核糖醇木糖基转移酶1; RXYLT1

  • 跨膜蛋白 5;TMEM5

HGNC 批准的基因符号:RXYLT1

细胞遗传学位置:12q14.2 基因组坐标(GRCh38):12:63,779,909-63,809,562(来自 NCBI)

▼ 说明

TMEM5 基因编码一种跨膜蛋白,据信具有糖基转移酶功能(Vuillaumier-Barrot 等人总结,2012)。

▼ 克隆与表达

横山-小林等人(1995)基于检测与具有纤溶活性的尿激酶纤溶酶原激活蛋白融合的分泌蛋白,开发了一种检测N末端分泌信号序列的系统,称为纤维蛋白片法。横山-小林等人(1999)采用该系统来鉴定编码II型信号锚的cDNA,其中N端信号序列未被切割并保留在膜中,面向细胞质。他们从佛波酯刺激的 U937 单核细胞 cDNA 文库中分离出了编码 TMEM5 的 cDNA,并将其命名为 HP10481。TMEM5 预计编码 443 个氨基酸的 II 型跨膜蛋白。

Vuillaumier-Barrot 等人(2012) 指出 TMEM5 包含一个包含氨基酸 218-353 的结构域,该结构域与外骨蛋白(EXT1; 608177) 有一些相似之处,外骨蛋白是一种糖基转移酶。

▼ 测绘

Amberger(2008) 根据 TMEM5 序列(GenBank AB015633) 与基因组序列的比对,将 TMEM5 基因定位到染色体 12q14.2。

▼ 分子遗传学

Vuillaumier-Barrot 等人在 9 名患有严重鹅卵石无脑畸形的胎儿中,与 A10 型肌营养不良-肌营养不良症(MDDGA10;615041) 一致(2012) 鉴定了 TMEM5 基因中的 5 个不同突变(605862.0001-605862.0005)。所有突变均处于纯合或复合杂合状态,符合常染色体隐性遗传。第一个突变是通过纯合性作图结合近亲家族的外显子组测序来鉴定的。没有进行功能研究。在 58 个患有鹅卵石无脑畸形的家庭中,有 5 个(9%)发现了 TMEM5 突变,这些家庭中发现了遗传缺陷。

Jae 等人(2013) 在 2 个不相关的 MDDGA10 近亲家庭的受影响成员中发现了 TMEM5 基因的纯合突变。在第 43 个家庭中,一名 22 个月大时死亡的男孩患有无义突变(R340X;605862.0006);在56号家庭中,2个姐妹,年龄分别为19岁和21,患有移码突变(605862.0007)。

▼ 等位基因变异体(7 个精选示例):

.0001 肌营养不良-肌营养不良症(先天性脑部和眼睛异常),A 型,10
RXYLT1,1-BP DEL,795G

Vuillaumier-Barrot 等人在患有先天性肌营养不良-肌营养不良症并伴有 A10 型脑部和眼部异常的近亲家庭的 4 个受影响胎儿中(MDDGA10;615041)(2012) 在 TMEM5 基因的外显子 5 中发现了纯合 1-bp 缺失(795delG),导致移码和提前终止(Arg266GlyfsTer8)。每个未受影响的亲本都是该突变的杂合子。该突变是通过纯合性作图和外显子组测序发现的,但在几个大型数据库中并未发现。

.0002 肌营养不良-肌营养不良症(先天性脑部和眼睛异常),A 型,10
RXYLT1,TYR339CYS

Vuillaumier-Barrot 等人在 2 名患有先天性肌营养不良症-肌营养不良症并伴有脑部和眼部异常的 A10 型胎儿(MDDGA10;615041)中进行了研究(2012) 鉴定了 TMEM5 基因外显子 6 中的纯合 1016A-G 转换,导致高度保守残基处的 tyr339 至 cys(Y339C) 取代。另一个患有该疾病的无关胎儿是 Y339C 复合杂合子,外显子 6 中存在 28 bp 缺失(1064_1091del; 605862.0004),导致移码和提前终止(Asp355ValfsTer33)。

.0003 肌营养不良-肌营养不良症(先天性脑部和眼睛异常),A 型,10
RXYLT1,ARG340LEU

Vuillaumier-Barrot 等人在患有先天性肌营养不良-肌营养不良症并伴有 A10 型脑部和眼部异常(MDDGA10; 615041) 的胎儿中(2012) 鉴定了 TMEM5 基因中 2 个突变的复合杂合性:外显子 6 中的 2-bp del/ins(1019_1020delinsTT),导致高度保守残基处的 arg340 到 leu(R340L) 取代,以及外显子 6 中的 28-bp 缺失(1064_1091;605862.0004),导致移码和提前终止(Asp355ValfsTer33)。

.0004 肌营养不良-肌营养不良症(先天性脑部和眼睛异常),A 型,10
RXYLT1,28-BP DEL,NT1064

Vuillaumier-Barrot 等人讨论了 TMEM5 基因中的 28 bp 缺失(1064_1091del),该缺失在患有先天性肌营养不良-肌营养不良症并伴有 A10 型脑和眼异常(MDDGA10; 615041) 的胎儿中以复合杂合状态发现(2012),参见 605862.0002 和 605862.0003。

.0005 肌营养不良-肌营养不良症(先天性脑部和眼睛异常),A 型,10
RXYLT1,1-BP DEL,279A

Vuillaumier-Barrot 等人在患有先天性肌营养不良-肌营养不良症并伴有 A10 型脑部和眼部异常(MDDGA10; 615041) 的胎儿中(2012) 在 TMEM5 基因的外显子 2 中发现了纯合 1-bp 缺失(279delA),导致移码和提前终止(Gly94GlufsTer33)。

.0006 肌营养不良-肌营养不良症(先天性脑部和眼睛异常),A 型,10
RXYLT1,ARG340TER

Jae 等人发现,一名患有先天性肌营养不良-肌营养不良症并伴有 A10 型脑部和眼部异常(MDDGA10;615041)的新生儿男性在 22 个月大时死亡(2013) 鉴定了 TMEM5 基因中的 1018C-T 转变,导致 arg340 到 ter(R340X) 的取代。父母(43号家庭)是远房表兄弟姐妹。

.0007 肌营养不良-肌营养不良症(先天性脑部和眼睛异常),A 型,10
RXYLT1,1-BP DEL,139G

Jae 等人在 2 名患有先天性肌营养不良症 - 肌营养不良症并伴有脑部和眼部异常 A10 型(MDDGA10;615041)的姐妹中(2013) 在 TMEM5 基因中发现了 1 个 bp 缺失(139delG),导致移码(Ala47ArgfsTer42)。两姐妹都患有严重的智力障碍和步态障碍,但都活到了 19 岁和 21 岁。父母(56 号家庭)是堂兄弟姐妹。