群(1999) 将 COMMD9 基因对应到染色体 11p13,着丝粒对应到 FJX1 基因(612206),端粒对应到 TRAF6 基因(602355)。