介导复合体亚基 27; MED27

TRAP/SMCC/PC2 子单元 p37; TRAP37
SP1 转录激活所需的辅因子,亚基 8; CRSP8
CRSP,34-KD 亚基; CRSP34

HGNC 批准的基因符号:MED27

细胞遗传学位置:9q34.13 基因组坐标(GRCh38):9:131,860,112-132,079,867(来自 NCBI)

▼ 说明

MED27 基因编码介导多蛋白复合物的一个亚基,该亚基参与转录调控(Meng 等人总结,2021)。

▼ 克隆与表达

基因转录需要识别 DNA 中转录增强子位点的因子。这些因子与共激活因子一起作用,指导 RNA 聚合酶 II 装置的转录起始(参见 POLR2A,180660)。 SP1(189906) 等增强子结合因子的转录激活需要与 TFIID 复合物相互作用(参见 TAF2A,313650)。为了确定其他潜在的 SP1 辅因子,Ryu 等人(1999) 开发了一种体外转录测定,由 TFIIA(GTF2A1; 600520)、RNA polII 和基础转录因子 GTF2B(189963)、GTF2E(189962)、GTF2F(189968) 和 GTF2H(189972) 组成,辅以 TFIID或待定(600075)。通过顺序色谱法,他们排除了 PC4(600503) 作为 SP1 辅因子,并鉴定了多亚基辅因子 CRSP(SP1 激活所需的辅因子),它与 TFIID 一起是 SP1 有效激活所必需的。 CRSP 表现为大约 700 kD 的单一复合物。柳等人(1999) 初步鉴定出 9 种多肽为 CRSP 亚基(另见 PPARBP, 604311)。利用微序列肽分析,他们克隆了编码 34 kD 蛋白质 CRSP8 的 CRSP cDNA,并将其命名为 CRSP34。

▼ 测绘

Stumpf(2021) 根据 MED27 序列(GenBank AF230382) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 MED27 基因对应到染色体 9q34.13。

▼ 分子遗传学

在来自 11 个不相关的不同种族家庭的 16 名患者中,患有伴有痉挛、白内障和小脑发育不全的神经发育障碍(NEDSCAC; 619286),Meng 等人(2021) 鉴定了 MED27 基因中的纯合或复合杂合突变(参见例如 605044.0001-605044.0007)。有 11 个独特突变,包括 3 个移码、1 个剪接位点和 7 个错义。变异发生在整个基因中;错义变异影响高度保守的残基。 7 个错义变体中有 6 个位于 C 端结构域。这些突变是通过外显子组测序发现并通过桑格测序证实的,在所有可获得遗传物质的家庭中与该疾病一起分离。它们在 gnomAD 数据库中要么不存在,要么出现频率较低。没有进行变异的功能研究和患者细胞的研究。

▼ 等位基因变异体(7 个精选示例):

.0001 伴有痉挛、白内障和小脑发育不全的神经发育障碍
MED27、PRO259LEU

在 2 名同胞中,父母为巴基斯坦近亲(家庭 11),患有神经发育障碍,伴有痉挛、白内障和小脑发育不全(NEDSCAC;619286),Meng 等人(2021) 在 MED27 基因的外显子 7 中鉴定出纯合 c.776C-T 转换(c.776C-T, NM_004269.3),导致保守残基处 pro259 到 leu(P259L) 取代。一名无血缘关系的西班牙裔 10 岁男孩(家族 1)为 P259L 复合杂合子,外显子 1 中存在 c.188T-G 颠换,导致保守残基处 val63 替换为 gly(V63G;605044.0002) 。这些突变是通过外显子组测序发现的,并通过桑格测序证实,与家族中的疾病分开。 P259L 不存在于 gnomAD 数据库中,而 V63G 被发现两次(245,554 个等位基因中的 2 个)。没有进行变异的功能研究和患者细胞的研究。

.0002 伴有痉挛、白内障和小脑发育不全的神经发育障碍
MED27、VAL63GLY

讨论 MED27 基因外显子 1 中的 c.188T-G 颠换(c.188T-G,NM_004269.3),导致 val63-to-gly(V63G) 取代,这是在复合杂合状态中发现的一位患有痉挛、白内障和小脑发育不全的神经发育障碍患者(NEDSCAC; 619286),作者:Meng 等人(2021),参见 605044.0001。

.0003 伴有痉挛、白内障和小脑发育不全的神经发育障碍
MED27、PRO280LEU

在来自 2 个不相关家庭(家庭 3 和家庭 9)的 3 名患有神经发育障碍(伴有痉挛、白内障和小脑发育不全)的患者中(NEDSCAC;619286),Meng 等人(2021) 在 MED27 基因的外显子 8 中鉴定出纯合 c.839C-T 转换(c.839C-T, NM_004269.3),导致保守残基处发生 pro280 到 leu(P280L) 的取代。另一个患有该疾病的无关男孩(家族 5)是 P280L 复合杂合子,并且 MED27 基因外显子 4 中存在 2 bp 缺失(c.565_566del),预计会导致移码和提前终止(Met189AlafsTer21;605044.0007)。这些突变是通过外显子组测序发现的,并通过桑格测序证实,与家族中的疾病分开。 P280L 变体在 gnomAD 数据库中发现频率较低(241,660 个等位基因中的 14 个)。 gnomAD 中不存在移码突变。没有进行变异的功能研究和患者细胞的研究。

.0004 伴有痉挛、白内障和小脑发育不全的神经发育障碍
MED27、GLY291SER

在科威特近亲父母(家庭 6)所生的 2 名成年姐妹中,她们患有伴有痉挛、白内障和小脑发育不全的神经发育障碍(NEDSCAC; 619286),鉴定出纯合 c.871G-A 转变(c.871G-A, NM_004269.3 ) 在 MED27 基因的外显子 8 中,导致保守残基处发生 gly291 至 Ser(G291S) 取代。另外两名患有该疾病的患者携带 G291S 变异,与另一个 MED27 突变呈复合杂合性。一个欧洲血统的男孩(家族 2)是 G291S 的复合杂合子,并且内含子 5(c.682-2A-G;605044.0006)中存在 A 到 G 的转变,预计会导致剪接缺陷,并且 2 个姐妹出生于不相关的阿尔及利亚父母(家族 8)在外显子 3 中携带 2 bp 缺失(c.392_393del;605044.0005),预计会导致第二个等位基因上的移码和提前终止(Gln131LeufsTer7)。这些突变是通过外显子组测序发现的,并通过桑格测序证实,与家族中的疾病分开。 G291S 变体在 gnomAD 数据库中发现频率较低(235,830 个等位基因中的 3 个)。在 gnomAD 数据库中发现了两次剪接位点突变(239,080 个等位基因中的 2 个),而移码突变在 gnomAD 中不存在。没有进行变异的功能研究和患者细胞的研究。

.0005 伴有痉挛、白内障和小脑发育不全的神经发育障碍
MED27、2-BP DEL、NT392

讨论 MED27 基因外显子 3 中的 2-bp 缺失(c.392_393del, NM_004269.3),导致移码和提前终止(Gln131LeufsTer7),该现象在患有神经发育障碍的患者中以复合杂合状态发现痉挛、白内障和小脑发育不全(NEDSCAC; 619286),作者:Meng 等人(2021),参见 605044.0004。

.0006 伴有痉挛、白内障和小脑发育不全的神经发育障碍
MED27、IVS5AS、A-G、-2

讨论 MED27 基因内含子 5 中的 A 到 G 转变(c.682-2A-G,NM_004269.3),预计会导致剪接改变,在患有以下疾病的患者中发现复合杂合状态伴有痉挛、白内障和小脑发育不全的神经发育障碍(NEDSCAC; 619286),作者:Meng 等人(2021),参见 605044.0004。

.0007 伴有痉挛、白内障和小脑发育不全的神经发育障碍
MED27、2-BP DEL、NT565

讨论 MED27 基因外显子 4 中的 2-bp 缺失(c.565_566del, NM_004269.3),导致移码和提前终止(Met189AlafsTer21),该现象在患有神经发育障碍的患者中以复合杂合状态被发现痉挛、白内障和小脑发育不全(NEDSCAC; 619286),作者:Meng 等人(2021),参见 605044.0003。