主要组织相容性复合体,Class 1,F

在单体6突变细胞系中主要组织相容性复合物的物理作图过程中,Ragoussis等人(1989)发现了一个新的I类基因,cda12,这是从HLA-A(不同142800),HLA-B(142830),HLA-C(142840),和HLA-E(143010)。它位于HLA-A的50 kb之内。Ragoussis等(1989)提出了HLA-F的名称。Geraghty等(1990)同样地分离并测序了HLA-F基因。

细胞遗传学位置:6p22.1
基因座标(GRCh38):6:29,723,433-29,740,354

Geraghty等(1992年)报道了酵母人工染色体(YAC)克隆的分离和表征,该克隆跨越超过1.2 Mb的连续区域,并包括18个I类特征序列中的14个。这些序列中的六个编码经典的移植抗原HLA-A,-B和-C,以及较少多态的HLA-E,-F和-G(142871)。在其余的12个序列中,有4个是全长假基因,有8个是缩写假基因,包括3个包含单个内含子/外显子片段。通过限制酶作图和使用基因座特异性探针,Geraghty等人(1992)对所有的I类基因和序列进行了排序,并将它们定位在该区域内。另外,确定了4个I类基因的转录方向。

▼ 测绘
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正如他们在6p21.3号染色体上绘制的人类MHC图谱所概述的那样,从着丝粒到端粒,I类区域的基因序列是EAHEJAHGF(Campbell和Trowsdale,1993年)。

根据对意大利北部14个无关家庭的联系研究,Gasparini等人(1993)得出的结论是,遗传性血色素沉着病基因座(HFE;235200)是HLA-F的着丝粒。一个特别有用的双重重组家族是这一结论的基础。Calandro等(1995年)使用来自HLA-F基因的3个引物末端的微卫星标记和来自HLA-F基因的5个引物末端的微卫星标记来研究HFE基因座相对于这些标记和其他标记的位置。他们得出的结论是,HFE基因座是HLA-F的端粒,而HLA-F是HLA-A的端粒。

▼ 基因功能
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Lunemann等人使用细胞培养系统,对具有人源化肝脏的小鼠以及来自丙型肝炎病毒(HCV)感染个体的原发性肝组织进行了研究(2018)显示HCV感染上调HLA-F表达。上调的HLA-F与KIR3DS1相互作用(请参见604946)并激活了自然杀伤细胞,从而导致了HCV复制的控制。

▼ 演变
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Shiina等人为了分析人类主要组织相容性复合物的起源的分子动力学(1999),检查了HLA I类区域的连续的1,796,938-bp序列,连接了MICB(602436)和HLA-F 之间的基因。在所分析的序列中识别出总共127个基因或潜在的编码序列,从而建立了高基因密度,每个序列14.1 kb。758个微卫星的鉴定为HLA I类相关疾病基因的高分辨率作图提供了工具。最重要的是,Shiina等(1999年)确定了重复的复制和随后多样化的最小构成要素导致了今天的MHC。当前不重要的HLA-F和MICE基因已成为当今具有免疫功能的HLA-ABC和MICA / B基因的祖细胞,这为“生与死”进化提供了实验证据,这与我们对进化力的理解大体相关推动脊椎动物多基因家族。似乎HLA-F是MHC-I的祖先基因,复制后会产生MICE和HLA-G。大量的物理证据证实了这一观点:系统进化树分析,HLA-G,MICE和HLA-F之间的短基因组距离,以及当今的MICE是“问题最少”的MIC假基因的事实(相比之下)到MICC,MICD和MICF,